Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G106850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R9B0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G086500 STE_MEKK_ste11_MAP3K.16 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed -
2 Sobic.003G170900 - -
3 Sobic.001G300100 - -
4 Sobic.003G166750 - K15188: cyclin T
5 Sobic.004G238900 methyltransferase domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G001900 THION30 - Plant thionin family protein precursor, expressed -
7 Sobic.003G313500 MATH domain containing protein, expressed -
8 Sobic.009G165700 SAC3/GANP family protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G148750 - -
10 Sobic.006G280000 transportin-2, putative, expressed K18752: TNPO1, IPO2, transportin-1
11 Sobic.002G211800 AT-rich interaction region, putative, expressed -
12 Sobic.002G260900 protein kinase domain containing protein, expressed K13429: chitin elicitor receptor kinase 1
13 Sobic.004G263400 expressed protein -
14 Sobic.001G303100 expressed protein -
15 Sobic.001G111850 - -
16 Sobic.005G222100 - -
17 Sobic.001G451450 - -
18 Sobic.007G031900 OsFBX207 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.009G109200 phosphatidylinositol kinase, putative, expressed K07203: MTOR, FRAP, serine/threonine-protein kinase mTOR
20 Sobic.006G222300 MBTB7 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein


Gene co-expression network
sample Sobic007G106850 Sobic007G106850 Sobic006G086500 Sobic006G086500 Sobic007G106850--Sobic006G086500 Sobic003G170900 Sobic003G170900 Sobic007G106850--Sobic003G170900 Sobic001G300100 Sobic001G300100 Sobic007G106850--Sobic001G300100 Sobic003G166750 Sobic003G166750 Sobic007G106850--Sobic003G166750 Sobic004G238900 Sobic004G238900 Sobic007G106850--Sobic004G238900 Sobic001G001900 Sobic001G001900 Sobic007G106850--Sobic001G001900 Sobic003G313500 Sobic003G313500 Sobic007G106850--Sobic003G313500 Sobic009G165700 Sobic009G165700 Sobic007G106850--Sobic009G165700 Sobic002G148750 Sobic002G148750 Sobic007G106850--Sobic002G148750 Sobic001G191600 Sobic001G191600 Sobic006G086500--Sobic001G191600 Sobic010G013200 Sobic010G013200 Sobic006G086500--Sobic010G013200 Sobic002G294800 Sobic002G294800 Sobic006G086500--Sobic002G294800 Sobic001G268200 Sobic001G268200 Sobic006G086500--Sobic001G268200 Sobic008G172300 Sobic008G172300 Sobic006G086500--Sobic008G172300 Sobic003G221900 Sobic003G221900 Sobic006G086500--Sobic003G221900 Sobic003G340600 Sobic003G340600 Sobic006G086500--Sobic003G340600 Sobic004G181700 Sobic004G181700 Sobic006G086500--Sobic004G181700 Sobic001G389100 Sobic001G389100 Sobic006G086500--Sobic001G389100 Sobic003G170900--Sobic009G165700 Sobic010G123600 Sobic010G123600 Sobic003G170900--Sobic010G123600 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic003G170900--Sobic005G112300 Sobic010G206900 Sobic010G206900 Sobic003G170900--Sobic010G206900 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic003G170900--Sobic010G139000 Sobic003G422500 Sobic003G422500 Sobic003G170900--Sobic003G422500 Sobic003G170900--Sobic003G166750 Sobic010G247800 Sobic010G247800 Sobic003G170900--Sobic010G247800 Sobic001G194200 Sobic001G194200 Sobic003G170900--Sobic001G194200 Sobic001G300100--Sobic008G172300 Sobic007G110700 Sobic007G110700 Sobic001G300100--Sobic007G110700 Sobic010G100800 Sobic010G100800 Sobic001G300100--Sobic010G100800 Sobic002G339300 Sobic002G339300 Sobic001G300100--Sobic002G339300 Sobic002G404200 Sobic002G404200 Sobic001G300100--Sobic002G404200 Sobic009G193500 Sobic009G193500 Sobic001G300100--Sobic009G193500 Sobic010G086900 Sobic010G086900 Sobic001G300100--Sobic010G086900 Sobic001G261900 Sobic001G261900 Sobic001G300100--Sobic001G261900 Sobic004G262700 Sobic004G262700 Sobic001G300100--Sobic004G262700 Sobic003G166750--Sobic009G165700 Sobic008G001200 Sobic008G001200 Sobic003G166750--Sobic008G001200 Sobic009G256400 Sobic009G256400 Sobic003G166750--Sobic009G256400 Sobic001G370900 Sobic001G370900 Sobic003G166750--Sobic001G370900 Sobic001G289800 Sobic001G289800 Sobic003G166750--Sobic001G289800 Sobic002G316600 Sobic002G316600 Sobic003G166750--Sobic002G316600 Sobic003G166750--Sobic001G194200 Sobic001G527800 Sobic001G527800 Sobic003G166750--Sobic001G527800 Sobic001G457800 Sobic001G457800 Sobic003G166750--Sobic001G457800 Sobic003G067100 Sobic003G067100 Sobic004G238900--Sobic003G067100 Sobic005G014700 Sobic005G014700 Sobic004G238900--Sobic005G014700 Sobic004G359100 Sobic004G359100 Sobic004G238900--Sobic004G359100 Sobic001G102500 Sobic001G102500 Sobic004G238900--Sobic001G102500 Sobic002G343400 Sobic002G343400 Sobic004G238900--Sobic002G343400 Sobic003G369400 Sobic003G369400 Sobic004G238900--Sobic003G369400 Sobic007G023200 Sobic007G023200 Sobic004G238900--Sobic007G023200 Sobic010G255100 Sobic010G255100 Sobic004G238900--Sobic010G255100 Sobic004G163800 Sobic004G163800 Sobic004G238900--Sobic004G163800 Sobic001G001900--Sobic009G165700 Sobic001G474600 Sobic001G474600 Sobic001G001900--Sobic001G474600 Sobic001G001900--Sobic003G422500 Sobic001G001900--Sobic003G170900 Sobic001G451400 Sobic001G451400 Sobic001G001900--Sobic001G451400 Sobic004G182201 Sobic004G182201 Sobic001G001900--Sobic004G182201 Sobic001G154900 Sobic001G154900 Sobic001G001900--Sobic001G154900 Sobic003G362600 Sobic003G362600 Sobic001G001900--Sobic003G362600 Sobic004G091100 Sobic004G091100 Sobic001G001900--Sobic004G091100 Sobic009G191000 Sobic009G191000 Sobic003G313500--Sobic009G191000 Sobic003G313500--Sobic003G422500 Sobic002G411600 Sobic002G411600 Sobic003G313500--Sobic002G411600 Sobic001G540400 Sobic001G540400 Sobic003G313500--Sobic001G540400 Sobic004G034900 Sobic004G034900 Sobic003G313500--Sobic004G034900 Sobic001G289600 Sobic001G289600 Sobic003G313500--Sobic001G289600 Sobic009G053900 Sobic009G053900 Sobic003G313500--Sobic009G053900 Sobic002G008900 Sobic002G008900 Sobic003G313500--Sobic002G008900 Sobic001G365900 Sobic001G365900 Sobic003G313500--Sobic001G365900 Sobic009G165700--Sobic003G422500 Sobic009G165700--Sobic010G247800 Sobic009G165700--Sobic010G206900 Sobic009G165700--Sobic003G166750 Sobic008G087866 Sobic008G087866 Sobic009G165700--Sobic008G087866 Sobic009G165700--Sobic001G451400 Sobic009G165700--Sobic003G170900 Sobic001G534700 Sobic001G534700 Sobic009G165700--Sobic001G534700 Sobic009G165700--Sobic008G001200 Sobic009G002300 Sobic009G002300 Sobic002G148750--Sobic009G002300 Sobic003G217900 Sobic003G217900 Sobic002G148750--Sobic003G217900 Sobic003G155300 Sobic003G155300 Sobic002G148750--Sobic003G155300 Sobic009G129100 Sobic009G129100 Sobic002G148750--Sobic009G129100 Sobic003G217700 Sobic003G217700 Sobic002G148750--Sobic003G217700 Sobic009G132700 Sobic009G132700 Sobic002G148750--Sobic009G132700 Sobic007G159900 Sobic007G159900 Sobic002G148750--Sobic007G159900 Sobic010G140400 Sobic010G140400 Sobic002G148750--Sobic010G140400 Sobic007G136800 Sobic007G136800 Sobic002G148750--Sobic007G136800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.