Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G008201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RG24
Pfam PF00248
Panther DB PTHR11732 PTHR11732:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G60730 : NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g26910.1 : oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2A02G274700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G214900 receptor kinase, putative, expressed -
2 Sobic.004G125200 - -
3 Sobic.005G183400 resistance protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G068301 - K16189: phytochrome-interacting factor 4
5 Sobic.003G096900 resistance-related receptor-like kinase, putative, expressed -
6 Sobic.002G132801 - -
7 Sobic.003G097800 - -
8 Sobic.010G127300 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
9 Sobic.005G175600 TKL_IRAK_DUF26-lc.24 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
10 Sobic.004G118900 - -
11 Sobic.003G058001 - -
12 Sobic.005G065500 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@cysteine protease 1 precursor, putative, expressed -
13 Sobic.004G132600 aminotransferase, putative, expressed K11717: cysteine desulfurase / selenocysteine lyase
14 Sobic.005G220900 expressed protein -
15 Sobic.004G223500 OsWAK14 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
16 Sobic.004G071800 - -
17 Sobic.005G193500 receptor-like kinase, putative, expressed -
18 Sobic.009G202400 expressed protein -
19 Sobic.003G209900 Chorophyll a/b binding protein 2(PubMedID : 26186930)@Chlorophyll a/b-binding protein(PubMedID : 26317421)@Protein chlorophyll a-b binding protein 2 (Os)(PubMedID : 27208977)@chlorophyll A-B binding protein, putative, expressed K08912: light-harvesting complex II chlorophyll a/b binding protein 1
20 Sobic.010G157000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G008201 Sobic005G008201 Sobic004G214900 Sobic004G214900 Sobic005G008201--Sobic004G214900 Sobic004G125200 Sobic004G125200 Sobic005G008201--Sobic004G125200 Sobic005G183400 Sobic005G183400 Sobic005G008201--Sobic005G183400 Sobic001G068301 Sobic001G068301 Sobic005G008201--Sobic001G068301 Sobic003G096900 Sobic003G096900 Sobic005G008201--Sobic003G096900 Sobic002G132801 Sobic002G132801 Sobic005G008201--Sobic002G132801 Sobic003G097800 Sobic003G097800 Sobic005G008201--Sobic003G097800 Sobic010G127300 Sobic010G127300 Sobic005G008201--Sobic010G127300 Sobic005G175600 Sobic005G175600 Sobic005G008201--Sobic005G175600 Sobic004G214900--Sobic004G125200 Sobic004G214900--Sobic005G183400 Sobic004G118900 Sobic004G118900 Sobic004G214900--Sobic004G118900 Sobic009G244300 Sobic009G244300 Sobic004G214900--Sobic009G244300 Sobic007G034300 Sobic007G034300 Sobic004G214900--Sobic007G034300 Sobic004G214900--Sobic001G068301 Sobic006G147300 Sobic006G147300 Sobic004G214900--Sobic006G147300 Sobic003G231800 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Octagon: transcription factors


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