Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G072600.1
Synonym Sb05g006020
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y6S6
Pfam -
Panther DB PTHR34964 PTHR34964:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g09030.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034134 , Zm00025a015622
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G348100 white-brown complex homolog protein, putative, expressed -
2 Sobic.010G130601 - -
3 Sobic.001G400000 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed K12448: UXE, UDP-arabinose 4-epimerase
4 Sobic.001G356200 nucleoside-triphosphatase, putative, expressed K01510: ENTPD1_3_8, apyrase
5 Sobic.004G253200 amino acid transporter, putative, expressed K14207: SLC38A2, solute carrier family 38 (sodium-coupled neutral amino acid transporter), member 2
6 Sobic.001G265100 - -
7 Sobic.010G189432 - -
8 Sobic.004G113600 protein phosphatase 2C, putative, expressed K17506: PPM1L, protein phosphatase 1L
9 Sobic.004G358000 CAMK_CAMK_like.16 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
10 Sobic.002G186200 ASC1, putative, expressed K04710: CERS1_2_3_4, ceramide synthetase
11 Sobic.003G024100 MRH1, putative, expressed -
12 Sobic.005G050400 syntaxin 6, putative, expressed -
13 Sobic.001G405100 BTBT1 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with tetratricopeptide repeats, expressed -
14 Sobic.003G441000 rhoGAP domain containing protein, expressed -
15 Sobic.008G120920 - -
16 Sobic.003G187700 polygalacturonase, putative, expressed -
17 Sobic.005G054150 - -
18 Sobic.004G120500 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
19 Sobic.001G342101 - -
20 Sobic.004G116400 OsFBK5 - F-box domain and kelch repeat containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G072600 Sobic005G072600 Sobic003G348100 Sobic003G348100 Sobic005G072600--Sobic003G348100 Sobic010G130601 Sobic010G130601 Sobic005G072600--Sobic010G130601 Sobic001G400000 Sobic001G400000 Sobic005G072600--Sobic001G400000 Sobic001G356200 Sobic001G356200 Sobic005G072600--Sobic001G356200 Sobic004G253200 Sobic004G253200 Sobic005G072600--Sobic004G253200 Sobic001G265100 Sobic001G265100 Sobic005G072600--Sobic001G265100 Sobic010G189432 Sobic010G189432 Sobic005G072600--Sobic010G189432 Sobic004G113600 Sobic004G113600 Sobic005G072600--Sobic004G113600 Sobic004G358000 Sobic004G358000 Sobic005G072600--Sobic004G358000 Sobic003G348100--Sobic001G400000 Sobic003G348100--Sobic004G253200 Sobic008G055600 Sobic008G055600 Sobic003G348100--Sobic008G055600 Sobic008G120920 Sobic008G120920 Sobic003G348100--Sobic008G120920 Sobic001G112600 Sobic001G112600 Sobic003G348100--Sobic001G112600 Sobic003G244400 Sobic003G244400 Sobic003G348100--Sobic003G244400 Sobic003G441000 Sobic003G441000 Sobic003G348100--Sobic003G441000 Sobic003G348100--Sobic010G189432 Sobic004G046800 Sobic004G046800 Sobic003G348100--Sobic004G046800 Sobic010G124900 Sobic010G124900 Sobic010G130601--Sobic010G124900 Sobic006G117700 Sobic006G117700 Sobic010G130601--Sobic006G117700 Sobic001G405100 Sobic001G405100 Sobic010G130601--Sobic001G405100 Sobic002G111100 Sobic002G111100 Sobic010G130601--Sobic002G111100 Sobic001G167600 Sobic001G167600 Sobic010G130601--Sobic001G167600 Sobic006G177700 Sobic006G177700 Sobic010G130601--Sobic006G177700 Sobic003G024100 Sobic003G024100 Sobic010G130601--Sobic003G024100 Sobic008G136601 Sobic008G136601 Sobic010G130601--Sobic008G136601 Sobic006G001100 Sobic006G001100 Sobic010G130601--Sobic006G001100 Sobic001G400000--Sobic004G113600 Sobic001G400000--Sobic001G112600 Sobic001G384200 Sobic001G384200 Sobic001G400000--Sobic001G384200 Sobic005G050400 Sobic005G050400 Sobic001G400000--Sobic005G050400 Sobic001G400000--Sobic003G244400 Sobic006G265800 Sobic006G265800 Sobic001G400000--Sobic006G265800 Sobic004G007400 Sobic004G007400 Sobic001G400000--Sobic004G007400 Sobic001G400000--Sobic008G055600 Sobic008G156600 Sobic008G156600 Sobic001G400000--Sobic008G156600 Sobic001G356200--Sobic004G113600 Sobic001G356200--Sobic001G400000 Sobic003G385300 Sobic003G385300 Sobic001G356200--Sobic003G385300 Sobic007G039200 Sobic007G039200 Sobic001G356200--Sobic007G039200 Sobic001G424800 Sobic001G424800 Sobic001G356200--Sobic001G424800 Sobic004G107100 Sobic004G107100 Sobic001G356200--Sobic004G107100 Sobic003G089100 Sobic003G089100 Sobic001G356200--Sobic003G089100 Sobic003G117800 Sobic003G117800 Sobic001G356200--Sobic003G117800 Sobic006G134500 Sobic006G134500 Sobic001G356200--Sobic006G134500 Sobic004G253200--Sobic008G055600 Sobic003G187700 Sobic003G187700 Sobic004G253200--Sobic003G187700 Sobic009G119600 Sobic009G119600 Sobic004G253200--Sobic009G119600 Sobic004G253200--Sobic010G189432 Sobic004G120500 Sobic004G120500 Sobic004G253200--Sobic004G120500 Sobic001G342101 Sobic001G342101 Sobic004G253200--Sobic001G342101 Sobic005G144000 Sobic005G144000 Sobic004G253200--Sobic005G144000 Sobic001G213666 Sobic001G213666 Sobic004G253200--Sobic001G213666 Sobic001G279000 Sobic001G279000 Sobic004G253200--Sobic001G279000 Sobic009G189700 Sobic009G189700 Sobic001G265100--Sobic009G189700 Sobic005G049200 Sobic005G049200 Sobic001G265100--Sobic005G049200 Sobic006G272400 Sobic006G272400 Sobic001G265100--Sobic006G272400 Sobic005G054150 Sobic005G054150 Sobic001G265100--Sobic005G054150 Sobic005G042900 Sobic005G042900 Sobic001G265100--Sobic005G042900 Sobic006G168200 Sobic006G168200 Sobic001G265100--Sobic006G168200 Sobic004G128700 Sobic004G128700 Sobic001G265100--Sobic004G128700 Sobic005G018600 Sobic005G018600 Sobic001G265100--Sobic005G018600 Sobic001G265100--Sobic005G144000 Sobic010G189432--Sobic004G253200 Sobic010G189432--Sobic008G055600 Sobic010G189432--Sobic003G187700 Sobic010G189432--Sobic009G119600 Sobic010G189432--Sobic001G213666 Sobic010G189432--Sobic001G342101 Sobic010G189432--Sobic004G120500 Sobic010G189432--Sobic001G400000 Sobic009G087100 Sobic009G087100 Sobic010G189432--Sobic009G087100 Sobic004G113600--Sobic001G112600 Sobic004G113600--Sobic003G244400 Sobic004G113600--Sobic004G358000 Sobic009G242200 Sobic009G242200 Sobic004G113600--Sobic009G242200 Sobic002G170100 Sobic002G170100 Sobic004G113600--Sobic002G170100 Sobic004G113600--Sobic005G050400 Sobic004G113600--Sobic001G384200 Sobic004G113600--Sobic001G400000 Sobic004G113600--Sobic005G054150 Sobic004G358000--Sobic002G170100 Sobic007G091400 Sobic007G091400 Sobic004G358000--Sobic007G091400 Sobic001G103100 Sobic001G103100 Sobic004G358000--Sobic001G103100 Sobic004G358000--Sobic009G242200 Sobic003G290500 Sobic003G290500 Sobic004G358000--Sobic003G290500 Sobic003G218100 Sobic003G218100 Sobic004G358000--Sobic003G218100 Sobic003G304600 Sobic003G304600 Sobic004G358000--Sobic003G304600 Sobic002G380300 Sobic002G380300 Sobic004G358000--Sobic002G380300 Sobic008G176500 Sobic008G176500 Sobic004G358000--Sobic008G176500
Octagon: transcription factors


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