Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G192450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RNF1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK00042
Barley -
Wheat TraesCS3D02G055500 , TraesCS3B02G068000 , TraesCS3B02G068000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G323300 expressed protein -
2 Sobic.010G135300 expressed protein -
3 Sobic.008G080500 expressed protein -
4 Sobic.007G036500 - -
5 Sobic.004G189700 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
6 Sobic.006G061000 pentatricopeptide repeat-containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G268900 flap endonuclease, putative, expressed K15338: GEN1, flap endonuclease GEN
8 Sobic.002G033600 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
9 Sobic.010G237650 - -
10 Sobic.009G129600 ABTB1 - Armadillo repeats with a Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain, expressed -
11 Sobic.003G299500 expressed protein -
12 Sobic.002G279500 NTMC2Type1.2 protein, putative, expressed -
13 Sobic.001G424600 digalactosyldiacylglycerol synthase, chloroplast precursor, putative, expressed K09480: digalactosyldiacylglycerol synthase
14 Sobic.002G014800 expressed protein -
15 Sobic.003G077500 expressed protein -
16 Sobic.009G101000 - -
17 Sobic.009G108600 drought induced 19 protein, putative, expressed -
18 Sobic.008G090300 - -
19 Sobic.009G102000 OsFBX9 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.007G139400 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G192450 Sobic004G192450 Sobic003G323300 Sobic003G323300 Sobic004G192450--Sobic003G323300 Sobic010G135300 Sobic010G135300 Sobic004G192450--Sobic010G135300 Sobic008G080500 Sobic008G080500 Sobic004G192450--Sobic008G080500 Sobic007G036500 Sobic007G036500 Sobic004G192450--Sobic007G036500 Sobic004G189700 Sobic004G189700 Sobic004G192450--Sobic004G189700 Sobic006G061000 Sobic006G061000 Sobic004G192450--Sobic006G061000 Sobic002G268900 Sobic002G268900 Sobic004G192450--Sobic002G268900 Sobic002G033600 Sobic002G033600 Sobic004G192450--Sobic002G033600 Sobic010G237650 Sobic010G237650 Sobic004G192450--Sobic010G237650 Sobic009G141700 Sobic009G141700 Sobic003G323300--Sobic009G141700 Sobic003G323300--Sobic008G080500 Sobic006G067700 Sobic006G067700 Sobic003G323300--Sobic006G067700 Sobic007G125700 Sobic007G125700 Sobic003G323300--Sobic007G125700 Sobic001G395200 Sobic001G395200 Sobic003G323300--Sobic001G395200 Sobic002G430900 Sobic002G430900 Sobic003G323300--Sobic002G430900 Sobic009G259900 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Octagon: transcription factors


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