Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G415500.1
Synonym Sb03g044930, RALFL33
Functional annotation RALFL1 - Rapid ALkalinization Factor RALF family protein precursor, putative, expressed
UniProt C5XH31
Pfam PF05498
Panther DB PTHR33136 PTHR33136:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G15800 : ralf-like 33
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g70690.1 : RALFL1 - Rapid ALkalinization Factor RALF family protein precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039203
Brachypodium -
Barley HORVU3Hr1G097790.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G206700 lectin-like protein kinase, putative, expressed -
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11 Sobic.004G156600 - -
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20 Sobic.001G462100 MFP1 attachment factor 1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G415500 Sobic003G415500 Sobic007G206700 Sobic007G206700 Sobic003G415500--Sobic007G206700 Sobic003G040100 Sobic003G040100 Sobic003G415500--Sobic003G040100 Sobic009G190400 Sobic009G190400 Sobic003G415500--Sobic009G190400 Sobic003G390300 Sobic003G390300 Sobic003G415500--Sobic003G390300 Sobic003G083700 Sobic003G083700 Sobic003G415500--Sobic003G083700 Sobic001G062700 Sobic001G062700 Sobic003G415500--Sobic001G062700 Sobic003G226100 Sobic003G226100 Sobic003G415500--Sobic003G226100 Sobic003G148500 Sobic003G148500 Sobic003G415500--Sobic003G148500 Sobic007G076800 Sobic007G076800 Sobic003G415500--Sobic007G076800 Sobic010G259200 Sobic010G259200 Sobic007G206700--Sobic010G259200 Sobic002G001300 Sobic002G001300 Sobic007G206700--Sobic002G001300 Sobic007G206700--Sobic003G083700 Sobic010G119600 Sobic010G119600 Sobic007G206700--Sobic010G119600 Sobic001G402701 Sobic001G402701 Sobic007G206700--Sobic001G402701 Sobic007G206700--Sobic003G390300 Sobic003G104900 Sobic003G104900 Sobic007G206700--Sobic003G104900 Sobic010G087200 Sobic010G087200 Sobic007G206700--Sobic010G087200 Sobic007G206700--Sobic001G062700 Sobic003G040100--Sobic009G190400 Sobic008G020500 Sobic008G020500 Sobic003G040100--Sobic008G020500 Sobic006G155900 Sobic006G155900 Sobic003G040100--Sobic006G155900 Sobic004G198200 Sobic004G198200 Sobic003G040100--Sobic004G198200 Sobic004G156600 Sobic004G156600 Sobic003G040100--Sobic004G156600 Sobic001G494300 Sobic001G494300 Sobic003G040100--Sobic001G494300 Sobic003G040100--Sobic003G390300 Sobic003G040100--Sobic003G415500 Sobic004G061600 Sobic004G061600 Sobic003G040100--Sobic004G061600 Sobic009G190400--Sobic003G040100 Sobic009G190400--Sobic006G155900 Sobic009G190400--Sobic004G198200 Sobic009G064600 Sobic009G064600 Sobic009G190400--Sobic009G064600 Sobic009G190400--Sobic003G415500 Sobic009G190400--Sobic008G020500 Sobic002G282100 Sobic002G282100 Sobic009G190400--Sobic002G282100 Sobic009G190400--Sobic004G156600 Sobic001G070200 Sobic001G070200 Sobic009G190400--Sobic001G070200 Sobic004G107400 Sobic004G107400 Sobic003G390300--Sobic004G107400 Sobic003G390300--Sobic004G061600 Sobic008G136900 Sobic008G136900 Sobic003G390300--Sobic008G136900 Sobic003G390300--Sobic001G062700 Sobic003G390300--Sobic003G104900 Sobic010G014900 Sobic010G014900 Sobic003G390300--Sobic010G014900 Sobic007G158400 Sobic007G158400 Sobic003G390300--Sobic007G158400 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic003G390300--Sobic001G137200 Sobic009G028600 Sobic009G028600 Sobic003G390300--Sobic009G028600 Sobic003G083700--Sobic003G104900 Sobic003G083700--Sobic010G259200 Sobic003G083700--Sobic007G206700 Sobic003G083700--Sobic002G001300 Sobic001G483700 Sobic001G483700 Sobic003G083700--Sobic001G483700 Sobic010G002850 Sobic010G002850 Sobic003G083700--Sobic010G002850 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic003G083700--Sobic005G209800 Sobic003G083700--Sobic003G390300 Sobic003G083700--Sobic001G402701 Sobic001G062700--Sobic003G390300 Sobic001G062700--Sobic004G061600 Sobic001G062700--Sobic008G136900 Sobic007G092300 Sobic007G092300 Sobic001G062700--Sobic007G092300 Sobic001G062700--Sobic010G119600 Sobic001G062700--Sobic010G259200 Sobic001G062700--Sobic007G206700 Sobic001G062700--Sobic010G014900 Sobic001G062700--Sobic004G107400 Sobic004G153700 Sobic004G153700 Sobic003G226100--Sobic004G153700 Sobic009G204800 Sobic009G204800 Sobic003G226100--Sobic009G204800 Sobic010G194500 Sobic010G194500 Sobic003G226100--Sobic010G194500 Sobic010G008000 Sobic010G008000 Sobic003G226100--Sobic010G008000 Sobic003G226100--Sobic003G083700 Sobic003G226100--Sobic003G415500 Sobic005G035000 Sobic005G035000 Sobic003G226100--Sobic005G035000 Sobic003G226100--Sobic007G206700 Sobic001G189500 Sobic001G189500 Sobic003G226100--Sobic001G189500 Sobic003G148500--Sobic001G062700 Sobic006G186200 Sobic006G186200 Sobic003G148500--Sobic006G186200 Sobic003G148500--Sobic003G390300 Sobic003G359200 Sobic003G359200 Sobic003G148500--Sobic003G359200 Sobic003G148500--Sobic003G415500 Sobic003G148500--Sobic004G107400 Sobic003G148500--Sobic004G156600 Sobic003G148500--Sobic004G061600 Sobic003G148500--Sobic008G136900 Sobic007G076800--Sobic003G390300 Sobic007G076800--Sobic004G061600 Sobic007G076800--Sobic004G107400 Sobic007G076800--Sobic008G136900 Sobic009G005800 Sobic009G005800 Sobic007G076800--Sobic009G005800 Sobic007G076800--Sobic001G062700 Sobic002G010500 Sobic002G010500 Sobic007G076800--Sobic002G010500 Sobic007G076800--Sobic010G119600 Sobic007G076800--Sobic007G206700
Octagon: transcription factors


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