Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G110500.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YP05
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G254700 ternary complex factor MIP1, putative, expressed -
2 Sobic.005G057401 - -
3 Sobic.003G043900 kinesin-4, putative, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
4 Sobic.005G091100 - -
5 Sobic.004G252200 BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 precursor, putative, expressed -
6 Sobic.010G098700 hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, putative, expressed K10773: endonuclease III
7 Sobic.001G016800 protein binding protein, putative, expressed K11271: DSCC1, sister chromatid cohesion protein DCC1
8 Sobic.001G109700 expressed protein K19001: HELLS, ATP-dependent DNA helicase
9 Sobic.002G142200 expressed protein -
10 Sobic.007G124700 - -
11 Sobic.002G070901 - -
12 Sobic.004G020600 ATXR, putative, expressed -
13 Sobic.001G160400 integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed -
14 Sobic.007G111700 glutathione S-transferase, C-terminal domain containing protein, expressed -
15 Sobic.007G206250 - -
16 Sobic.005G041400 expressed protein -
17 Sobic.001G292100 expressed protein -
18 Sobic.009G098000 expressed protein -
19 Sobic.001G526500 transmembrane 9 superfamily member, putative, expressed K17086: transmembrane 9 superfamily member 2/4
20 Sobic.002G273400 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, expression induced by IAA treatment"(PubMedID : 20499123)@OsIAA26 - Auxin-responsive Aux/IAA gene family member, expressed K14484: auxin-responsive protein IAA


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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