Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G215500.1
Synonym Sb01g018990
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WYB8
Pfam -
Panther DB PTHR35107 PTHR35107:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G65720 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g34270.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017588 , Zm00025a006560
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G215500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G207100 enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein, putative, expressed -
2 Sobic.004G006700 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
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9 Sobic.006G195400 expressed protein -
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11 Sobic.001G296400 palmitoyl-protein thioesterase 1 precursor, putative, expressed K01074: palmitoyl-protein thioesterase
12 Sobic.002G228200 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
13 Sobic.003G071600 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase, putative, expressed K10258: TER, TSC13, very-long-chain enoyl-CoA reductase
14 Sobic.009G188300 universal stress protein domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.006G274866 - -
16 Sobic.006G188800 H-BTB3 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with H family conserved sequence, expressed -
17 Sobic.003G103400 anaphase-promoting complex subunit 11, putative, expressed K03868: RBX1, RING-box protein 1
18 Sobic.003G052600 - -
19 Sobic.003G158700 exocyst complex component 6, putative, expressed -
20 Sobic.010G229600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G215500 Sobic001G215500 Sobic009G207100 Sobic009G207100 Sobic001G215500--Sobic009G207100 Sobic004G006700 Sobic004G006700 Sobic001G215500--Sobic004G006700 Sobic008G093200 Sobic008G093200 Sobic001G215500--Sobic008G093200 Sobic010G224900 Sobic010G224900 Sobic001G215500--Sobic010G224900 Sobic004G182500 Sobic004G182500 Sobic001G215500--Sobic004G182500 Sobic004G027000 Sobic004G027000 Sobic001G215500--Sobic004G027000 Sobic001G202400 Sobic001G202400 Sobic001G215500--Sobic001G202400 Sobic004G225300 Sobic004G225300 Sobic001G215500--Sobic004G225300 Sobic006G195400 Sobic006G195400 Sobic001G215500--Sobic006G195400 Sobic002G133100 Sobic002G133100 Sobic009G207100--Sobic002G133100 Sobic009G207100--Sobic001G215500 Sobic007G171950 Sobic007G171950 Sobic009G207100--Sobic007G171950 Sobic009G207100--Sobic001G202400 Sobic005G055000 Sobic005G055000 Sobic009G207100--Sobic005G055000 Sobic002G333100 Sobic002G333100 Sobic009G207100--Sobic002G333100 Sobic001G263000 Sobic001G263000 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Octagon: transcription factors


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