Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G264300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q5H2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027947
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G285600 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR45 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
2 Sobic.002G174801 - -
3 Sobic.005G164966 - K13963: serpin B
4 Sobic.010G097000 leaf senescence related protein, putative, expressed -
5 Sobic.009G172200 expressed protein -
6 Sobic.004G081201 - -
7 Sobic.001G448800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@lecithin cholesterol acyltransferase, putative, expressed -
8 Sobic.002G349400 - -
9 Sobic.008G095100 SAM domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.009G070300 - -
11 Sobic.003G221000 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.004G007500 cytochrome P450, putative, expressed K10528: hydroperoxide lyase
13 Sobic.003G421300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@encoding a transcription factor with the ALOG domain(PubMedID : 34271177)@"DAI encodes the ALOG family protein, and inhibits awn elongation by suppressing both cell proliferation and elongation."(PubMedID : 35640621)@DUF640 domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.008G137800 expressed protein -
15 Sobic.009G136300 alpha/beta hydrolase fold, putative, expressed -
16 Sobic.003G055800 expressed protein -
17 Sobic.009G152400 glutamine cyclotransferase precursor, putative, expressed -
18 Sobic.001G148400 Ca exchanger(PubMedID : 22196357)@sodium/calcium exchanger protein, putative, expressed K13754: SLC24A6, solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 6
19 Sobic.007G072166 - -
20 Sobic.001G467700 arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G264300 Sobic003G264300 Sobic002G285600 Sobic002G285600 Sobic003G264300--Sobic002G285600 Sobic002G174801 Sobic002G174801 Sobic003G264300--Sobic002G174801 Sobic005G164966 Sobic005G164966 Sobic003G264300--Sobic005G164966 Sobic010G097000 Sobic010G097000 Sobic003G264300--Sobic010G097000 Sobic009G172200 Sobic009G172200 Sobic003G264300--Sobic009G172200 Sobic004G081201 Sobic004G081201 Sobic003G264300--Sobic004G081201 Sobic001G448800 Sobic001G448800 Sobic003G264300--Sobic001G448800 Sobic002G349400 Sobic002G349400 Sobic003G264300--Sobic002G349400 Sobic008G095100 Sobic008G095100 Sobic003G264300--Sobic008G095100 Sobic005G226450 Sobic005G226450 Sobic002G285600--Sobic005G226450 Sobic009G172000 Sobic009G172000 Sobic002G285600--Sobic009G172000 Sobic001G250200 Sobic001G250200 Sobic002G285600--Sobic001G250200 Sobic002G285600--Sobic005G164966 Sobic002G285600--Sobic003G264300 Sobic010G083550 Sobic010G083550 Sobic002G285600--Sobic010G083550 Sobic006G014400 Sobic006G014400 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Octagon: transcription factors


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