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Transcriptome id Sobic.001G265100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QL71
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G189700 - -
2 Sobic.005G049200 exo70 exocyst complex subunit, putative, expressed -
3 Sobic.006G272400 tentative name(PubMedID : 31536532)@core histone H2A/H2B/H3/H4, putative, expressed -
4 Sobic.005G054150 - -
5 Sobic.005G042900 expressed protein -
6 Sobic.006G168200 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed K09286: EREBP-like factor
7 Sobic.004G128700 AGC_PVPK_like_kin82y.5 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
8 Sobic.005G018600 - -
9 Sobic.005G144000 glycosyltransferase, putative, expressed -
10 Sobic.003G286000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
11 Sobic.010G274100 spotted leaf 11, putative, expressed -
12 Sobic.004G154100 OsFBX346 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.002G308900 ubiquitin fusion protein, putative, expressed K02927: RP-L40e, RPL40, ubiquitin-large subunit ribosomal protein L40e
14 Sobic.002G170100 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed K01784: galE, UDP-glucose 4-epimerase
15 Sobic.001G503600 expressed protein -
16 Sobic.005G185100 expressed protein -
17 Sobic.001G202900 expressed protein -
18 Sobic.004G358000 CAMK_CAMK_like.16 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
19 Sobic.009G165900 protein kinase APK1B, chloroplast precursor, putative, expressed -
20 Sobic.009G242200 CGMC_MAPKCMGC_2.3 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed K04371: ERK, mitogen-activated protein kinase 1/3


Gene co-expression network
sample Sobic001G265100 Sobic001G265100 Sobic009G189700 Sobic009G189700 Sobic001G265100--Sobic009G189700 Sobic005G049200 Sobic005G049200 Sobic001G265100--Sobic005G049200 Sobic006G272400 Sobic006G272400 Sobic001G265100--Sobic006G272400 Sobic005G054150 Sobic005G054150 Sobic001G265100--Sobic005G054150 Sobic005G042900 Sobic005G042900 Sobic001G265100--Sobic005G042900 Sobic006G168200 Sobic006G168200 Sobic001G265100--Sobic006G168200 Sobic004G128700 Sobic004G128700 Sobic001G265100--Sobic004G128700 Sobic005G018600 Sobic005G018600 Sobic001G265100--Sobic005G018600 Sobic005G144000 Sobic005G144000 Sobic001G265100--Sobic005G144000 Sobic009G189700--Sobic005G144000 Sobic002G170100 Sobic002G170100 Sobic009G189700--Sobic002G170100 Sobic001G503600 Sobic001G503600 Sobic009G189700--Sobic001G503600 Sobic008G071300 Sobic008G071300 Sobic009G189700--Sobic008G071300 Sobic009G189700--Sobic006G272400 Sobic001G039100 Sobic001G039100 Sobic009G189700--Sobic001G039100 Sobic009G242200 Sobic009G242200 Sobic009G189700--Sobic009G242200 Sobic003G441000 Sobic003G441000 Sobic009G189700--Sobic003G441000 Sobic009G189700--Sobic005G042900 Sobic009G165900 Sobic009G165900 Sobic005G049200--Sobic009G165900 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic005G049200--Sobic004G158100 Sobic003G013900 Sobic003G013900 Sobic005G049200--Sobic003G013900 Sobic010G274100 Sobic010G274100 Sobic005G049200--Sobic010G274100 Sobic002G395100 Sobic002G395100 Sobic005G049200--Sobic002G395100 Sobic010G034200 Sobic010G034200 Sobic005G049200--Sobic010G034200 Sobic009G089000 Sobic009G089000 Sobic005G049200--Sobic009G089000 Sobic005G044600 Sobic005G044600 Sobic005G049200--Sobic005G044600 Sobic008G048200 Sobic008G048200 Sobic005G049200--Sobic008G048200 Sobic001G202900 Sobic001G202900 Sobic006G272400--Sobic001G202900 Sobic006G272400--Sobic009G165900 Sobic006G272400--Sobic004G158100 Sobic001G222800 Sobic001G222800 Sobic006G272400--Sobic001G222800 Sobic008G075800 Sobic008G075800 Sobic006G272400--Sobic008G075800 Sobic003G286000 Sobic003G286000 Sobic006G272400--Sobic003G286000 Sobic004G336401 Sobic004G336401 Sobic006G272400--Sobic004G336401 Sobic008G097800 Sobic008G097800 Sobic006G272400--Sobic008G097800 Sobic002G145400 Sobic002G145400 Sobic006G272400--Sobic002G145400 Sobic005G054150--Sobic002G170100 Sobic005G054150--Sobic009G242200 Sobic007G091400 Sobic007G091400 Sobic005G054150--Sobic007G091400 Sobic005G054150--Sobic010G274100 Sobic004G358000 Sobic004G358000 Sobic005G054150--Sobic004G358000 Sobic006G095700 Sobic006G095700 Sobic005G054150--Sobic006G095700 Sobic003G042800 Sobic003G042800 Sobic005G054150--Sobic003G042800 Sobic001G254000 Sobic001G254000 Sobic005G054150--Sobic001G254000 Sobic005G054150--Sobic003G013900 Sobic005G042900--Sobic006G272400 Sobic005G042900--Sobic001G202900 Sobic005G042900--Sobic003G286000 Sobic005G042900--Sobic009G165900 Sobic005G042900--Sobic004G158100 Sobic001G024700 Sobic001G024700 Sobic005G042900--Sobic001G024700 Sobic001G364700 Sobic001G364700 Sobic005G042900--Sobic001G364700 Sobic005G042900--Sobic001G222800 Sobic005G042900--Sobic008G075800 Sobic006G168200--Sobic005G042900 Sobic006G168200--Sobic005G054150 Sobic006G168200--Sobic009G189700 Sobic006G168200--Sobic006G272400 Sobic006G168200--Sobic010G274100 Sobic004G008200 Sobic004G008200 Sobic006G168200--Sobic004G008200 Sobic006G168200--Sobic002G170100 Sobic006G168200--Sobic005G049200 Sobic006G168200--Sobic005G144000 Sobic004G128700--Sobic005G049200 Sobic004G128700--Sobic006G272400 Sobic004G128700--Sobic009G189700 Sobic001G045400 Sobic001G045400 Sobic004G128700--Sobic001G045400 Sobic004G168150 Sobic004G168150 Sobic004G128700--Sobic004G168150 Sobic004G128700--Sobic005G042900 Sobic004G123100 Sobic004G123100 Sobic004G128700--Sobic004G123100 Sobic004G128700--Sobic005G144000 Sobic002G405300 Sobic002G405300 Sobic004G128700--Sobic002G405300 Sobic005G018600--Sobic003G042800 Sobic005G018600--Sobic006G272400 Sobic008G102850 Sobic008G102850 Sobic005G018600--Sobic008G102850 Sobic005G018600--Sobic005G044600 Sobic005G018600--Sobic004G158100 Sobic007G134260 Sobic007G134260 Sobic005G018600--Sobic007G134260 Sobic007G103000 Sobic007G103000 Sobic005G018600--Sobic007G103000 Sobic005G122100 Sobic005G122100 Sobic005G018600--Sobic005G122100 Sobic005G065300 Sobic005G065300 Sobic005G018600--Sobic005G065300 Sobic005G144000--Sobic003G441000 Sobic005G144000--Sobic002G170100 Sobic008G122800 Sobic008G122800 Sobic005G144000--Sobic008G122800 Sobic001G279000 Sobic001G279000 Sobic005G144000--Sobic001G279000 Sobic005G144000--Sobic009G242200 Sobic005G144000--Sobic001G503600 Sobic004G180100 Sobic004G180100 Sobic005G144000--Sobic004G180100 Sobic005G144000--Sobic008G071300 Sobic002G404600 Sobic002G404600 Sobic005G144000--Sobic002G404600
Octagon: transcription factors


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