Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G015600.1
Synonym Sb06g001510
Functional annotation ZOS4-03 - C2H2 zinc finger protein, expressed
UniProt C5YC66
Pfam PF13912
Panther DB PTHR26374 PTHR26374:SF168
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G03510 : C2H2-type zinc finger family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g08060.1 : ZOS4-03 - C2H2 zinc finger protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055423 , Zm00025a012288
Brachypodium PNT60482 , KQJ81406
Barley HORVU6Hr1G092750.1 , HORVU6Hr1G092750.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G389800 alpha-N-arabinofuranosidase A, putative, expressed K01209: alpha-L-arabinofuranosidase
2 Sobic.001G485800 nitrilase, putative, expressed K13566: NIT2, omega-amidase
3 Sobic.009G033100 OsWAK4 - OsWAK receptor-like cytoplasmic kinase OsWAK-RLCK, expressed -
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7 Sobic.002G173500 cytokinin-O-glucosyltransferase 1, putative, expressed -
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10 Sobic.006G044400 OsSCP23 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16296: serine carboxypeptidase-like clade I
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12 Sobic.004G193600 - -
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16 Sobic.006G000700 - -
17 Sobic.003G258800 glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed K00264: glutamate synthase (NADH)
18 Sobic.003G196900 esterase/lipase/thioesterase, putative, expressed K06889: uncharacterized protein
19 Sobic.002G328100 TKL_IRAK_DUF26-lc.18 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
20 Sobic.004G253100 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G015600 Sobic006G015600 Sobic001G389800 Sobic001G389800 Sobic006G015600--Sobic001G389800 Sobic001G485800 Sobic001G485800 Sobic006G015600--Sobic001G485800 Sobic009G033100 Sobic009G033100 Sobic006G015600--Sobic009G033100 Sobic005G110541 Sobic005G110541 Sobic006G015600--Sobic005G110541 Sobic004G202700 Sobic004G202700 Sobic006G015600--Sobic004G202700 Sobic007G200000 Sobic007G200000 Sobic006G015600--Sobic007G200000 Sobic002G173500 Sobic002G173500 Sobic006G015600--Sobic002G173500 Sobic002G339500 Sobic002G339500 Sobic006G015600--Sobic002G339500 Sobic006G000600 Sobic006G000600 Sobic006G015600--Sobic006G000600 Sobic002G301500 Sobic002G301500 Sobic001G389800--Sobic002G301500 Sobic002G392700 Sobic002G392700 Sobic001G389800--Sobic002G392700 Sobic009G178300 Sobic009G178300 Sobic001G389800--Sobic009G178300 Sobic010G043600 Sobic010G043600 Sobic001G389800--Sobic010G043600 Sobic010G106900 Sobic010G106900 Sobic001G389800--Sobic010G106900 Sobic004G030100 Sobic004G030100 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Octagon: transcription factors


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