Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G063000.1
Synonym Sb04g005230
Functional annotation membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5XW97
Pfam PF04535
Panther DB PTHR11615 PTHR11615:SF153
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G35760 : Uncharacterised protein family (UPF0497)
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g08110.1 : membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019182
Brachypodium KQJ93617 , KQK16885
Barley HORVU6Hr1G030310.2 , HORVU6Hr1G030310.1 , HORVU6Hr1G030310.5 , HORVU6Hr1G030310.4
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G208500 ankyrin repeat family protein, putative, expressed -
2 Sobic.007G013500 expressed protein -
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4 Sobic.003G149500 NAD dependent epimerase/dehydratase family domain containing protein, expressed K08678: UXS1, UDP-glucuronate decarboxylase
5 Sobic.008G139900 expressed protein -
6 Sobic.006G204000 "Ascorbate peroxidase,heme binding / peroxidase (Os)"(PubMedID : 27208977)@Ascorbate peroxidasel heme binding / peroxidase (Os)(PubMedID : 27208977)@peroxidase precursor, putative, expressed K00434: L-ascorbate peroxidase
7 Sobic.009G070900 - -
8 Sobic.003G440400 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
9 Sobic.006G195200 purine permease, putative, expressed -
10 Sobic.010G244600 nifU, putative, expressed -
11 Sobic.004G033900 expressed protein -
12 Sobic.004G072000 ribosome, putative, expressed -
13 Sobic.003G309600 wax synthase, putative, expressed -
14 Sobic.006G278500 class I glutamine amidotransferase, putative, expressed K01951: guaA, GMP synthase (glutamine-hydrolysing)
15 Sobic.001G115800 expressed protein -
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17 Sobic.004G186600 cytokinin-O-glucosyltransferase 2, putative, expressed -
18 Sobic.003G179100 protein binding protein, putative, expressed K12821: PRPF40, pre-mRNA-processing factor 40
19 Sobic.006G162700 - -
20 Sobic.007G105800 AIR12, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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