Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G272250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W658
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G015900 transcriptional corepressor SEUSS, putative, expressed -
2 Sobic.007G042300 expressed protein -
3 Sobic.006G003951 - -
4 Sobic.008G145800 nucleobase-ascorbate transporter, putative, expressed -
5 Sobic.001G480550 - -
6 Sobic.001G021000 nicotinate phosphoribosyltransferase family domain containing protein, expressed K00763: pncB, nicotinate phosphoribosyltransferase
7 Sobic.001G313900 rhoGAP domain containing protein, expressed -
8 Sobic.007G101500 "Bt2(Ortholog in maize:Jiang et al., 2013a)"(PubMedID : 31659904)@glucose-1-phosphate adenylyltransferase large subunit, chloroplast precursor, putative, expressed K00975: glucose-1-phosphate adenylyltransferase
9 Sobic.009G176366 - -
10 Sobic.003G159500 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
11 Sobic.005G145800 - -
12 Sobic.001G039500 protein kinase domain containing protein, expressed -
13 Sobic.010G047700 starch synthase, putative, expressed K00703: starch synthase
14 Sobic.006G056700 tRNA nucleotidyltransferase/polyA polymerase family protein, putative, expressed -
15 Sobic.008G019300 nucleobase-ascorbate transporter, putative, expressed K14611: SLC23A1, solute carrier family 23 (nucleobase transporter), member 1
16 Sobic.002G393332 - -
17 Sobic.001G341001 - -
18 Sobic.004G081601 - -
19 Sobic.004G064000 WAX2, putative, expressed -
20 Sobic.006G108832 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G272250 Sobic002G272250 Sobic010G015900 Sobic010G015900 Sobic002G272250--Sobic010G015900 Sobic007G042300 Sobic007G042300 Sobic002G272250--Sobic007G042300 Sobic006G003951 Sobic006G003951 Sobic002G272250--Sobic006G003951 Sobic008G145800 Sobic008G145800 Sobic002G272250--Sobic008G145800 Sobic001G480550 Sobic001G480550 Sobic002G272250--Sobic001G480550 Sobic001G021000 Sobic001G021000 Sobic002G272250--Sobic001G021000 Sobic001G313900 Sobic001G313900 Sobic002G272250--Sobic001G313900 Sobic007G101500 Sobic007G101500 Sobic002G272250--Sobic007G101500 Sobic009G176366 Sobic009G176366 Sobic002G272250--Sobic009G176366 Sobic010G015900--Sobic007G042300 Sobic010G015900--Sobic001G480550 Sobic001G039500 Sobic001G039500 Sobic010G015900--Sobic001G039500 Sobic010G021200 Sobic010G021200 Sobic010G015900--Sobic010G021200 Sobic002G029100 Sobic002G029100 Sobic010G015900--Sobic002G029100 Sobic001G501800 Sobic001G501800 Sobic010G015900--Sobic001G501800 Sobic010G154000 Sobic010G154000 Sobic010G015900--Sobic010G154000 Sobic003G159500 Sobic003G159500 Sobic010G015900--Sobic003G159500 Sobic010G015900--Sobic002G272250 Sobic007G042300--Sobic010G015900 Sobic006G061100 Sobic006G061100 Sobic007G042300--Sobic006G061100 Sobic007G042300--Sobic003G159500 Sobic009G239900 Sobic009G239900 Sobic007G042300--Sobic009G239900 Sobic004G075700 Sobic004G075700 Sobic007G042300--Sobic004G075700 Sobic007G042300--Sobic001G480550 Sobic006G179600 Sobic006G179600 Sobic007G042300--Sobic006G179600 Sobic001G423300 Sobic001G423300 Sobic007G042300--Sobic001G423300 Sobic009G113100 Sobic009G113100 Sobic007G042300--Sobic009G113100 Sobic006G003901 Sobic006G003901 Sobic006G003951--Sobic006G003901 Sobic001G011300 Sobic001G011300 Sobic006G003951--Sobic001G011300 Sobic006G037300 Sobic006G037300 Sobic006G003951--Sobic006G037300 Sobic006G003951--Sobic010G015900 Sobic006G003951--Sobic001G480550 Sobic004G064000 Sobic004G064000 Sobic006G003951--Sobic004G064000 Sobic006G003951--Sobic002G272250 Sobic004G155800 Sobic004G155800 Sobic006G003951--Sobic004G155800 Sobic006G155700 Sobic006G155700 Sobic006G003951--Sobic006G155700 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic008G145800--Sobic001G456900 Sobic007G159900 Sobic007G159900 Sobic008G145800--Sobic007G159900 Sobic004G088200 Sobic004G088200 Sobic008G145800--Sobic004G088200 Sobic006G056700 Sobic006G056700 Sobic008G145800--Sobic006G056700 Sobic004G311400 Sobic004G311400 Sobic008G145800--Sobic004G311400 Sobic005G100700 Sobic005G100700 Sobic008G145800--Sobic005G100700 Sobic008G088200 Sobic008G088200 Sobic008G145800--Sobic008G088200 Sobic004G129300 Sobic004G129300 Sobic008G145800--Sobic004G129300 Sobic010G237900 Sobic010G237900 Sobic008G145800--Sobic010G237900 Sobic002G393332 Sobic002G393332 Sobic001G480550--Sobic002G393332 Sobic003G214700 Sobic003G214700 Sobic001G480550--Sobic003G214700 Sobic001G480550--Sobic009G113100 Sobic001G480550--Sobic010G015900 Sobic001G480550--Sobic004G155800 Sobic004G065800 Sobic004G065800 Sobic001G480550--Sobic004G065800 Sobic001G480550--Sobic007G042300 Sobic001G480550--Sobic010G021200 Sobic001G367700 Sobic001G367700 Sobic001G480550--Sobic001G367700 Sobic010G177400 Sobic010G177400 Sobic001G021000--Sobic010G177400 Sobic005G134100 Sobic005G134100 Sobic001G021000--Sobic005G134100 Sobic004G317700 Sobic004G317700 Sobic001G021000--Sobic004G317700 Sobic003G105900 Sobic003G105900 Sobic001G021000--Sobic003G105900 Sobic010G047700 Sobic010G047700 Sobic001G021000--Sobic010G047700 Sobic002G349100 Sobic002G349100 Sobic001G021000--Sobic002G349100 Sobic001G220000 Sobic001G220000 Sobic001G021000--Sobic001G220000 Sobic004G125800 Sobic004G125800 Sobic001G021000--Sobic004G125800 Sobic006G221000 Sobic006G221000 Sobic001G021000--Sobic006G221000 Sobic001G313900--Sobic010G237900 Sobic001G070600 Sobic001G070600 Sobic001G313900--Sobic001G070600 Sobic001G313900--Sobic007G159900 Sobic003G175100 Sobic003G175100 Sobic001G313900--Sobic003G175100 Sobic001G313900--Sobic004G129300 Sobic001G313900--Sobic008G145800 Sobic001G250700 Sobic001G250700 Sobic001G313900--Sobic001G250700 Sobic006G063001 Sobic006G063001 Sobic001G313900--Sobic006G063001 Sobic002G148750 Sobic002G148750 Sobic001G313900--Sobic002G148750 Sobic003G162900 Sobic003G162900 Sobic007G101500--Sobic003G162900 Sobic006G013800 Sobic006G013800 Sobic007G101500--Sobic006G013800 Sobic002G267900 Sobic002G267900 Sobic007G101500--Sobic002G267900 Sobic008G171300 Sobic008G171300 Sobic007G101500--Sobic008G171300 Sobic003G271900 Sobic003G271900 Sobic007G101500--Sobic003G271900 Sobic008G172700 Sobic008G172700 Sobic007G101500--Sobic008G172700 Sobic004G020300 Sobic004G020300 Sobic007G101500--Sobic004G020300 Sobic004G307400 Sobic004G307400 Sobic007G101500--Sobic004G307400 Sobic001G277400 Sobic001G277400 Sobic007G101500--Sobic001G277400 Sobic003G330000 Sobic003G330000 Sobic009G176366--Sobic003G330000 Sobic003G032600 Sobic003G032600 Sobic009G176366--Sobic003G032600 Sobic001G431400 Sobic001G431400 Sobic009G176366--Sobic001G431400 Sobic009G176366--Sobic002G272250 Sobic002G248500 Sobic002G248500 Sobic009G176366--Sobic002G248500 Sobic001G178300 Sobic001G178300 Sobic009G176366--Sobic001G178300 Sobic010G142700 Sobic010G142700 Sobic009G176366--Sobic010G142700 Sobic010G132900 Sobic010G132900 Sobic009G176366--Sobic010G132900 Sobic006G066900 Sobic006G066900 Sobic009G176366--Sobic006G066900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.