Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G031200.1
Synonym CPuORF5
Functional annotation -
UniProt A0A194YME8
Pfam -
Panther DB PTHR38362
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G75388 : conserved peptide upstream open reading frame 5
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ93156
Barley HORVU5Hr1G054510.3 , HORVU5Hr1G054510.6 , HORVU5Hr1G054510.7
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G031200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G031100 CPuORF1 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed -
2 Sobic.007G085700 - -
3 Sobic.003G377500 OsFBX10 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G272700 transmembrane protein 16K, putative, expressed -
5 Sobic.009G156100 - -
6 Sobic.003G175201 - -
7 Sobic.007G076400 expressed protein -
8 Sobic.005G023800 expressed protein -
9 Sobic.008G116700 expressed protein -
10 Sobic.002G186400 OsFBX323 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G405600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@exostosin family domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G220600 potassium transporter, putative, expressed -
13 Sobic.003G242700 - -
14 Sobic.002G368700 OsMADS18 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
15 Sobic.004G219000 CK1_CaseinKinase_1.5 - CK1 includes the casein kinase 1 kinases, expressed -
16 Sobic.009G228000 ubiquitin-conjugating enzyme domain containing protein, expressed K10581: ubiquitin-conjugating enzyme E2 O
17 Sobic.009G107300 3\'-5\' exonuclease, putative, expressed -
18 Sobic.003G032400 - -
19 Sobic.008G069300 - -
20 Sobic.002G098900 phospholipase D, putative, expressed K01115: phospholipase D1/2


Gene co-expression network
sample Sobic004G031200 Sobic004G031200 Sobic004G031100 Sobic004G031100 Sobic004G031200--Sobic004G031100 Sobic007G085700 Sobic007G085700 Sobic004G031200--Sobic007G085700 Sobic003G377500 Sobic003G377500 Sobic004G031200--Sobic003G377500 Sobic003G272700 Sobic003G272700 Sobic004G031200--Sobic003G272700 Sobic009G156100 Sobic009G156100 Sobic004G031200--Sobic009G156100 Sobic003G175201 Sobic003G175201 Sobic004G031200--Sobic003G175201 Sobic007G076400 Sobic007G076400 Sobic004G031200--Sobic007G076400 Sobic005G023800 Sobic005G023800 Sobic004G031200--Sobic005G023800 Sobic008G116700 Sobic008G116700 Sobic004G031200--Sobic008G116700 Sobic009G152140 Sobic009G152140 Sobic004G031100--Sobic009G152140 Sobic004G031100--Sobic004G031200 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic004G031100--Sobic002G239400 Sobic008G168700 Sobic008G168700 Sobic004G031100--Sobic008G168700 Sobic007G060100 Sobic007G060100 Sobic004G031100--Sobic007G060100 Sobic009G066600 Sobic009G066600 Sobic004G031100--Sobic009G066600 Sobic006G119900 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Octagon: transcription factors


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