Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G019300.4,Sobic.008G019300.1,Sobic.008G019300.2,Sobic.008G019300.3
Synonym Sb08g001650
Functional annotation nucleobase-ascorbate transporter, putative, expressed
UniProt A0A1B6PAY0 , A0A1B6PB59 , C5YQP9
Pfam PF00860
Panther DB PTHR11119 PTHR11119:SF47
NCBI CDD -
KEGG Orthology K14611; SLC23A1, solute carrier family 23 (nucleobase transporter), member 1
Gene Ontology GO:0016020; membrane GO:0006810transport GO:0005215transporter activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G34190 : Xanthine/uracil permease family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g15170.1 : nucleobase-ascorbate transporter, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029860
Brachypodium PNT67992 , KQJ98047
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G173532 - -
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20 Sobic.001G438300 aspartic proteinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G019300 Sobic008G019300 Sobic005G173532 Sobic005G173532 Sobic008G019300--Sobic005G173532 Sobic001G273800 Sobic001G273800 Sobic008G019300--Sobic001G273800 Sobic001G313900 Sobic001G313900 Sobic008G019300--Sobic001G313900 Sobic009G017732 Sobic009G017732 Sobic008G019300--Sobic009G017732 Sobic002G272250 Sobic002G272250 Sobic008G019300--Sobic002G272250 Sobic003G344700 Sobic003G344700 Sobic008G019300--Sobic003G344700 Sobic003G271600 Sobic003G271600 Sobic008G019300--Sobic003G271600 Sobic001G300800 Sobic001G300800 Sobic008G019300--Sobic001G300800 Sobic008G066600 Sobic008G066600 Sobic008G019300--Sobic008G066600 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic005G173532--Sobic005G147700 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic005G173532--Sobic005G174700 Sobic004G198550 Sobic004G198550 Sobic005G173532--Sobic004G198550 Sobic005G146200 Sobic005G146200 Sobic005G173532--Sobic005G146200 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic005G173532--Sobic006G276401 Sobic005G173532--Sobic003G271600 Sobic009G039700 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Octagon: transcription factors


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