Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G188900.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RK65
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G343100 YCF37, putative, expressed -
2 Sobic.008G063100 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
3 Sobic.002G370700 expressed protein -
4 Sobic.002G069050 - -
5 Sobic.003G187000 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
6 Sobic.005G021600 expressed protein -
7 Sobic.003G342200 dihydroflavonol-4-reductase, putative, expressed -
8 Sobic.007G132500 F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.010G265500 expressed protein -
10 Sobic.003G437600 thioredoxin, putative, expressed -
11 Sobic.005G192600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@dirigent, putative, expressed -
12 Sobic.004G253400 tic20 protein-related, putative, expressed -
13 Sobic.001G498300 galactose mutarotase-like, putative, expressed -
14 Sobic.001G391900 nifU, putative, expressed -
15 Sobic.003G421400 expressed protein -
16 Sobic.008G063500 Photosystem I reaction center subunit N(PubMedID : 26186930)@photosystem I reaction center subunit N, chloroplast precursor, putative, expressed K02701: photosystem I subunit PsaN
17 Sobic.007G178500 cytochrome P450, putative, expressed -
18 Sobic.005G183500 resistance protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G316700 ATP synthase subunit gamma(PubMedID : 26186930)@ATP synthase subunit gamma (Zm)(PubMedID : 27208977)@ATP synthase gamma chain, putative, expressed K02115: ATPF1G, F-type H+-transporting ATPase subunit gamma
20 Sobic.003G253300 ATP synthase protein I related, putative, expressed K02116: ATP synthase protein I


Gene co-expression network
sample Sobic005G188900 Sobic005G188900 Sobic004G343100 Sobic004G343100 Sobic005G188900--Sobic004G343100 Sobic008G063100 Sobic008G063100 Sobic005G188900--Sobic008G063100 Sobic002G370700 Sobic002G370700 Sobic005G188900--Sobic002G370700 Sobic002G069050 Sobic002G069050 Sobic005G188900--Sobic002G069050 Sobic003G187000 Sobic003G187000 Sobic005G188900--Sobic003G187000 Sobic005G021600 Sobic005G021600 Sobic005G188900--Sobic005G021600 Sobic003G342200 Sobic003G342200 Sobic005G188900--Sobic003G342200 Sobic007G132500 Sobic007G132500 Sobic005G188900--Sobic007G132500 Sobic010G265500 Sobic010G265500 Sobic005G188900--Sobic010G265500 Sobic004G343100--Sobic008G063100 Sobic004G343100--Sobic010G265500 Sobic004G343100--Sobic005G021600 Sobic003G421400 Sobic003G421400 Sobic004G343100--Sobic003G421400 Sobic001G498300 Sobic001G498300 Sobic004G343100--Sobic001G498300 Sobic004G343100--Sobic003G187000 Sobic001G161300 Sobic001G161300 Sobic004G343100--Sobic001G161300 Sobic004G343100--Sobic007G132500 Sobic002G281000 Sobic002G281000 Sobic004G343100--Sobic002G281000 Sobic008G063100--Sobic004G343100 Sobic008G063100--Sobic005G021600 Sobic008G063100--Sobic002G281000 Sobic001G404500 Sobic001G404500 Sobic008G063100--Sobic001G404500 Sobic001G198700 Sobic001G198700 Sobic008G063100--Sobic001G198700 Sobic004G063200 Sobic004G063200 Sobic008G063100--Sobic004G063200 Sobic002G195700 Sobic002G195700 Sobic008G063100--Sobic002G195700 Sobic009G202400 Sobic009G202400 Sobic008G063100--Sobic009G202400 Sobic005G175600 Sobic005G175600 Sobic008G063100--Sobic005G175600 Sobic003G253300 Sobic003G253300 Sobic002G370700--Sobic003G253300 Sobic002G331800 Sobic002G331800 Sobic002G370700--Sobic002G331800 Sobic003G284800 Sobic003G284800 Sobic002G370700--Sobic003G284800 Sobic006G193200 Sobic006G193200 Sobic002G370700--Sobic006G193200 Sobic006G110900 Sobic006G110900 Sobic002G370700--Sobic006G110900 Sobic004G300000 Sobic004G300000 Sobic002G370700--Sobic004G300000 Sobic006G214700 Sobic006G214700 Sobic002G370700--Sobic006G214700 Sobic001G118400 Sobic001G118400 Sobic002G370700--Sobic001G118400 Sobic010G076800 Sobic010G076800 Sobic002G370700--Sobic010G076800 Sobic002G069050--Sobic004G343100 Sobic002G069050--Sobic008G063100 Sobic003G437600 Sobic003G437600 Sobic002G069050--Sobic003G437600 Sobic005G093300 Sobic005G093300 Sobic002G069050--Sobic005G093300 Sobic002G069050--Sobic001G198700 Sobic005G192600 Sobic005G192600 Sobic002G069050--Sobic005G192600 Sobic002G069050--Sobic005G021600 Sobic010G218600 Sobic010G218600 Sobic002G069050--Sobic010G218600 Sobic007G059500 Sobic007G059500 Sobic002G069050--Sobic007G059500 Sobic007G178500 Sobic007G178500 Sobic003G187000--Sobic007G178500 Sobic003G187000--Sobic001G498300 Sobic003G187000--Sobic010G265500 Sobic004G314800 Sobic004G314800 Sobic003G187000--Sobic004G314800 Sobic009G028400 Sobic009G028400 Sobic003G187000--Sobic009G028400 Sobic003G187000--Sobic004G343100 Sobic008G063500 Sobic008G063500 Sobic003G187000--Sobic008G063500 Sobic003G187000--Sobic005G021600 Sobic007G023300 Sobic007G023300 Sobic003G187000--Sobic007G023300 Sobic005G021600--Sobic008G063100 Sobic005G021600--Sobic010G265500 Sobic005G021600--Sobic009G028400 Sobic005G021600--Sobic002G195700 Sobic005G021600--Sobic007G178500 Sobic005G021600--Sobic010G218600 Sobic005G021600--Sobic002G281000 Sobic005G021600--Sobic007G132500 Sobic001G006000 Sobic001G006000 Sobic005G021600--Sobic001G006000 Sobic006G050400 Sobic006G050400 Sobic003G342200--Sobic006G050400 Sobic003G342200--Sobic003G253300 Sobic001G175700 Sobic001G175700 Sobic003G342200--Sobic001G175700 Sobic006G155500 Sobic006G155500 Sobic003G342200--Sobic006G155500 Sobic001G122300 Sobic001G122300 Sobic003G342200--Sobic001G122300 Sobic003G378600 Sobic003G378600 Sobic003G342200--Sobic003G378600 Sobic002G112400 Sobic002G112400 Sobic003G342200--Sobic002G112400 Sobic006G125000 Sobic006G125000 Sobic003G342200--Sobic006G125000 Sobic002G102200 Sobic002G102200 Sobic003G342200--Sobic002G102200 Sobic006G197700 Sobic006G197700 Sobic007G132500--Sobic006G197700 Sobic007G132500--Sobic005G021600 Sobic006G111600 Sobic006G111600 Sobic007G132500--Sobic006G111600 Sobic003G208300 Sobic003G208300 Sobic007G132500--Sobic003G208300 Sobic007G132500--Sobic008G063100 Sobic007G132500--Sobic001G006000 Sobic007G132500--Sobic009G028400 Sobic007G132500--Sobic006G110900 Sobic008G063200 Sobic008G063200 Sobic007G132500--Sobic008G063200 Sobic010G265500--Sobic005G021600 Sobic010G265500--Sobic003G187000 Sobic010G265500--Sobic004G343100 Sobic010G265500--Sobic010G218600 Sobic010G265500--Sobic007G178500 Sobic010G265500--Sobic009G028400 Sobic010G265500--Sobic001G498300 Sobic010G265500--Sobic008G063100 Sobic001G447700 Sobic001G447700 Sobic010G265500--Sobic001G447700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.