Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G435700.1,Sobic.003G435700.3,Sobic.003G435700.2
Synonym Sb03g046650
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence. (PubMedID : 27586543)
expressed protein
UniProt C5XIM8
Pfam -
Panther DB PTHR36073 PTHR36073:SF1 PTHR36073:SF1 PTHR36073
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45310 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g73110.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025900
Brachypodium -
Barley HORVU3Hr1G111580.1 , HORVU3Hr1G111580.3 , HORVU3Hr1G111580.2 , HORVU3Hr1G111580.4
Wheat TraesCS3A02G506000 , TraesCS3A02G506000 , TraesCS3D02G514000
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G435700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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13 Sobic.002G387450 - -
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19 Sobic.001G222150 - -
20 Sobic.006G135701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G435700 Sobic003G435700 Sobic001G518050 Sobic001G518050 Sobic003G435700--Sobic001G518050 Sobic006G108500 Sobic006G108500 Sobic003G435700--Sobic006G108500 Sobic010G224100 Sobic010G224100 Sobic003G435700--Sobic010G224100 Sobic005G100500 Sobic005G100500 Sobic003G435700--Sobic005G100500 Sobic006G219950 Sobic006G219950 Sobic003G435700--Sobic006G219950 Sobic003G055400 Sobic003G055400 Sobic003G435700--Sobic003G055400 Sobic001G450900 Sobic001G450900 Sobic003G435700--Sobic001G450900 Sobic009G118500 Sobic009G118500 Sobic003G435700--Sobic009G118500 Sobic004G307200 Sobic004G307200 Sobic003G435700--Sobic004G307200 Sobic010G267300 Sobic010G267300 Sobic001G518050--Sobic010G267300 Sobic004G268600 Sobic004G268600 Sobic001G518050--Sobic004G268600 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic001G518050--Sobic001G128000 Sobic002G180732 Sobic002G180732 Sobic001G518050--Sobic002G180732 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic001G518050--Sobic003G160433 Sobic003G337200 Sobic003G337200 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Octagon: transcription factors


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