Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G184800.1
Synonym Sb04g023370
Functional annotation -
UniProt C5XV10
Pfam -
Panther DB PTHR36721
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031661
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G256100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@UDP-glucuronate 4-epimerase, putative, expressed K08679: UDP-glucuronate 4-epimerase
2 Sobic.006G278100 expressed protein -
3 Sobic.003G122100 FAD binding domain containing protein, expressed K10960: chlP, geranylgeranyl diphosphate/geranylgeranyl-bacteriochlorophyllide a reductase
4 Sobic.009G009000 terpene synthase, putative, expressed -
5 Sobic.004G263000 expressed protein -
6 Sobic.010G258500 arogenate dehydrogenase 1, chloroplast precursor, putative, expressed -
7 Sobic.009G232200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@fasciclin domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G533000 expressed protein -
9 Sobic.004G182500 NAD binding domain of 6-phosphogluconate dehydrogenase containing protein, expressed K18121: glyoxylate/succinic semialdehyde reductase
10 Sobic.002G360301 - -
11 Sobic.005G099500 nucleoside-triphosphatase, putative, expressed K14641: apyrase
12 Sobic.005G047500 expressed protein -
13 Sobic.003G015400 ribosomal protein S6 family protein, putative, expressed K02990: RP-S6, MRPS6, small subunit ribosomal protein S6
14 Sobic.004G047400 uncharacterized protein CPn_0526/CP_0226/CPj0526/CpB0547, putative, expressed K06041: kdsD, arabinose-5-phosphate isomerase
15 Sobic.001G334900 X8 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.006G054700 serine/threonine-protein kinase NAK, putative, expressed K13430: serine/threonine-protein kinase PBS1
17 Sobic.002G287750 - -
18 Sobic.001G215500 expressed protein -
19 Sobic.002G338400 uncharacterized secreted protein, putative, expressed -
20 Sobic.006G201400 seed specific protein Bn15D1B, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G184800 Sobic004G184800 Sobic002G256100 Sobic002G256100 Sobic004G184800--Sobic002G256100 Sobic006G278100 Sobic006G278100 Sobic004G184800--Sobic006G278100 Sobic003G122100 Sobic003G122100 Sobic004G184800--Sobic003G122100 Sobic009G009000 Sobic009G009000 Sobic004G184800--Sobic009G009000 Sobic004G263000 Sobic004G263000 Sobic004G184800--Sobic004G263000 Sobic010G258500 Sobic010G258500 Sobic004G184800--Sobic010G258500 Sobic009G232200 Sobic009G232200 Sobic004G184800--Sobic009G232200 Sobic001G533000 Sobic001G533000 Sobic004G184800--Sobic001G533000 Sobic004G182500 Sobic004G182500 Sobic004G184800--Sobic004G182500 Sobic002G256100--Sobic001G533000 Sobic002G256100--Sobic009G009000 Sobic010G238100 Sobic010G238100 Sobic002G256100--Sobic010G238100 Sobic004G262400 Sobic004G262400 Sobic002G256100--Sobic004G262400 Sobic002G119900 Sobic002G119900 Sobic002G256100--Sobic002G119900 Sobic003G379600 Sobic003G379600 Sobic002G256100--Sobic003G379600 Sobic010G163732 Sobic010G163732 Sobic002G256100--Sobic010G163732 Sobic002G256100--Sobic004G184800 Sobic001G281300 Sobic001G281300 Sobic002G256100--Sobic001G281300 Sobic007G150800 Sobic007G150800 Sobic006G278100--Sobic007G150800 Sobic001G107100 Sobic001G107100 Sobic006G278100--Sobic001G107100 Sobic002G128800 Sobic002G128800 Sobic006G278100--Sobic002G128800 Sobic003G250700 Sobic003G250700 Sobic006G278100--Sobic003G250700 Sobic006G278100--Sobic009G232200 Sobic002G338400 Sobic002G338400 Sobic006G278100--Sobic002G338400 Sobic003G122200 Sobic003G122200 Sobic006G278100--Sobic003G122200 Sobic006G191700 Sobic006G191700 Sobic006G278100--Sobic006G191700 Sobic001G261549 Sobic001G261549 Sobic006G278100--Sobic001G261549 Sobic002G428900 Sobic002G428900 Sobic003G122100--Sobic002G428900 Sobic009G214800 Sobic009G214800 Sobic003G122100--Sobic009G214800 Sobic005G080050 Sobic005G080050 Sobic003G122100--Sobic005G080050 Sobic003G016400 Sobic003G016400 Sobic003G122100--Sobic003G016400 Sobic010G168000 Sobic010G168000 Sobic003G122100--Sobic010G168000 Sobic005G071800 Sobic005G071800 Sobic003G122100--Sobic005G071800 Sobic003G248300 Sobic003G248300 Sobic003G122100--Sobic003G248300 Sobic002G287750 Sobic002G287750 Sobic003G122100--Sobic002G287750 Sobic003G122100--Sobic004G184800 Sobic004G024300 Sobic004G024300 Sobic009G009000--Sobic004G024300 Sobic006G189700 Sobic006G189700 Sobic009G009000--Sobic006G189700 Sobic002G388700 Sobic002G388700 Sobic009G009000--Sobic002G388700 Sobic009G009000--Sobic002G256100 Sobic009G196300 Sobic009G196300 Sobic009G009000--Sobic009G196300 Sobic009G009000--Sobic002G119900 Sobic009G009000--Sobic004G262400 Sobic009G009000--Sobic001G533000 Sobic001G502500 Sobic001G502500 Sobic009G009000--Sobic001G502500 Sobic001G127700 Sobic001G127700 Sobic004G263000--Sobic001G127700 Sobic004G060700 Sobic004G060700 Sobic004G263000--Sobic004G060700 Sobic007G009600 Sobic007G009600 Sobic004G263000--Sobic007G009600 Sobic007G170800 Sobic007G170800 Sobic004G263000--Sobic007G170800 Sobic008G123600 Sobic008G123600 Sobic004G263000--Sobic008G123600 Sobic006G172700 Sobic006G172700 Sobic004G263000--Sobic006G172700 Sobic001G003600 Sobic001G003600 Sobic004G263000--Sobic001G003600 Sobic002G329500 Sobic002G329500 Sobic004G263000--Sobic002G329500 Sobic009G115050 Sobic009G115050 Sobic004G263000--Sobic009G115050 Sobic008G178800 Sobic008G178800 Sobic010G258500--Sobic008G178800 Sobic006G038200 Sobic006G038200 Sobic010G258500--Sobic006G038200 Sobic003G216500 Sobic003G216500 Sobic010G258500--Sobic003G216500 Sobic010G258500--Sobic004G182500 Sobic010G258500--Sobic009G232200 Sobic007G130800 Sobic007G130800 Sobic010G258500--Sobic007G130800 Sobic002G075500 Sobic002G075500 Sobic010G258500--Sobic002G075500 Sobic006G237200 Sobic006G237200 Sobic010G258500--Sobic006G237200 Sobic001G436100 Sobic001G436100 Sobic010G258500--Sobic001G436100 Sobic001G334900 Sobic001G334900 Sobic009G232200--Sobic001G334900 Sobic002G347300 Sobic002G347300 Sobic009G232200--Sobic002G347300 Sobic009G232200--Sobic002G338400 Sobic009G232200--Sobic006G278100 Sobic006G075000 Sobic006G075000 Sobic009G232200--Sobic006G075000 Sobic004G168700 Sobic004G168700 Sobic009G232200--Sobic004G168700 Sobic002G072200 Sobic002G072200 Sobic009G232200--Sobic002G072200 Sobic009G032600 Sobic009G032600 Sobic009G232200--Sobic009G032600 Sobic002G252000 Sobic002G252000 Sobic009G232200--Sobic002G252000 Sobic001G533000--Sobic003G379600 Sobic006G137800 Sobic006G137800 Sobic001G533000--Sobic006G137800 Sobic004G345500 Sobic004G345500 Sobic001G533000--Sobic004G345500 Sobic007G198000 Sobic007G198000 Sobic001G533000--Sobic007G198000 Sobic001G529400 Sobic001G529400 Sobic001G533000--Sobic001G529400 Sobic003G078200 Sobic003G078200 Sobic001G533000--Sobic003G078200 Sobic010G047100 Sobic010G047100 Sobic001G533000--Sobic010G047100 Sobic004G171400 Sobic004G171400 Sobic001G533000--Sobic004G171400 Sobic003G160700 Sobic003G160700 Sobic001G533000--Sobic003G160700 Sobic004G182500--Sobic003G216500 Sobic003G103400 Sobic003G103400 Sobic004G182500--Sobic003G103400 Sobic002G073800 Sobic002G073800 Sobic004G182500--Sobic002G073800 Sobic008G093200 Sobic008G093200 Sobic004G182500--Sobic008G093200 Sobic004G182500--Sobic010G258500 Sobic001G376700 Sobic001G376700 Sobic004G182500--Sobic001G376700 Sobic006G281200 Sobic006G281200 Sobic004G182500--Sobic006G281200 Sobic003G325500 Sobic003G325500 Sobic004G182500--Sobic003G325500 Sobic001G215500 Sobic001G215500 Sobic004G182500--Sobic001G215500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.