Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G016250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RL93
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g49070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G188800 ankyrin repeat domain-containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G128200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.007G127950 - -
4 Sobic.003G007200 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
5 Sobic.001G439800 Subtilisin-like serine protease 2("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@OsSub28 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
6 Sobic.010G013600 syntaxin, putative, expressed K08489: syntaxin 16
7 Sobic.001G288000 ankyrin repeat domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.003G013800 expressed protein -
9 Sobic.009G125800 expressed protein -
10 Sobic.002G322700 expressed protein -
11 Sobic.010G222800 expressed protein -
12 Sobic.010G024000 transketolase, chloroplast precursor, putative, expressed K00615: E2.2.1.1, tktA, transketolase
13 Sobic.004G024500 plant neutral invertase domain containing protein, expressed -
14 Sobic.007G017100 - -
15 Sobic.002G052800 FAR1 family protein, expressed -
16 Sobic.003G044000 lipase class 3 family protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G205000 ZOS9-06 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
18 Sobic.009G136000 microtubule associated protein, putative, expressed K16732: protein regulator of cytokinesis 1
19 Sobic.010G009700 OsFBX182 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G354500 methyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G016250 Sobic004G016250 Sobic008G188800 Sobic008G188800 Sobic004G016250--Sobic008G188800 Sobic001G128200 Sobic001G128200 Sobic004G016250--Sobic001G128200 Sobic007G127950 Sobic007G127950 Sobic004G016250--Sobic007G127950 Sobic003G007200 Sobic003G007200 Sobic004G016250--Sobic003G007200 Sobic001G439800 Sobic001G439800 Sobic004G016250--Sobic001G439800 Sobic010G013600 Sobic010G013600 Sobic004G016250--Sobic010G013600 Sobic001G288000 Sobic001G288000 Sobic004G016250--Sobic001G288000 Sobic003G013800 Sobic003G013800 Sobic004G016250--Sobic003G013800 Sobic009G125800 Sobic009G125800 Sobic004G016250--Sobic009G125800 Sobic007G146200 Sobic007G146200 Sobic008G188800--Sobic007G146200 Sobic005G008850 Sobic005G008850 Sobic008G188800--Sobic005G008850 Sobic006G152700 Sobic006G152700 Sobic008G188800--Sobic006G152700 Sobic008G188800--Sobic009G125800 Sobic008G140600 Sobic008G140600 Sobic008G188800--Sobic008G140600 Sobic003G377300 Sobic003G377300 Sobic008G188800--Sobic003G377300 Sobic002G322700 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Octagon: transcription factors


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