Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G276300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YRW6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G222250 - -
2 Sobic.003G109700 expressed protein -
3 Sobic.004G021200 expressed protein -
4 Sobic.001G186800 ATPAP18/PAP18, putative, expressed -
5 Sobic.009G017400 "gsn1/LARGE8(Ortholog in rice:Gou et al., 2018(PubMedID : 31659915)@dual specificity protein phosphatase, putative, expressed -
6 Sobic.007G182200 - -
7 Sobic.002G313400 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12815: DHX38, pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX38/PRP16
8 Sobic.010G175500 expressed protein -
9 Sobic.009G215800 OsFBX173 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.001G002100 - -
11 Sobic.008G011100 OsNucAP2 - Putative Nucleoporin Autopeptidase homologue, expressed -
12 Sobic.005G084400 la domain containing protein, expressed K15191: La-related protein 7
13 Sobic.004G030100 glycosyltransferase, putative, expressed -
14 Sobic.003G144950 - -
15 Sobic.001G191600 TMS membrane protein/tumour differentially expressed protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G260900 protein kinase domain containing protein, expressed K13429: chitin elicitor receptor kinase 1
17 Sobic.008G125600 - -
18 Sobic.009G103600 MEE12, putative, expressed -
19 Sobic.010G005600 SEC14 cytosolic factor family protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G031400 OsFBL39 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G276300 Sobic004G276300 Sobic001G222250 Sobic001G222250 Sobic004G276300--Sobic001G222250 Sobic003G109700 Sobic003G109700 Sobic004G276300--Sobic003G109700 Sobic004G021200 Sobic004G021200 Sobic004G276300--Sobic004G021200 Sobic001G186800 Sobic001G186800 Sobic004G276300--Sobic001G186800 Sobic009G017400 Sobic009G017400 Sobic004G276300--Sobic009G017400 Sobic007G182200 Sobic007G182200 Sobic004G276300--Sobic007G182200 Sobic002G313400 Sobic002G313400 Sobic004G276300--Sobic002G313400 Sobic010G175500 Sobic010G175500 Sobic004G276300--Sobic010G175500 Sobic009G215800 Sobic009G215800 Sobic004G276300--Sobic009G215800 Sobic010G143800 Sobic010G143800 Sobic001G222250--Sobic010G143800 Sobic005G027400 Sobic005G027400 Sobic001G222250--Sobic005G027400 Sobic010G079900 Sobic010G079900 Sobic001G222250--Sobic010G079900 Sobic004G135300 Sobic004G135300 Sobic001G222250--Sobic004G135300 Sobic001G191600 Sobic001G191600 Sobic001G222250--Sobic001G191600 Sobic001G222250--Sobic003G109700 Sobic001G081200 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Octagon: transcription factors


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