Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G060300.1
Synonym Sb05g004910
Functional annotation -
UniProt C5Y638
Pfam -
Panther DB PTHR36322
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g07550.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034010
Brachypodium KQJ92040
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G416300 expressed protein -
2 Sobic.001G161300 mttA/Hcf106 family protein, putative, expressed K03116: sec-independent protein translocase protein TatA
3 Sobic.006G052200 nodulin, putative, expressed -
4 Sobic.005G064800 aldehyde dehydrogenase, putative, expressed K00128: aldehyde dehydrogenase (NAD+)
5 Sobic.002G226100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
6 Sobic.009G207100 enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.009G000900 methyltransferase, putative, expressed K08241: jasmonate O-methyltransferase
8 Sobic.003G291400 dehydrogenase, putative, expressed -
9 Sobic.001G276100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@peptide transporter PTR2, putative, expressed -
10 Sobic.005G089000 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
11 Sobic.003G402200 sensitivity to red light reduced protein 1, putative, expressed -
12 Sobic.001G475701 - -
13 Sobic.009G190800 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
14 Sobic.005G072200 lipase, putative, expressed -
15 Sobic.002G069050 - -
16 Sobic.003G151800 expressed protein -
17 Sobic.002G384400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@FAD dependent oxidoreductase domain containing protein, expressed K03146: THI4, cysteine-dependent adenosine diphosphate thiazole synthase
18 Sobic.004G007500 cytochrome P450, putative, expressed K10528: hydroperoxide lyase
19 Sobic.010G265500 expressed protein -
20 Sobic.005G021600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G060300 Sobic005G060300 Sobic001G416300 Sobic001G416300 Sobic005G060300--Sobic001G416300 Sobic001G161300 Sobic001G161300 Sobic005G060300--Sobic001G161300 Sobic006G052200 Sobic006G052200 Sobic005G060300--Sobic006G052200 Sobic005G064800 Sobic005G064800 Sobic005G060300--Sobic005G064800 Sobic002G226100 Sobic002G226100 Sobic005G060300--Sobic002G226100 Sobic009G207100 Sobic009G207100 Sobic005G060300--Sobic009G207100 Sobic009G000900 Sobic009G000900 Sobic005G060300--Sobic009G000900 Sobic003G291400 Sobic003G291400 Sobic005G060300--Sobic003G291400 Sobic001G276100 Sobic001G276100 Sobic005G060300--Sobic001G276100 Sobic006G170200 Sobic006G170200 Sobic001G416300--Sobic006G170200 Sobic001G416300--Sobic001G161300 Sobic001G416300--Sobic002G226100 Sobic001G427700 Sobic001G427700 Sobic001G416300--Sobic001G427700 Sobic004G018400 Sobic004G018400 Sobic001G416300--Sobic004G018400 Sobic009G190800 Sobic009G190800 Sobic001G416300--Sobic009G190800 Sobic003G402200 Sobic003G402200 Sobic001G416300--Sobic003G402200 Sobic005G089000 Sobic005G089000 Sobic001G416300--Sobic005G089000 Sobic008G142600 Sobic008G142600 Sobic001G416300--Sobic008G142600 Sobic002G038300 Sobic002G038300 Sobic001G161300--Sobic002G038300 Sobic004G007500 Sobic004G007500 Sobic001G161300--Sobic004G007500 Sobic002G386400 Sobic002G386400 Sobic001G161300--Sobic002G386400 Sobic004G068700 Sobic004G068700 Sobic001G161300--Sobic004G068700 Sobic001G161300--Sobic001G276100 Sobic001G161300--Sobic002G226100 Sobic002G384400 Sobic002G384400 Sobic001G161300--Sobic002G384400 Sobic004G343100 Sobic004G343100 Sobic001G161300--Sobic004G343100 Sobic001G161300--Sobic009G000900 Sobic005G072200 Sobic005G072200 Sobic006G052200--Sobic005G072200 Sobic006G052200--Sobic001G161300 Sobic006G052200--Sobic003G402200 Sobic006G052200--Sobic001G276100 Sobic008G111300 Sobic008G111300 Sobic006G052200--Sobic008G111300 Sobic001G320700 Sobic001G320700 Sobic006G052200--Sobic001G320700 Sobic002G142066 Sobic002G142066 Sobic006G052200--Sobic002G142066 Sobic002G193400 Sobic002G193400 Sobic006G052200--Sobic002G193400 Sobic001G404500 Sobic001G404500 Sobic006G052200--Sobic001G404500 Sobic004G202700 Sobic004G202700 Sobic005G064800--Sobic004G202700 Sobic007G073700 Sobic007G073700 Sobic005G064800--Sobic007G073700 Sobic007G029100 Sobic007G029100 Sobic005G064800--Sobic007G029100 Sobic005G064800--Sobic009G190800 Sobic004G174100 Sobic004G174100 Sobic005G064800--Sobic004G174100 Sobic004G142800 Sobic004G142800 Sobic005G064800--Sobic004G142800 Sobic005G064800--Sobic001G416300 Sobic006G242000 Sobic006G242000 Sobic005G064800--Sobic006G242000 Sobic002G339500 Sobic002G339500 Sobic005G064800--Sobic002G339500 Sobic002G226100--Sobic001G161300 Sobic002G226100--Sobic004G068700 Sobic002G226100--Sobic002G386400 Sobic002G226100--Sobic002G384400 Sobic002G226100--Sobic001G276100 Sobic002G226100--Sobic001G416300 Sobic001G179100 Sobic001G179100 Sobic002G226100--Sobic001G179100 Sobic006G197700 Sobic006G197700 Sobic002G226100--Sobic006G197700 Sobic002G226100--Sobic008G111300 Sobic002G133100 Sobic002G133100 Sobic009G207100--Sobic002G133100 Sobic001G215500 Sobic001G215500 Sobic009G207100--Sobic001G215500 Sobic007G171950 Sobic007G171950 Sobic009G207100--Sobic007G171950 Sobic001G202400 Sobic001G202400 Sobic009G207100--Sobic001G202400 Sobic005G055000 Sobic005G055000 Sobic009G207100--Sobic005G055000 Sobic002G333100 Sobic002G333100 Sobic009G207100--Sobic002G333100 Sobic001G263000 Sobic001G263000 Sobic009G207100--Sobic001G263000 Sobic003G071600 Sobic003G071600 Sobic009G207100--Sobic003G071600 Sobic004G224700 Sobic004G224700 Sobic009G207100--Sobic004G224700 Sobic009G000900--Sobic004G007500 Sobic009G070800 Sobic009G070800 Sobic009G000900--Sobic009G070800 Sobic009G009500 Sobic009G009500 Sobic009G000900--Sobic009G009500 Sobic009G000900--Sobic001G161300 Sobic007G029000 Sobic007G029000 Sobic009G000900--Sobic007G029000 Sobic009G000900--Sobic001G276100 Sobic009G075100 Sobic009G075100 Sobic009G000900--Sobic009G075100 Sobic009G197300 Sobic009G197300 Sobic009G000900--Sobic009G197300 Sobic009G000900--Sobic004G343100 Sobic010G089200 Sobic010G089200 Sobic003G291400--Sobic010G089200 Sobic001G321600 Sobic001G321600 Sobic003G291400--Sobic001G321600 Sobic003G291400--Sobic005G089000 Sobic002G281000 Sobic002G281000 Sobic003G291400--Sobic002G281000 Sobic006G131800 Sobic006G131800 Sobic003G291400--Sobic006G131800 Sobic002G195700 Sobic002G195700 Sobic003G291400--Sobic002G195700 Sobic002G281800 Sobic002G281800 Sobic003G291400--Sobic002G281800 Sobic001G005500 Sobic001G005500 Sobic003G291400--Sobic001G005500 Sobic005G021600 Sobic005G021600 Sobic003G291400--Sobic005G021600 Sobic001G276100--Sobic001G161300 Sobic001G276100--Sobic009G000900 Sobic001G276100--Sobic004G007500 Sobic001G276100--Sobic002G226100 Sobic001G276100--Sobic009G197300 Sobic003G355800 Sobic003G355800 Sobic001G276100--Sobic003G355800 Sobic003G214000 Sobic003G214000 Sobic001G276100--Sobic003G214000 Sobic001G276100--Sobic006G052200 Sobic001G276100--Sobic002G384400
Octagon: transcription factors


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