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Transcriptome id Sobic.001G300100.1
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UniProt C5WSD7
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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1 Sobic.008G172300 peroxisome assembly protein, putative, expressed K06664: PEX2, peroxin-2
2 Sobic.007G110700 serine/threonine-protein kinase PRP4, putative, expressed K08827: serine/threonine-protein kinase PRP4
3 Sobic.010G100800 alpha-mannosidase 2, putative, expressed K01231: alpha-mannosidase II
4 Sobic.002G339300 myosin-Vb, putative, expressed K10357: myosin V
5 Sobic.002G404200 F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.009G193500 AGAP007115-PA, putative, expressed -
7 Sobic.010G086900 OsFBX187 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G261900 caffeine-induced death protein 1, putative, expressed -
9 Sobic.004G262700 - -
10 Sobic.005G222100 - -
11 Sobic.002G167500 expressed protein -
12 Sobic.007G065100 XRN 5\'-3\' exonuclease N-terminus domain containing protein, expressed K12619: XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2
13 Sobic.004G026500 expressed protein -
14 Sobic.001G275300 - K10899: ATP-dependent DNA helicase Q1
15 Sobic.001G529600 1,3-beta-glucan synthase component domain containing protein, expressed K11000: callose synthase
16 Sobic.001G191600 TMS membrane protein/tumour differentially expressed protein, putative, expressed -
17 Sobic.009G017400 "gsn1/LARGE8(Ortholog in rice:Gou et al., 2018(PubMedID : 31659915)@dual specificity protein phosphatase, putative, expressed -
18 Sobic.003G369400 expressed protein -
19 Sobic.010G109600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@angel, putative, expressed -
20 Sobic.004G034800 OsFBX440 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G300100 Sobic001G300100 Sobic008G172300 Sobic008G172300 Sobic001G300100--Sobic008G172300 Sobic007G110700 Sobic007G110700 Sobic001G300100--Sobic007G110700 Sobic010G100800 Sobic010G100800 Sobic001G300100--Sobic010G100800 Sobic002G339300 Sobic002G339300 Sobic001G300100--Sobic002G339300 Sobic002G404200 Sobic002G404200 Sobic001G300100--Sobic002G404200 Sobic009G193500 Sobic009G193500 Sobic001G300100--Sobic009G193500 Sobic010G086900 Sobic010G086900 Sobic001G300100--Sobic010G086900 Sobic001G261900 Sobic001G261900 Sobic001G300100--Sobic001G261900 Sobic004G262700 Sobic004G262700 Sobic001G300100--Sobic004G262700 Sobic004G026500 Sobic004G026500 Sobic008G172300--Sobic004G026500 Sobic009G014100 Sobic009G014100 Sobic008G172300--Sobic009G014100 Sobic003G340600 Sobic003G340600 Sobic008G172300--Sobic003G340600 Sobic002G345700 Sobic002G345700 Sobic008G172300--Sobic002G345700 Sobic001G124100 Sobic001G124100 Sobic008G172300--Sobic001G124100 Sobic010G197000 Sobic010G197000 Sobic008G172300--Sobic010G197000 Sobic005G142800 Sobic005G142800 Sobic008G172300--Sobic005G142800 Sobic002G168300 Sobic002G168300 Sobic008G172300--Sobic002G168300 Sobic002G167500 Sobic002G167500 Sobic008G172300--Sobic002G167500 Sobic005G222100 Sobic005G222100 Sobic007G110700--Sobic005G222100 Sobic007G110700--Sobic001G300100 Sobic003G217900 Sobic003G217900 Sobic007G110700--Sobic003G217900 Sobic003G398700 Sobic003G398700 Sobic007G110700--Sobic003G398700 Sobic007G159900 Sobic007G159900 Sobic007G110700--Sobic007G159900 Sobic010G021500 Sobic010G021500 Sobic007G110700--Sobic010G021500 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic007G110700--Sobic001G456900 Sobic003G168100 Sobic003G168100 Sobic007G110700--Sobic003G168100 Sobic005G008800 Sobic005G008800 Sobic007G110700--Sobic005G008800 Sobic001G501300 Sobic001G501300 Sobic010G100800--Sobic001G501300 Sobic010G100800--Sobic001G261900 Sobic005G026000 Sobic005G026000 Sobic010G100800--Sobic005G026000 Sobic010G100800--Sobic001G300100 Sobic010G100800--Sobic002G404200 Sobic010G100800--Sobic010G086900 Sobic002G031700 Sobic002G031700 Sobic010G100800--Sobic002G031700 Sobic001G275300 Sobic001G275300 Sobic010G100800--Sobic001G275300 Sobic003G193200 Sobic003G193200 Sobic010G100800--Sobic003G193200 Sobic002G339300--Sobic004G262700 Sobic002G339300--Sobic004G026500 Sobic002G339300--Sobic009G193500 Sobic002G339300--Sobic001G124100 Sobic001G396000 Sobic001G396000 Sobic002G339300--Sobic001G396000 Sobic002G339300--Sobic003G193200 Sobic003G190000 Sobic003G190000 Sobic002G339300--Sobic003G190000 Sobic002G168500 Sobic002G168500 Sobic002G339300--Sobic002G168500 Sobic002G339300--Sobic010G197000 Sobic002G404200--Sobic001G300100 Sobic002G142066 Sobic002G142066 Sobic002G404200--Sobic002G142066 Sobic002G404200--Sobic010G100800 Sobic007G029100 Sobic007G029100 Sobic002G404200--Sobic007G029100 Sobic008G193300 Sobic008G193300 Sobic002G404200--Sobic008G193300 Sobic002G404200--Sobic010G086900 Sobic001G341800 Sobic001G341800 Sobic002G404200--Sobic001G341800 Sobic001G279900 Sobic001G279900 Sobic002G404200--Sobic001G279900 Sobic009G004800 Sobic009G004800 Sobic002G404200--Sobic009G004800 Sobic009G193500--Sobic004G026500 Sobic009G193500--Sobic002G339300 Sobic002G276100 Sobic002G276100 Sobic009G193500--Sobic002G276100 Sobic009G193500--Sobic001G124100 Sobic007G103100 Sobic007G103100 Sobic009G193500--Sobic007G103100 Sobic009G193500--Sobic002G168500 Sobic009G193500--Sobic008G172300 Sobic001G219700 Sobic001G219700 Sobic009G193500--Sobic001G219700 Sobic006G186600 Sobic006G186600 Sobic009G193500--Sobic006G186600 Sobic001G249400 Sobic001G249400 Sobic010G086900--Sobic001G249400 Sobic009G046800 Sobic009G046800 Sobic010G086900--Sobic009G046800 Sobic010G086900--Sobic010G100800 Sobic002G378000 Sobic002G378000 Sobic010G086900--Sobic002G378000 Sobic010G086900--Sobic001G300100 Sobic004G003900 Sobic004G003900 Sobic010G086900--Sobic004G003900 Sobic010G086900--Sobic002G404200 Sobic008G067100 Sobic008G067100 Sobic010G086900--Sobic008G067100 Sobic004G019500 Sobic004G019500 Sobic010G086900--Sobic004G019500 Sobic001G261900--Sobic010G100800 Sobic007G212300 Sobic007G212300 Sobic001G261900--Sobic007G212300 Sobic004G107200 Sobic004G107200 Sobic001G261900--Sobic004G107200 Sobic004G176000 Sobic004G176000 Sobic001G261900--Sobic004G176000 Sobic006G119400 Sobic006G119400 Sobic001G261900--Sobic006G119400 Sobic008G132900 Sobic008G132900 Sobic001G261900--Sobic008G132900 Sobic004G351800 Sobic004G351800 Sobic001G261900--Sobic004G351800 Sobic007G000300 Sobic007G000300 Sobic001G261900--Sobic007G000300 Sobic007G065100 Sobic007G065100 Sobic001G261900--Sobic007G065100 Sobic004G262700--Sobic002G339300 Sobic004G262700--Sobic001G396000 Sobic004G262700--Sobic001G501300 Sobic004G262700--Sobic005G026000 Sobic004G262700--Sobic004G026500 Sobic004G262700--Sobic009G193500 Sobic004G262700--Sobic001G124100 Sobic004G262700--Sobic008G172300 Sobic004G262700--Sobic002G345700
Octagon: transcription factors


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