Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G118900.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RM01
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G214900 receptor kinase, putative, expressed -
2 Sobic.008G026700 expressed protein -
3 Sobic.004G132600 aminotransferase, putative, expressed K11717: cysteine desulfurase / selenocysteine lyase
4 Sobic.005G183400 resistance protein, putative, expressed -
5 Sobic.010G127300 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
6 Sobic.004G125200 - -
7 Sobic.010G208800 kinase, putative, expressed -
8 Sobic.006G147300 -(PubMedID : 26465154)@expressed protein -
9 Sobic.009G029001 - -
10 Sobic.002G064000 expressed protein -
11 Sobic.005G165500 OsSub17 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
12 Sobic.006G272900 peroxidase activity(PubMedID : 29491869)@glutathione peroxidase, putative, expressed K00432: gpx, btuE, glutathione peroxidase
13 Sobic.001G068301 - K16189: phytochrome-interacting factor 4
14 Sobic.002G112400 PGR5-LIKE A(PubMedID : 26465154)@expressed protein -
15 Sobic.003G284800 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
16 Sobic.004G071800 - -
17 Sobic.003G435800 Pheophorbide a oxygenase family protein with Rieske [2Fe-2S] domain(PubMedID : 26465154)@Pheophorbide a oxygenase family protein with Rieske [2Fe-2S] domain(PubMedID : 26465154)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@chlorophyllide a oxygenase, chloroplast precursor, putative, expressed K13600: chlorophyllide a oxygenase
18 Sobic.001G003200 RNApolymerase sigma-subunit F(PubMedID : 26465154)@RNA polymerase sigma factor, putative, expressed K03086: RNA polymerase primary sigma factor
19 Sobic.001G283700 acyltransferase, putative, expressed K00630: glycerol-3-phosphate O-acyltransferase
20 Sobic.002G219366 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G118900 Sobic004G118900 Sobic004G214900 Sobic004G214900 Sobic004G118900--Sobic004G214900 Sobic008G026700 Sobic008G026700 Sobic004G118900--Sobic008G026700 Sobic004G132600 Sobic004G132600 Sobic004G118900--Sobic004G132600 Sobic005G183400 Sobic005G183400 Sobic004G118900--Sobic005G183400 Sobic010G127300 Sobic010G127300 Sobic004G118900--Sobic010G127300 Sobic004G125200 Sobic004G125200 Sobic004G118900--Sobic004G125200 Sobic010G208800 Sobic010G208800 Sobic004G118900--Sobic010G208800 Sobic006G147300 Sobic006G147300 Sobic004G118900--Sobic006G147300 Sobic009G029001 Sobic009G029001 Sobic004G118900--Sobic009G029001 Sobic004G214900--Sobic004G125200 Sobic004G214900--Sobic005G183400 Sobic004G214900--Sobic004G118900 Sobic009G244300 Sobic009G244300 Sobic004G214900--Sobic009G244300 Sobic007G034300 Sobic007G034300 Sobic004G214900--Sobic007G034300 Sobic001G068301 Sobic001G068301 Sobic004G214900--Sobic001G068301 Sobic004G214900--Sobic006G147300 Sobic003G231800 Sobic003G231800 Sobic004G214900--Sobic003G231800 Sobic004G214900--Sobic004G132600 Sobic006G260800 Sobic006G260800 Sobic008G026700--Sobic006G260800 Sobic009G125400 Sobic009G125400 Sobic008G026700--Sobic009G125400 Sobic006G272900 Sobic006G272900 Sobic008G026700--Sobic006G272900 Sobic005G165500 Sobic005G165500 Sobic008G026700--Sobic005G165500 Sobic007G009200 Sobic007G009200 Sobic008G026700--Sobic007G009200 Sobic008G026700--Sobic004G118900 Sobic002G324500 Sobic002G324500 Sobic008G026700--Sobic002G324500 Sobic002G232200 Sobic002G232200 Sobic008G026700--Sobic002G232200 Sobic010G201700 Sobic010G201700 Sobic008G026700--Sobic010G201700 Sobic004G132600--Sobic004G125200 Sobic004G132600--Sobic005G183400 Sobic004G132600--Sobic009G029001 Sobic002G064000 Sobic002G064000 Sobic004G132600--Sobic002G064000 Sobic004G071800 Sobic004G071800 Sobic004G132600--Sobic004G071800 Sobic004G132600--Sobic004G118900 Sobic004G132600--Sobic006G147300 Sobic004G343300 Sobic004G343300 Sobic004G132600--Sobic004G343300 Sobic004G132600--Sobic004G214900 Sobic005G183400--Sobic004G214900 Sobic002G211000 Sobic002G211000 Sobic005G183400--Sobic002G211000 Sobic005G183400--Sobic006G147300 Sobic005G183400--Sobic004G125200 Sobic005G183400--Sobic006G272900 Sobic005G183400--Sobic007G034300 Sobic007G071500 Sobic007G071500 Sobic005G183400--Sobic007G071500 Sobic005G183400--Sobic009G029001 Sobic004G051100 Sobic004G051100 Sobic005G183400--Sobic004G051100 Sobic003G245800 Sobic003G245800 Sobic010G127300--Sobic003G245800 Sobic003G439600 Sobic003G439600 Sobic010G127300--Sobic003G439600 Sobic010G127300--Sobic004G118900 Sobic010G127300--Sobic010G208800 Sobic002G250100 Sobic002G250100 Sobic010G127300--Sobic002G250100 Sobic006G197700 Sobic006G197700 Sobic010G127300--Sobic006G197700 Sobic005G138600 Sobic005G138600 Sobic010G127300--Sobic005G138600 Sobic002G331800 Sobic002G331800 Sobic010G127300--Sobic002G331800 Sobic003G284800 Sobic003G284800 Sobic010G127300--Sobic003G284800 Sobic004G125200--Sobic004G214900 Sobic004G125200--Sobic004G071800 Sobic004G125200--Sobic004G132600 Sobic004G125200--Sobic002G064000 Sobic004G125200--Sobic006G147300 Sobic004G125200--Sobic005G183400 Sobic004G026700 Sobic004G026700 Sobic004G125200--Sobic004G026700 Sobic004G272600 Sobic004G272600 Sobic004G125200--Sobic004G272600 Sobic003G097800 Sobic003G097800 Sobic004G125200--Sobic003G097800 Sobic001G535700 Sobic001G535700 Sobic010G208800--Sobic001G535700 Sobic001G128600 Sobic001G128600 Sobic010G208800--Sobic001G128600 Sobic006G265900 Sobic006G265900 Sobic010G208800--Sobic006G265900 Sobic002G061900 Sobic002G061900 Sobic010G208800--Sobic002G061900 Sobic006G025500 Sobic006G025500 Sobic010G208800--Sobic006G025500 Sobic002G112400 Sobic002G112400 Sobic010G208800--Sobic002G112400 Sobic009G175500 Sobic009G175500 Sobic010G208800--Sobic009G175500 Sobic004G124400 Sobic004G124400 Sobic010G208800--Sobic004G124400 Sobic004G359600 Sobic004G359600 Sobic010G208800--Sobic004G359600 Sobic007G207800 Sobic007G207800 Sobic006G147300--Sobic007G207800 Sobic008G066100 Sobic008G066100 Sobic006G147300--Sobic008G066100 Sobic003G359100 Sobic003G359100 Sobic006G147300--Sobic003G359100 Sobic002G030500 Sobic002G030500 Sobic006G147300--Sobic002G030500 Sobic004G035500 Sobic004G035500 Sobic006G147300--Sobic004G035500 Sobic002G098800 Sobic002G098800 Sobic006G147300--Sobic002G098800 Sobic003G199800 Sobic003G199800 Sobic006G147300--Sobic003G199800 Sobic006G147300--Sobic004G272600 Sobic003G435800 Sobic003G435800 Sobic006G147300--Sobic003G435800 Sobic009G029001--Sobic002G211000 Sobic009G029001--Sobic007G207800 Sobic009G029001--Sobic005G183400 Sobic001G242600 Sobic001G242600 Sobic009G029001--Sobic001G242600 Sobic004G227200 Sobic004G227200 Sobic009G029001--Sobic004G227200 Sobic007G223500 Sobic007G223500 Sobic009G029001--Sobic007G223500 Sobic009G029001--Sobic004G132600 Sobic001G517700 Sobic001G517700 Sobic009G029001--Sobic001G517700 Sobic007G053800 Sobic007G053800 Sobic009G029001--Sobic007G053800
Octagon: transcription factors


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