Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G193200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P9Q6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043752 , Zm00025a044197
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G252700 protein of unknown function DUF1421 domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G162500 - -
3 Sobic.002G381100 expressed protein -
4 Sobic.002G031500 OsFBLD3 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G120700 decarboxylase, putative, expressed K01592: tyrosine decarboxylase
6 Sobic.005G110502 - -
7 Sobic.002G340200 expressed protein -
8 Sobic.004G238600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@starch synthase, putative, expressed K00703: starch synthase
9 Sobic.005G213100 - -
10 Sobic.003G402000 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
11 Sobic.004G267900 expressed protein K10756: replication factor C subunit 3/5
12 Sobic.004G018700 expressed protein -
13 Sobic.002G035300 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
14 Sobic.002G145000 DNA-directed RNA polymerase subunit, putative, expressed K03011: RPB3, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3
15 Sobic.003G359100 sedoheptulose-bisphosphatase(PubMedID : 26465154)@fructose-1,6-bisphosphatase, putative, expressed K01100: sedoheptulose-bisphosphatase
16 Sobic.010G022200 - -
17 Sobic.004G305800 expressed protein -
18 Sobic.004G268000 -(PubMedID : 26976818)@soluble inorganic pyrophosphatase, putative, expressed K01507: inorganic pyrophosphatase
19 Sobic.010G130300 OsMan07 - Endo-Beta-Mannanase, expressed K19355: mannan endo-1,4-beta-mannosidase
20 Sobic.001G070600 FAR1 family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G193200 Sobic009G193200 Sobic003G252700 Sobic003G252700 Sobic009G193200--Sobic003G252700 Sobic002G162500 Sobic002G162500 Sobic009G193200--Sobic002G162500 Sobic002G381100 Sobic002G381100 Sobic009G193200--Sobic002G381100 Sobic002G031500 Sobic002G031500 Sobic009G193200--Sobic002G031500 Sobic002G120700 Sobic002G120700 Sobic009G193200--Sobic002G120700 Sobic005G110502 Sobic005G110502 Sobic009G193200--Sobic005G110502 Sobic002G340200 Sobic002G340200 Sobic009G193200--Sobic002G340200 Sobic004G238600 Sobic004G238600 Sobic009G193200--Sobic004G238600 Sobic005G213100 Sobic005G213100 Sobic009G193200--Sobic005G213100 Sobic010G130300 Sobic010G130300 Sobic003G252700--Sobic010G130300 Sobic001G290600 Sobic001G290600 Sobic003G252700--Sobic001G290600 Sobic006G050000 Sobic006G050000 Sobic003G252700--Sobic006G050000 Sobic003G378400 Sobic003G378400 Sobic003G252700--Sobic003G378400 Sobic004G165000 Sobic004G165000 Sobic003G252700--Sobic004G165000 Sobic001G069600 Sobic001G069600 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