Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G338900.5,Sobic.002G338900.2,Sobic.002G338900.4,Sobic.002G338900.3,Sobic.002G338900.6,Sobic.002G338900.7
Synonym Sb02g036350
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W6U9 , A0A1W0W6X6 , C5XBJ8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048383
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G231600 cytochrome P450, putative, expressed -
2 Sobic.001G298800 ternary complex factor MIP1, putative, expressed -
3 Sobic.003G045700 pleiotropic drug resistance protein, putative, expressed -
4 Sobic.006G027101 - -
5 Sobic.001G523700 erythronate-4-phosphate dehydrogenase, putative, expressed -
6 Sobic.009G173200 Homologous to EPF/EPFL genes in Arabidopsis. Modelling of protein structure.(PubMedID : 23755192)@expressed protein -
7 Sobic.006G014400 pectate lyase precursor, putative, expressed K01728: pectate lyase
8 Sobic.001G043500 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K12876: RBM8A, RNA-binding protein 8A
9 Sobic.007G128100 expressed protein -
10 Sobic.003G072400 expressed protein -
11 Sobic.005G156100 Long chain acyl CoA synthetase 2 LACS2 (At)(PubMedID : 27208977)@AMP-binding enzyme, putative, expressed K01897: ACSL, long-chain acyl-CoA synthetase
12 Sobic.005G104100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
13 Sobic.007G161600 SET domain containing protein, expressed -
14 Sobic.004G313500 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
15 Sobic.003G177000 RNA-dependent RNA polymerase, putative, expressed K11699: RDR, RNA-dependent RNA polymerase
16 Sobic.001G023500 expressed protein -
17 Sobic.006G185800 OsSub45 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
18 Sobic.001G207600 white-brown complex homolog protein 11, putative, expressed -
19 Sobic.009G057600 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
20 Sobic.004G149400 ankyrin, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G338900 Sobic002G338900 Sobic010G231600 Sobic010G231600 Sobic002G338900--Sobic010G231600 Sobic001G298800 Sobic001G298800 Sobic002G338900--Sobic001G298800 Sobic003G045700 Sobic003G045700 Sobic002G338900--Sobic003G045700 Sobic006G027101 Sobic006G027101 Sobic002G338900--Sobic006G027101 Sobic001G523700 Sobic001G523700 Sobic002G338900--Sobic001G523700 Sobic009G173200 Sobic009G173200 Sobic002G338900--Sobic009G173200 Sobic006G014400 Sobic006G014400 Sobic002G338900--Sobic006G014400 Sobic001G043500 Sobic001G043500 Sobic002G338900--Sobic001G043500 Sobic007G128100 Sobic007G128100 Sobic002G338900--Sobic007G128100 Sobic010G231600--Sobic003G045700 Sobic001G207600 Sobic001G207600 Sobic010G231600--Sobic001G207600 Sobic010G231600--Sobic006G014400 Sobic001G023500 Sobic001G023500 Sobic010G231600--Sobic001G023500 Sobic004G283800 Sobic004G283800 Sobic010G231600--Sobic004G283800 Sobic001G441700 Sobic001G441700 Sobic010G231600--Sobic001G441700 Sobic009G031400 Sobic009G031400 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Octagon: transcription factors


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