Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G129900.1
Synonym
Functional annotation OsFBO5 - F-box and other domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PS50
Pfam PF02892
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G17450 : hAT dimerisation domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g04850.1 : OsFBO5 - F-box and other domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G071700 GTP-binding protein, putative, expressed K06942: ribosome-binding ATPase
2 Sobic.001G388250 - -
3 Sobic.007G083800 - -
4 Sobic.005G072000 expressed protein K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
5 Sobic.010G184900 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
6 Sobic.008G101000 powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed -
7 Sobic.008G055366 - -
8 Sobic.008G069700 clathrin assembly protein, putative, expressed -
9 Sobic.001G271100 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
10 Sobic.010G119500 cadmium tolerance factor, putative, expressed K11267: sister chromatid cohesion protein PDS5
11 Sobic.006G112200 - -
12 Sobic.010G127100 - -
13 Sobic.005G019500 - -
14 Sobic.003G060500 T-complex protein, putative, expressed K09494: T-complex protein 1 subunit beta
15 Sobic.010G064500 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G006300 translationally-controlled tumor protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G358000 Putative splicing factor(PubMedID : 24356560)@RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K12900: FUS-interacting serine-arginine-rich protein 1
18 Sobic.008G048900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@citrate-binding protein precursor, putative, expressed -
19 Sobic.002G002200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G010151 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G129900 Sobic005G129900 Sobic007G071700 Sobic007G071700 Sobic005G129900--Sobic007G071700 Sobic001G388250 Sobic001G388250 Sobic005G129900--Sobic001G388250 Sobic007G083800 Sobic007G083800 Sobic005G129900--Sobic007G083800 Sobic005G072000 Sobic005G072000 Sobic005G129900--Sobic005G072000 Sobic010G184900 Sobic010G184900 Sobic005G129900--Sobic010G184900 Sobic008G101000 Sobic008G101000 Sobic005G129900--Sobic008G101000 Sobic008G055366 Sobic008G055366 Sobic005G129900--Sobic008G055366 Sobic008G069700 Sobic008G069700 Sobic005G129900--Sobic008G069700 Sobic001G271100 Sobic001G271100 Sobic005G129900--Sobic001G271100 Sobic007G071700--Sobic005G072000 Sobic007G071700--Sobic005G129900 Sobic007G071700--Sobic008G055366 Sobic007G071700--Sobic001G271100 Sobic010G112900 Sobic010G112900 Sobic007G071700--Sobic010G112900 Sobic007G071700--Sobic001G388250 Sobic008G055432 Sobic008G055432 Sobic007G071700--Sobic008G055432 Sobic007G071700--Sobic010G184900 Sobic010G064500 Sobic010G064500 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Octagon: transcription factors


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