Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G160700.1
Synonym RALFL33, Sb03g014360
Functional annotation RALFL8 - Rapid ALkalinization Factor RALF family protein precursor, expressed
UniProt C5XJY9
Pfam PF05498
Panther DB PTHR33136 PTHR33136:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G15800 : ralf-like 33
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g25560.1 : RALFL7 - Rapid ALkalinization Factor RALF family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036259 , Zm00025a022980 , Zm00025a024512 , Zm00025a035863
Brachypodium KQK04278 , PNT73526
Barley HORVU1Hr1G080640.1 , HORVU1Hr1G080640.2 , HORVU3Hr1G097790.1
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G160700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G113300 -(PubMedID : 26976818)@serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial precursor, putative, expressed K00600: glyA, glycine hydroxymethyltransferase
2 Sobic.004G041900 apoptosis-inducing factor 2, putative, expressed -
3 Sobic.003G125650 - K02183: calmodulin
4 Sobic.003G078200 ribosomal protein L24, putative, expressed K02898: RP-L26e, large subunit ribosomal protein L26e
5 Sobic.001G475500 ras-related protein, putative, expressed K07904: Ras-related protein Rab-11A
6 Sobic.001G502900 nicotiana lesion-inducing like, putative, expressed -
7 Sobic.004G220000 kinase, pfkB family, putative, expressed K00856: E2.7.1.20, adenosine kinase
8 Sobic.009G188000 NADPH-dependent FMN reductase domain containing protein, expressed K03809: NAD(P)H dehydrogenase (quinone)
9 Sobic.003G436700 40S ribosomal protein S10, putative, expressed K02947: RP-S10e, small subunit ribosomal protein S10e
10 Sobic.001G295200 nucleoside diphosphate kinase, putative, expressed K00940: ndk, nucleoside-diphosphate kinase
11 Sobic.004G008400 ribosomal protein L37, putative, expressed K02922: RP-L37e, large subunit ribosomal protein L37e
12 Sobic.007G197800 60S ribosomal protein L32, putative, expressed K02912: RP-L32e, large subunit ribosomal protein L32e
13 Sobic.006G116700 60S ribosomal protein L6, putative, expressed K02934: RP-L6e, large subunit ribosomal protein L6e
14 Sobic.003G027400 VQ domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G054800 40S ribosomal protein S27a, putative, expressed K02977: RP-S27Ae, RPS27A, ubiquitin-small subunit ribosomal protein S27Ae
16 Sobic.010G221300 expressed protein -
17 Sobic.001G361600 chaperonin, putative, expressed K04078: groES, chaperonin GroES
18 Sobic.001G130301 - K02971: RP-S21e, small subunit ribosomal protein S21e
19 Sobic.003G084400 ZOS1-03 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
20 Sobic.004G345500 oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G160700 Sobic003G160700 Sobic005G113300 Sobic005G113300 Sobic003G160700--Sobic005G113300 Sobic004G041900 Sobic004G041900 Sobic003G160700--Sobic004G041900 Sobic003G125650 Sobic003G125650 Sobic003G160700--Sobic003G125650 Sobic003G078200 Sobic003G078200 Sobic003G160700--Sobic003G078200 Sobic001G475500 Sobic001G475500 Sobic003G160700--Sobic001G475500 Sobic001G502900 Sobic001G502900 Sobic003G160700--Sobic001G502900 Sobic004G220000 Sobic004G220000 Sobic003G160700--Sobic004G220000 Sobic009G188000 Sobic009G188000 Sobic003G160700--Sobic009G188000 Sobic003G436700 Sobic003G436700 Sobic003G160700--Sobic003G436700 Sobic005G113300--Sobic004G220000 Sobic001G295200 Sobic001G295200 Sobic005G113300--Sobic001G295200 Sobic001G361600 Sobic001G361600 Sobic005G113300--Sobic001G361600 Sobic006G116700 Sobic006G116700 Sobic005G113300--Sobic006G116700 Sobic001G018900 Sobic001G018900 Sobic005G113300--Sobic001G018900 Sobic007G197800 Sobic007G197800 Sobic005G113300--Sobic007G197800 Sobic009G076400 Sobic009G076400 Sobic005G113300--Sobic009G076400 Sobic002G379500 Sobic002G379500 Sobic005G113300--Sobic002G379500 Sobic005G113300--Sobic003G160700 Sobic006G075400 Sobic006G075400 Sobic004G041900--Sobic006G075400 Sobic007G017500 Sobic007G017500 Sobic004G041900--Sobic007G017500 Sobic003G043600 Sobic003G043600 Sobic004G041900--Sobic003G043600 Sobic001G330400 Sobic001G330400 Sobic004G041900--Sobic001G330400 Sobic009G184000 Sobic009G184000 Sobic004G041900--Sobic009G184000 Sobic001G318700 Sobic001G318700 Sobic004G041900--Sobic001G318700 Sobic003G228900 Sobic003G228900 Sobic004G041900--Sobic003G228900 Sobic001G031700 Sobic001G031700 Sobic004G041900--Sobic001G031700 Sobic003G268600 Sobic003G268600 Sobic004G041900--Sobic003G268600 Sobic003G125650--Sobic007G197800 Sobic001G130301 Sobic001G130301 Sobic003G125650--Sobic001G130301 Sobic003G125650--Sobic001G018900 Sobic001G402050 Sobic001G402050 Sobic003G125650--Sobic001G402050 Sobic001G390300 Sobic001G390300 Sobic003G125650--Sobic001G390300 Sobic003G125650--Sobic006G116700 Sobic001G493001 Sobic001G493001 Sobic003G125650--Sobic001G493001 Sobic002G200600 Sobic002G200600 Sobic003G125650--Sobic002G200600 Sobic009G050300 Sobic009G050300 Sobic003G125650--Sobic009G050300 Sobic002G372400 Sobic002G372400 Sobic003G078200--Sobic002G372400 Sobic009G054800 Sobic009G054800 Sobic003G078200--Sobic009G054800 Sobic010G206200 Sobic010G206200 Sobic003G078200--Sobic010G206200 Sobic005G019700 Sobic005G019700 Sobic003G078200--Sobic005G019700 Sobic003G078200--Sobic007G197800 Sobic007G018300 Sobic007G018300 Sobic003G078200--Sobic007G018300 Sobic003G078200--Sobic009G050300 Sobic003G078200--Sobic001G018900 Sobic003G078200--Sobic006G116700 Sobic001G475500--Sobic001G502900 Sobic001G475500--Sobic003G160700 Sobic003G122200 Sobic003G122200 Sobic001G475500--Sobic003G122200 Sobic001G475500--Sobic005G113300 Sobic007G150800 Sobic007G150800 Sobic001G475500--Sobic007G150800 Sobic009G173500 Sobic009G173500 Sobic001G475500--Sobic009G173500 Sobic001G475500--Sobic001G361600 Sobic001G475500--Sobic004G220000 Sobic003G117500 Sobic003G117500 Sobic001G475500--Sobic003G117500 Sobic001G502900--Sobic001G475500 Sobic001G502900--Sobic003G160700 Sobic001G502900--Sobic005G113300 Sobic001G502900--Sobic003G078200 Sobic001G502900--Sobic001G018900 Sobic001G502900--Sobic004G220000 Sobic001G502900--Sobic003G125650 Sobic001G502900--Sobic005G019700 Sobic004G345500 Sobic004G345500 Sobic001G502900--Sobic004G345500 Sobic004G220000--Sobic005G113300 Sobic004G211833 Sobic004G211833 Sobic004G220000--Sobic004G211833 Sobic010G012500 Sobic010G012500 Sobic004G220000--Sobic010G012500 Sobic002G398901 Sobic002G398901 Sobic004G220000--Sobic002G398901 Sobic004G220000--Sobic001G295200 Sobic006G083500 Sobic006G083500 Sobic004G220000--Sobic006G083500 Sobic004G220000--Sobic009G188000 Sobic004G220000--Sobic001G361600 Sobic004G220000--Sobic001G130301 Sobic001G313600 Sobic001G313600 Sobic009G188000--Sobic001G313600 Sobic001G304100 Sobic001G304100 Sobic009G188000--Sobic001G304100 Sobic005G107900 Sobic005G107900 Sobic009G188000--Sobic005G107900 Sobic001G502400 Sobic001G502400 Sobic009G188000--Sobic001G502400 Sobic001G238400 Sobic001G238400 Sobic009G188000--Sobic001G238400 Sobic006G235100 Sobic006G235100 Sobic009G188000--Sobic006G235100 Sobic003G084400 Sobic003G084400 Sobic009G188000--Sobic003G084400 Sobic008G009400 Sobic008G009400 Sobic009G188000--Sobic008G009400 Sobic009G188000--Sobic001G295200 Sobic004G008400 Sobic004G008400 Sobic003G436700--Sobic004G008400 Sobic003G436700--Sobic006G116700 Sobic003G436700--Sobic009G050300 Sobic010G251600 Sobic010G251600 Sobic003G436700--Sobic010G251600 Sobic006G067800 Sobic006G067800 Sobic003G436700--Sobic006G067800 Sobic007G178600 Sobic007G178600 Sobic003G436700--Sobic007G178600 Sobic002G081600 Sobic002G081600 Sobic003G436700--Sobic002G081600 Sobic009G215200 Sobic009G215200 Sobic003G436700--Sobic009G215200 Sobic003G436700--Sobic002G379500
Octagon: transcription factors


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