Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G230500.2
Synonym Sb05g027790
Functional annotation SCARECROW, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RKY8
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636 PTHR31636:SF59
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G37650 : GRAS family transcription factor
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g47870.1 : GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G072300 OsFBL44 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
2 Sobic.005G230400 SCARECROW, putative, expressed -
3 Sobic.003G381500 OsFBX411 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.008G160400 KIP1, putative, expressed -
5 Sobic.003G134201 - -
6 Sobic.001G491300 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
7 Sobic.010G017400 DLT(Ortholog in rice:Tong et al. (2012))(PubMedID : 31659927)@DELLA protein SLR1, putative, expressed -
8 Sobic.008G006800 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
9 Sobic.005G143100 expressed protein -
10 Sobic.003G043900 kinesin-4, putative, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
11 Sobic.010G083550 - -
12 Sobic.001G175100 DEK C terminal domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G477400 AUXIN SIGNALING F-BOX 2, putative, expressed -
14 Sobic.005G005700 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.001G170800 "Transport protein(Ortholog in rice:Huang et al., 2012)"(PubMedID : 31659835)@transport protein-related, putative, expressed -
16 Sobic.004G339500 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.008G114900 rhoGAP domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G287700 expressed protein -
19 Sobic.004G198100 expressed protein -
20 Sobic.002G296000 HEAT repeat family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G230500 Sobic005G230500 Sobic007G072300 Sobic007G072300 Sobic005G230500--Sobic007G072300 Sobic005G230400 Sobic005G230400 Sobic005G230500--Sobic005G230400 Sobic003G381500 Sobic003G381500 Sobic005G230500--Sobic003G381500 Sobic008G160400 Sobic008G160400 Sobic005G230500--Sobic008G160400 Sobic003G134201 Sobic003G134201 Sobic005G230500--Sobic003G134201 Sobic001G491300 Sobic001G491300 Sobic005G230500--Sobic001G491300 Sobic010G017400 Sobic010G017400 Sobic005G230500--Sobic010G017400 Sobic008G006800 Sobic008G006800 Sobic005G230500--Sobic008G006800 Sobic005G143100 Sobic005G143100 Sobic005G230500--Sobic005G143100 Sobic004G081400 Sobic004G081400 Sobic007G072300--Sobic004G081400 Sobic004G053900 Sobic004G053900 Sobic007G072300--Sobic004G053900 Sobic002G191000 Sobic002G191000 Sobic007G072300--Sobic002G191000 Sobic010G008900 Sobic010G008900 Sobic007G072300--Sobic010G008900 Sobic001G105000 Sobic001G105000 Sobic007G072300--Sobic001G105000 Sobic003G118100 Sobic003G118100 Sobic007G072300--Sobic003G118100 Sobic003G043900 Sobic003G043900 Sobic007G072300--Sobic003G043900 Sobic003G008700 Sobic003G008700 Sobic007G072300--Sobic003G008700 Sobic006G035600 Sobic006G035600 Sobic007G072300--Sobic006G035600 Sobic008G090100 Sobic008G090100 Sobic005G230400--Sobic008G090100 Sobic005G230400--Sobic010G008900 Sobic001G382700 Sobic001G382700 Sobic005G230400--Sobic001G382700 Sobic001G144200 Sobic001G144200 Sobic005G230400--Sobic001G144200 Sobic001G196000 Sobic001G196000 Sobic005G230400--Sobic001G196000 Sobic005G230400--Sobic003G118100 Sobic010G104400 Sobic010G104400 Sobic005G230400--Sobic010G104400 Sobic009G208900 Sobic009G208900 Sobic005G230400--Sobic009G208900 Sobic005G230400--Sobic002G191000 Sobic003G381500--Sobic005G143100 Sobic003G013800 Sobic003G013800 Sobic003G381500--Sobic003G013800 Sobic005G104300 Sobic005G104300 Sobic003G381500--Sobic005G104300 Sobic005G157300 Sobic005G157300 Sobic003G381500--Sobic005G157300 Sobic003G292700 Sobic003G292700 Sobic003G381500--Sobic003G292700 Sobic001G377700 Sobic001G377700 Sobic003G381500--Sobic001G377700 Sobic001G155800 Sobic001G155800 Sobic003G381500--Sobic001G155800 Sobic002G317700 Sobic002G317700 Sobic003G381500--Sobic002G317700 Sobic001G025900 Sobic001G025900 Sobic003G381500--Sobic001G025900 Sobic008G114900 Sobic008G114900 Sobic008G160400--Sobic008G114900 Sobic010G192500 Sobic010G192500 Sobic008G160400--Sobic010G192500 Sobic008G160400--Sobic008G006800 Sobic001G398400 Sobic001G398400 Sobic008G160400--Sobic001G398400 Sobic001G493900 Sobic001G493900 Sobic008G160400--Sobic001G493900 Sobic008G125700 Sobic008G125700 Sobic008G160400--Sobic008G125700 Sobic002G319300 Sobic002G319300 Sobic008G160400--Sobic002G319300 Sobic001G155700 Sobic001G155700 Sobic008G160400--Sobic001G155700 Sobic002G417000 Sobic002G417000 Sobic008G160400--Sobic002G417000 Sobic002G320600 Sobic002G320600 Sobic003G134201--Sobic002G320600 Sobic004G243800 Sobic004G243800 Sobic003G134201--Sobic004G243800 Sobic010G211800 Sobic010G211800 Sobic003G134201--Sobic010G211800 Sobic009G211800 Sobic009G211800 Sobic003G134201--Sobic009G211800 Sobic002G045200 Sobic002G045200 Sobic003G134201--Sobic002G045200 Sobic007G107950 Sobic007G107950 Sobic003G134201--Sobic007G107950 Sobic001G201000 Sobic001G201000 Sobic003G134201--Sobic001G201000 Sobic001G437500 Sobic001G437500 Sobic003G134201--Sobic001G437500 Sobic003G134201--Sobic010G008900 Sobic004G339500 Sobic004G339500 Sobic001G491300--Sobic004G339500 Sobic001G177900 Sobic001G177900 Sobic001G491300--Sobic001G177900 Sobic003G260700 Sobic003G260700 Sobic001G491300--Sobic003G260700 Sobic007G168900 Sobic007G168900 Sobic001G491300--Sobic007G168900 Sobic001G491300--Sobic008G006800 Sobic004G257600 Sobic004G257600 Sobic001G491300--Sobic004G257600 Sobic004G198100 Sobic004G198100 Sobic001G491300--Sobic004G198100 Sobic004G271300 Sobic004G271300 Sobic001G491300--Sobic004G271300 Sobic006G144300 Sobic006G144300 Sobic001G491300--Sobic006G144300 Sobic010G017400--Sobic008G006800 Sobic005G005700 Sobic005G005700 Sobic010G017400--Sobic005G005700 Sobic002G296000 Sobic002G296000 Sobic010G017400--Sobic002G296000 Sobic001G170800 Sobic001G170800 Sobic010G017400--Sobic001G170800 Sobic010G017400--Sobic001G177900 Sobic010G017400--Sobic001G398400 Sobic010G017400--Sobic004G271300 Sobic010G017400--Sobic007G168900 Sobic010G017400--Sobic010G008900 Sobic008G006800--Sobic005G005700 Sobic010G119300 Sobic010G119300 Sobic008G006800--Sobic010G119300 Sobic008G006800--Sobic003G260700 Sobic008G006800--Sobic001G398400 Sobic008G006800--Sobic004G339500 Sobic008G006800--Sobic010G017400 Sobic008G006800--Sobic004G271300 Sobic002G313000 Sobic002G313000 Sobic008G006800--Sobic002G313000 Sobic008G006800--Sobic002G296000 Sobic002G284100 Sobic002G284100 Sobic005G143100--Sobic002G284100 Sobic009G172950 Sobic009G172950 Sobic005G143100--Sobic009G172950 Sobic001G123100 Sobic001G123100 Sobic005G143100--Sobic001G123100 Sobic004G321400 Sobic004G321400 Sobic005G143100--Sobic004G321400 Sobic002G006100 Sobic002G006100 Sobic005G143100--Sobic002G006100 Sobic004G267600 Sobic004G267600 Sobic005G143100--Sobic004G267600 Sobic003G289800 Sobic003G289800 Sobic005G143100--Sobic003G289800 Sobic003G226700 Sobic003G226700 Sobic005G143100--Sobic003G226700 Sobic006G142500 Sobic006G142500 Sobic005G143100--Sobic006G142500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.