Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G171800.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W4K2
Pfam -
Panther DB PTHR31704 PTHR31704:SF25
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Wheat -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G032600 - -
2 Sobic.009G238600 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@protein phosphatase 2C, putative, expressed K14497: protein phosphatase 2C
3 Sobic.004G278700 microtubule-binding protein TANGLED1, putative, expressed K18636: microtubule-binding protein TANGLED1
4 Sobic.003G302300 - -
5 Sobic.006G223800 ZOS8-01 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
6 Sobic.006G219900 csAtPR5, putative, expressed -
7 Sobic.008G010900 DNA repair protein Rad51, putative, expressed K10872: meiotic recombination protein DMC1
8 Sobic.001G427900 ASC1, putative, expressed -
9 Sobic.004G098800 - -
10 Sobic.002G160100 expressed protein K14001: SIL1, nucleotide exchange factor SIL1
11 Sobic.007G032000 tryptophan synthase beta chain 1, putative, expressed K01696: tryptophan synthase beta chain
12 Sobic.008G013200 expressed protein -
13 Sobic.002G158300 ankyrin, putative, expressed -
14 Sobic.002G290100 expressed protein K08739: DNA mismatch repair protein MLH3
15 Sobic.001G226900 zinc finger family protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G392275 - -
17 Sobic.001G414100 expressed protein -
18 Sobic.001G490950 - -
19 Sobic.003G435400 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
20 Sobic.001G356100 GPI-anchored wall transfer protein 1, putative, expressed K05283: glucosaminylphosphatidylinositol acyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic002G171800 Sobic002G171800 Sobic004G032600 Sobic004G032600 Sobic002G171800--Sobic004G032600 Sobic009G238600 Sobic009G238600 Sobic002G171800--Sobic009G238600 Sobic004G278700 Sobic004G278700 Sobic002G171800--Sobic004G278700 Sobic003G302300 Sobic003G302300 Sobic002G171800--Sobic003G302300 Sobic006G223800 Sobic006G223800 Sobic002G171800--Sobic006G223800 Sobic006G219900 Sobic006G219900 Sobic002G171800--Sobic006G219900 Sobic008G010900 Sobic008G010900 Sobic002G171800--Sobic008G010900 Sobic001G427900 Sobic001G427900 Sobic002G171800--Sobic001G427900 Sobic004G098800 Sobic004G098800 Sobic002G171800--Sobic004G098800 Sobic001G490950 Sobic001G490950 Sobic004G032600--Sobic001G490950 Sobic004G032600--Sobic004G098800 Sobic001G226900 Sobic001G226900 Sobic004G032600--Sobic001G226900 Sobic003G392275 Sobic003G392275 Sobic004G032600--Sobic003G392275 Sobic002G102300 Sobic002G102300 Sobic004G032600--Sobic002G102300 Sobic010G006800 Sobic010G006800 Sobic004G032600--Sobic010G006800 Sobic004G032600--Sobic006G219900 Sobic002G368100 Sobic002G368100 Sobic004G032600--Sobic002G368100 Sobic003G141600 Sobic003G141600 Sobic004G032600--Sobic003G141600 Sobic009G238600--Sobic002G171800 Sobic003G224200 Sobic003G224200 Sobic009G238600--Sobic003G224200 Sobic009G238600--Sobic004G032600 Sobic006G067050 Sobic006G067050 Sobic009G238600--Sobic006G067050 Sobic006G017600 Sobic006G017600 Sobic009G238600--Sobic006G017600 Sobic009G238600--Sobic006G223800 Sobic003G035001 Sobic003G035001 Sobic009G238600--Sobic003G035001 Sobic006G119600 Sobic006G119600 Sobic009G238600--Sobic006G119600 Sobic002G037600 Sobic002G037600 Sobic009G238600--Sobic002G037600 Sobic004G278700--Sobic004G098800 Sobic001G414100 Sobic001G414100 Sobic004G278700--Sobic001G414100 Sobic003G385000 Sobic003G385000 Sobic004G278700--Sobic003G385000 Sobic004G278700--Sobic006G219900 Sobic008G041450 Sobic008G041450 Sobic004G278700--Sobic008G041450 Sobic004G278700--Sobic004G032600 Sobic006G199700 Sobic006G199700 Sobic004G278700--Sobic006G199700 Sobic004G178700 Sobic004G178700 Sobic004G278700--Sobic004G178700 Sobic004G278700--Sobic003G141600 Sobic007G032000 Sobic007G032000 Sobic003G302300--Sobic007G032000 Sobic003G404100 Sobic003G404100 Sobic003G302300--Sobic003G404100 Sobic008G013200 Sobic008G013200 Sobic003G302300--Sobic008G013200 Sobic001G114200 Sobic001G114200 Sobic003G302300--Sobic001G114200 Sobic009G186700 Sobic009G186700 Sobic003G302300--Sobic009G186700 Sobic001G356100 Sobic001G356100 Sobic003G302300--Sobic001G356100 Sobic003G377500 Sobic003G377500 Sobic003G302300--Sobic003G377500 Sobic003G308300 Sobic003G308300 Sobic003G302300--Sobic003G308300 Sobic001G025700 Sobic001G025700 Sobic003G302300--Sobic001G025700 Sobic006G223800--Sobic008G010900 Sobic006G223800--Sobic006G017600 Sobic002G014200 Sobic002G014200 Sobic006G223800--Sobic002G014200 Sobic005G110421 Sobic005G110421 Sobic006G223800--Sobic005G110421 Sobic002G019500 Sobic002G019500 Sobic006G223800--Sobic002G019500 Sobic002G019750 Sobic002G019750 Sobic006G223800--Sobic002G019750 Sobic008G155600 Sobic008G155600 Sobic006G223800--Sobic008G155600 Sobic010G093400 Sobic010G093400 Sobic006G223800--Sobic010G093400 Sobic001G112000 Sobic001G112000 Sobic006G223800--Sobic001G112000 Sobic004G186300 Sobic004G186300 Sobic006G219900--Sobic004G186300 Sobic006G219900--Sobic001G490950 Sobic006G219900--Sobic004G032600 Sobic006G219900--Sobic001G414100 Sobic002G160100 Sobic002G160100 Sobic006G219900--Sobic002G160100 Sobic003G117800 Sobic003G117800 Sobic006G219900--Sobic003G117800 Sobic006G219900--Sobic003G392275 Sobic006G219900--Sobic004G098800 Sobic006G219900--Sobic002G102300 Sobic008G010900--Sobic006G223800 Sobic008G010900--Sobic006G017600 Sobic008G010900--Sobic001G112000 Sobic008G010900--Sobic006G199700 Sobic004G101500 Sobic004G101500 Sobic008G010900--Sobic004G101500 Sobic002G342100 Sobic002G342100 Sobic008G010900--Sobic002G342100 Sobic003G409800 Sobic003G409800 Sobic008G010900--Sobic003G409800 Sobic008G010900--Sobic005G110421 Sobic010G090700 Sobic010G090700 Sobic008G010900--Sobic010G090700 Sobic005G171900 Sobic005G171900 Sobic001G427900--Sobic005G171900 Sobic001G427900--Sobic008G013200 Sobic010G051800 Sobic010G051800 Sobic001G427900--Sobic010G051800 Sobic001G427900--Sobic001G025700 Sobic003G255700 Sobic003G255700 Sobic001G427900--Sobic003G255700 Sobic001G427900--Sobic003G308300 Sobic004G340566 Sobic004G340566 Sobic001G427900--Sobic004G340566 Sobic002G014032 Sobic002G014032 Sobic001G427900--Sobic002G014032 Sobic001G449000 Sobic001G449000 Sobic001G427900--Sobic001G449000 Sobic010G134700 Sobic010G134700 Sobic004G098800--Sobic010G134700 Sobic004G098800--Sobic008G041450 Sobic004G098800--Sobic003G392275 Sobic004G098800--Sobic003G385000 Sobic004G098800--Sobic010G006800 Sobic004G098800--Sobic003G141600 Sobic004G098800--Sobic001G490950 Sobic004G098800--Sobic002G102300 Sobic004G098800--Sobic004G032600
Octagon: transcription factors


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