Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G194800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YRR1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G058000 - -
2 Sobic.009G157300 Probable beta-D-xylosidase 2 (Precursor)(PubMedID : 26186930)@periplasmic beta-glucosidase precursor, putative, expressed K05349: beta-glucosidase
3 Sobic.001G288601 - -
4 Sobic.007G003000 no apical meristem protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G146150 - -
6 Sobic.005G115600 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, putative, expressed K00033: PGD, gnd, 6-phosphogluconate dehydrogenase
7 Sobic.005G093500 expressed protein -
8 Sobic.001G243100 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene dioxygenase protein, putative, expressed K08967: mtnD, mtnZ, 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene dioxygenase
9 Sobic.003G279800 plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein, putative, expressed K13199: plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein
10 Sobic.001G392000 WD40-like Beta Propeller Repeat family protein, expressed -
11 Sobic.003G270000 - -
12 Sobic.005G071800 - -
13 Sobic.005G005800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@laccase-23 precursor, putative, expressed K05909: laccase
14 Sobic.003G105000 kinase, pfkB family, putative, expressed -
15 Sobic.010G067500 OsSCP32 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II
16 Sobic.005G112000 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.004G193600 - -
18 Sobic.002G145300 ZOS7-13 - C2H2 zinc finger protein, expressed K11436: type I protein arginine methyltransferase
19 Sobic.005G205550 - -
20 Sobic.005G012800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G194800 Sobic004G194800 Sobic001G058000 Sobic001G058000 Sobic004G194800--Sobic001G058000 Sobic009G157300 Sobic009G157300 Sobic004G194800--Sobic009G157300 Sobic001G288601 Sobic001G288601 Sobic004G194800--Sobic001G288601 Sobic007G003000 Sobic007G003000 Sobic004G194800--Sobic007G003000 Sobic004G146150 Sobic004G146150 Sobic004G194800--Sobic004G146150 Sobic005G115600 Sobic005G115600 Sobic004G194800--Sobic005G115600 Sobic005G093500 Sobic005G093500 Sobic004G194800--Sobic005G093500 Sobic001G243100 Sobic001G243100 Sobic004G194800--Sobic001G243100 Sobic003G279800 Sobic003G279800 Sobic004G194800--Sobic003G279800 Sobic004G072400 Sobic004G072400 Sobic001G058000--Sobic004G072400 Sobic009G133100 Sobic009G133100 Sobic001G058000--Sobic009G133100 Sobic004G233900 Sobic004G233900 Sobic001G058000--Sobic004G233900 Sobic001G364200 Sobic001G364200 Sobic001G058000--Sobic001G364200 Sobic009G190900 Sobic009G190900 Sobic001G058000--Sobic009G190900 Sobic005G050900 Sobic005G050900 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Octagon: transcription factors


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