Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G189700.1
Synonym Sb04g023790
Functional annotation OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed
UniProt C5XVP3
Pfam -
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF131
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02910.1 : OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G077770.2 , HORVU5Hr1G077770.1
Wheat TraesCS5D02G461200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G022500 OsFBD9 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
2 Sobic.006G022400 F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@OsFBD9 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
3 Sobic.008G090300 - -
4 Sobic.005G177900 HVA22, putative, expressed K17279: receptor expression-enhancing protein 5/6
5 Sobic.003G397100 lysine ketoglutarate reductase trans-splicing related 1, putative, expressed -
6 Sobic.002G268900 flap endonuclease, putative, expressed K15338: GEN1, flap endonuclease GEN
7 Sobic.003G077500 expressed protein -
8 Sobic.001G499200 PLAC8 family protein, expressed -
9 Sobic.001G065300 GRF zinc finger family protein, expressed -
10 Sobic.001G212600 a_IG002N01.7, putative, expressed -
11 Sobic.001G522400 FHA domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G223300 nucleoporin p58/p45, putative, expressed K14307: NUPL1, nucleoporin p58/p45
13 Sobic.009G216500 expressed protein -
14 Sobic.008G099500 - -
15 Sobic.004G278900 regulatory protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G411700 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
17 Sobic.001G372900 expressed protein K08819: cyclin-dependent kinase 12/13
18 Sobic.010G237650 - -
19 Sobic.003G304800 OsRhmbd4 - Putative Rhomboid homologue, expressed -
20 Sobic.006G126600 Trihelix Family(PubMedID : 24864043)@MYB family transcription factor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G189700 Sobic004G189700 Sobic006G022500 Sobic006G022500 Sobic004G189700--Sobic006G022500 Sobic006G022400 Sobic006G022400 Sobic004G189700--Sobic006G022400 Sobic008G090300 Sobic008G090300 Sobic004G189700--Sobic008G090300 Sobic005G177900 Sobic005G177900 Sobic004G189700--Sobic005G177900 Sobic003G397100 Sobic003G397100 Sobic004G189700--Sobic003G397100 Sobic002G268900 Sobic002G268900 Sobic004G189700--Sobic002G268900 Sobic003G077500 Sobic003G077500 Sobic004G189700--Sobic003G077500 Sobic001G499200 Sobic001G499200 Sobic004G189700--Sobic001G499200 Sobic001G065300 Sobic001G065300 Sobic004G189700--Sobic001G065300 Sobic004G227500 Sobic004G227500 Sobic006G022500--Sobic004G227500 Sobic004G148600 Sobic004G148600 Sobic006G022500--Sobic004G148600 Sobic001G384600 Sobic001G384600 Sobic006G022500--Sobic001G384600 Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic006G022500--Sobic002G073300 Sobic002G060450 Sobic002G060450 Sobic006G022500--Sobic002G060450 Sobic006G022500--Sobic004G189700 Sobic001G045700 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Octagon: transcription factors


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