Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G076000.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PQS3
Pfam -
Panther DB PTHR37753 PTHR37753:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g71330.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G178700 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
2 Sobic.008G105900 - -
3 Sobic.003G167632 - -
4 Sobic.003G167800 DUF630/DUF632 domains containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G269300 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G180432 - -
7 Sobic.006G060200 basic proline-rich protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G315800 ZOS2-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
9 Sobic.001G217700 possible lysine decarboxylase domain containing protein, expressed -
10 Sobic.005G036600 calmodulin-binding protein, putative, expressed -
11 Sobic.006G048775 - -
12 Sobic.009G197200 - -
13 Sobic.006G249050 - -
14 Sobic.003G057800 rho termination factor, N-terminal domain containing protein, expressed -
15 Sobic.005G046500 protein kinase family protein, putative, expressed -
16 Sobic.008G118000 Glutaredoxin family protein (At)(PubMedID : 27208977)@OsGrx_C11 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
17 Sobic.008G015300 amino acid permease family protein, putative, expressed -
18 Sobic.008G094300 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
19 Sobic.001G497200 expressed protein -
20 Sobic.006G046000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G076000 Sobic005G076000 Sobic003G178700 Sobic003G178700 Sobic005G076000--Sobic003G178700 Sobic008G105900 Sobic008G105900 Sobic005G076000--Sobic008G105900 Sobic003G167632 Sobic003G167632 Sobic005G076000--Sobic003G167632 Sobic003G167800 Sobic003G167800 Sobic005G076000--Sobic003G167800 Sobic001G269300 Sobic001G269300 Sobic005G076000--Sobic001G269300 Sobic006G180432 Sobic006G180432 Sobic005G076000--Sobic006G180432 Sobic006G060200 Sobic006G060200 Sobic005G076000--Sobic006G060200 Sobic004G315800 Sobic004G315800 Sobic005G076000--Sobic004G315800 Sobic001G217700 Sobic001G217700 Sobic005G076000--Sobic001G217700 Sobic008G015300 Sobic008G015300 Sobic003G178700--Sobic008G015300 Sobic003G163500 Sobic003G163500 Sobic003G178700--Sobic003G163500 Sobic005G046500 Sobic005G046500 Sobic003G178700--Sobic005G046500 Sobic009G002500 Sobic009G002500 Sobic003G178700--Sobic009G002500 Sobic008G101500 Sobic008G101500 Sobic003G178700--Sobic008G101500 Sobic008G118000 Sobic008G118000 Sobic003G178700--Sobic008G118000 Sobic003G178700--Sobic005G076000 Sobic007G129100 Sobic007G129100 Sobic003G178700--Sobic007G129100 Sobic009G213400 Sobic009G213400 Sobic003G178700--Sobic009G213400 Sobic005G063700 Sobic005G063700 Sobic008G105900--Sobic005G063700 Sobic007G130100 Sobic007G130100 Sobic008G105900--Sobic007G130100 Sobic008G105900--Sobic001G269300 Sobic008G105900--Sobic006G180432 Sobic002G420300 Sobic002G420300 Sobic008G105900--Sobic002G420300 Sobic001G497200 Sobic001G497200 Sobic008G105900--Sobic001G497200 Sobic006G048775 Sobic006G048775 Sobic008G105900--Sobic006G048775 Sobic007G052900 Sobic007G052900 Sobic008G105900--Sobic007G052900 Sobic008G105900--Sobic004G315800 Sobic003G167632--Sobic003G167800 Sobic003G057800 Sobic003G057800 Sobic003G167632--Sobic003G057800 Sobic001G479500 Sobic001G479500 Sobic003G167632--Sobic001G479500 Sobic003G167632--Sobic005G076000 Sobic002G376800 Sobic002G376800 Sobic003G167632--Sobic002G376800 Sobic003G357500 Sobic003G357500 Sobic003G167632--Sobic003G357500 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic003G167632--Sobic010G248200 Sobic007G132600 Sobic007G132600 Sobic003G167632--Sobic007G132600 Sobic003G107800 Sobic003G107800 Sobic003G167632--Sobic003G107800 Sobic003G167800--Sobic003G167632 Sobic003G167800--Sobic003G057800 Sobic003G167800--Sobic001G479500 Sobic003G167800--Sobic002G376800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic003G167800--Sobic007G073400 Sobic003G167800--Sobic010G248200 Sobic008G161401 Sobic008G161401 Sobic003G167800--Sobic008G161401 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic003G167800--Sobic009G110366 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic003G167800--Sobic001G046600 Sobic001G269300--Sobic006G060200 Sobic001G269300--Sobic006G180432 Sobic005G036600 Sobic005G036600 Sobic001G269300--Sobic005G036600 Sobic002G209600 Sobic002G209600 Sobic001G269300--Sobic002G209600 Sobic003G201750 Sobic003G201750 Sobic001G269300--Sobic003G201750 Sobic001G269300--Sobic007G052900 Sobic004G143400 Sobic004G143400 Sobic001G269300--Sobic004G143400 Sobic008G131700 Sobic008G131700 Sobic001G269300--Sobic008G131700 Sobic001G269300--Sobic004G315800 Sobic006G180432--Sobic003G057800 Sobic006G180432--Sobic001G269300 Sobic006G180432--Sobic007G052900 Sobic006G180432--Sobic001G479500 Sobic006G180432--Sobic001G497200 Sobic006G180432--Sobic001G046600 Sobic005G187200 Sobic005G187200 Sobic006G180432--Sobic005G187200 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic006G180432--Sobic004G016500 Sobic006G180432--Sobic006G048775 Sobic006G060200--Sobic001G269300 Sobic002G215000 Sobic002G215000 Sobic006G060200--Sobic002G215000 Sobic006G060200--Sobic001G217700 Sobic006G060200--Sobic008G131700 Sobic001G233400 Sobic001G233400 Sobic006G060200--Sobic001G233400 Sobic006G060200--Sobic005G036600 Sobic003G137100 Sobic003G137100 Sobic006G060200--Sobic003G137100 Sobic001G495300 Sobic001G495300 Sobic006G060200--Sobic001G495300 Sobic005G084000 Sobic005G084000 Sobic006G060200--Sobic005G084000 Sobic004G315800--Sobic007G130100 Sobic006G204200 Sobic006G204200 Sobic004G315800--Sobic006G204200 Sobic004G315800--Sobic008G131700 Sobic004G315800--Sobic002G209600 Sobic004G315800--Sobic001G269300 Sobic004G241500 Sobic004G241500 Sobic004G315800--Sobic004G241500 Sobic004G315800--Sobic004G016500 Sobic004G315800--Sobic007G052900 Sobic007G076700 Sobic007G076700 Sobic004G315800--Sobic007G076700 Sobic001G217700--Sobic006G060200 Sobic002G104000 Sobic002G104000 Sobic001G217700--Sobic002G104000 Sobic006G249050 Sobic006G249050 Sobic001G217700--Sobic006G249050 Sobic002G376700 Sobic002G376700 Sobic001G217700--Sobic002G376700 Sobic003G110700 Sobic003G110700 Sobic001G217700--Sobic003G110700 Sobic001G217700--Sobic001G269300 Sobic006G102400 Sobic006G102400 Sobic001G217700--Sobic006G102400 Sobic001G217700--Sobic005G036600 Sobic010G246600 Sobic010G246600 Sobic001G217700--Sobic010G246600
Octagon: transcription factors


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