Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G017100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PF20
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.007G017100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G084100 expressed protein -
2 Sobic.002G335900 cyclin, putative, expressed K18812: cyclin D6, plant
3 Sobic.001G101900 SCP-like extracellular protein, expressed -
4 Sobic.003G010700 plant-specific domain TIGR01568 family protein, expressed -
5 Sobic.008G008100 kelch repeat-containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.006G236800 ATEB1A-like microtubule associated protein, putative, expressed K10436: microtubule-associated protein, RP/EB family
7 Sobic.010G087700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@heat shock 22 kDa protein, mitochondrial precursor, putative, expressed K13993: HSP20 family protein
8 Sobic.001G128200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G404300 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
10 Sobic.008G070700 leafbladeless1, putative, expressed -
11 Sobic.008G052000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@amidase family protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G007200 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
13 Sobic.008G155900 ankyrin-1, putative, expressed -
14 Sobic.004G220200 expressed protein -
15 Sobic.006G163300 aldehyde dehydrogenase, putative, expressed K00128: aldehyde dehydrogenase (NAD+)
16 Sobic.002G360600 expressed protein -
17 Sobic.003G002000 expressed protein -
18 Sobic.006G193100 zinc finger family protein, putative, expressed K18932: palmitoyltransferase
19 Sobic.007G087800 expressed protein K06085: SSX2IP, synovial sarcoma, X breakpoint 2 interacting protein
20 Sobic.001G033300 expansin precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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