Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G325600.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q6L1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g58590.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G396500 ZOS5-12 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
2 Sobic.008G024100 AT hook motif family protein, expressed -
3 Sobic.001G218600 MATH domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G506400 expressed protein -
5 Sobic.001G135700 - -
6 Sobic.007G063800 - -
7 Sobic.008G082000 RWP-RK domain-containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G062600 OsFBX154 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G033400 DNA polymerase V, putative, expressed K02331: POL5, DNA polymerase phi
10 Sobic.010G038300 OsFBDUF33 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G217800 ras-related protein, putative, expressed K07936: GTP-binding nuclear protein Ran
12 Sobic.010G263400 expressed protein -
13 Sobic.001G171001 - -
14 Sobic.001G034200 60S ribosomal protein L36-2, putative, expressed K02920: RP-L36e, large subunit ribosomal protein L36e
15 Sobic.002G299500 expressed protein -
16 Sobic.001G091701 - -
17 Sobic.007G060100 expressed protein -
18 Sobic.010G157200 MBTB14 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
19 Sobic.007G144100 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, putative, expressed K03252: translation initiation factor 3 subunit C
20 Sobic.004G062200 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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