Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G261500.1
Synonym ATPAO2, Sb06g032450, PAO2
Functional annotation amine oxidase, flavin-containing, domain containing protein, expressed
UniProt C5YA47
Pfam PF13450
Panther DB PTHR10742 PTHR10742:SF264
NCBI CDD KOG0029; Amine oxidase
KEGG Orthology K17839; PAO4, PAO3, polyamine oxidase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G43020 : polyamine oxidase 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g57550.1 : amine oxidase, flavin-containing, domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009361
Brachypodium KQJ85221
Barley -
Wheat TraesCS2D02G549300 , TraesCS2B02G579100 , TraesCS2A02G548200
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G261500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G332000 alpha-1,6-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, putative, expressed K00736: alpha-1,6-mannosyl-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase
2 Sobic.002G119800 arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed -
3 Sobic.001G272200 - -
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9 Sobic.010G148750 - -
10 Sobic.002G431200 - -
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12 Sobic.010G268200 zinc finger, C3HC4 type, domain containing protein, expressed -
13 Sobic.K010000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.003G201850 - -
16 Sobic.003G277700 phosphotransferase, putative, expressed K14156: choline/ethanolamine kinase
17 Sobic.004G200866 - -
18 Sobic.004G247800 SET domain-containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G154500 tentative name(PubMedID : 31536532)@nuclear transcription factor Y subunit, putative, expressed K08064: NFYA, nuclear transcription factor Y, alpha
20 Sobic.008G106400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G261500 Sobic006G261500 Sobic004G332000 Sobic004G332000 Sobic006G261500--Sobic004G332000 Sobic002G119800 Sobic002G119800 Sobic006G261500--Sobic002G119800 Sobic001G272200 Sobic001G272200 Sobic006G261500--Sobic001G272200 Sobic006G213601 Sobic006G213601 Sobic006G261500--Sobic006G213601 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic006G261500--Sobic004G152601 Sobic003G283250 Sobic003G283250 Sobic006G261500--Sobic003G283250 Sobic003G357166 Sobic003G357166 Sobic006G261500--Sobic003G357166 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic006G261500--Sobic008G065400 Sobic010G148750 Sobic010G148750 Sobic006G261500--Sobic010G148750 Sobic004G332000--Sobic002G119800 Sobic004G332000--Sobic006G213601 Sobic001G262900 Sobic001G262900 Sobic004G332000--Sobic001G262900 Sobic001G072200 Sobic001G072200 Sobic004G332000--Sobic001G072200 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic004G332000--Sobic003G374500 Sobic006G255100 Sobic006G255100 Sobic004G332000--Sobic006G255100 Sobic004G332000--Sobic004G152601 Sobic007G136700 Sobic007G136700 Sobic004G332000--Sobic007G136700 Sobic002G067100 Sobic002G067100 Sobic004G332000--Sobic002G067100 Sobic002G119800--Sobic004G332000 Sobic009G059700 Sobic009G059700 Sobic002G119800--Sobic009G059700 Sobic002G119800--Sobic006G213601 Sobic008G016900 Sobic008G016900 Sobic002G119800--Sobic008G016900 Sobic001G162100 Sobic001G162100 Sobic002G119800--Sobic001G162100 Sobic009G230700 Sobic009G230700 Sobic002G119800--Sobic009G230700 Sobic009G134600 Sobic009G134600 Sobic002G119800--Sobic009G134600 Sobic007G011000 Sobic007G011000 Sobic002G119800--Sobic007G011000 Sobic004G145200 Sobic004G145200 Sobic002G119800--Sobic004G145200 Sobic001G272200--Sobic004G152601 SobicK010000 SobicK010000 Sobic001G272200--SobicK010000 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic001G272200--Sobic003G429500 Sobic001G272200--Sobic008G065400 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic001G272200--Sobic004G200866 Sobic007G037301 Sobic007G037301 Sobic001G272200--Sobic007G037301 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic001G272200--Sobic002G171400 Sobic003G161700 Sobic003G161700 Sobic001G272200--Sobic003G161700 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic001G272200--Sobic002G431200 Sobic006G213601--Sobic004G332000 Sobic006G213601--Sobic002G119800 Sobic006G213601--Sobic009G059700 Sobic002G400200 Sobic002G400200 Sobic006G213601--Sobic002G400200 Sobic006G194500 Sobic006G194500 Sobic006G213601--Sobic006G194500 Sobic003G119800 Sobic003G119800 Sobic006G213601--Sobic003G119800 Sobic007G006900 Sobic007G006900 Sobic006G213601--Sobic007G006900 Sobic006G225600 Sobic006G225600 Sobic006G213601--Sobic006G225600 Sobic004G267300 Sobic004G267300 Sobic006G213601--Sobic004G267300 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic004G152601--Sobic008G106400 Sobic004G152601--Sobic008G065400 Sobic003G201850 Sobic003G201850 Sobic004G152601--Sobic003G201850 Sobic004G010800 Sobic004G010800 Sobic004G152601--Sobic004G010800 Sobic004G152601--Sobic001G262900 Sobic004G152601--Sobic003G429500 Sobic010G184900 Sobic010G184900 Sobic004G152601--Sobic010G184900 Sobic004G152601--Sobic010G148750 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic004G152601--Sobic008G045600 Sobic003G283250--Sobic002G431200 Sobic005G051300 Sobic005G051300 Sobic003G283250--Sobic005G051300 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic003G283250--Sobic009G121750 Sobic003G283250--Sobic006G261500 Sobic007G144400 Sobic007G144400 Sobic003G283250--Sobic007G144400 Sobic003G283250--Sobic008G065400 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic003G283250--Sobic001G140200 Sobic004G143201 Sobic004G143201 Sobic003G357166--Sobic004G143201 Sobic003G357166--Sobic006G261500 Sobic003G357166--SobicK010000 Sobic003G334900 Sobic003G334900 Sobic003G357166--Sobic003G334900 Sobic005G210300 Sobic005G210300 Sobic003G357166--Sobic005G210300 Sobic005G173366 Sobic005G173366 Sobic003G357166--Sobic005G173366 Sobic003G439400 Sobic003G439400 Sobic003G357166--Sobic003G439400 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic003G357166--Sobic005G085100 Sobic003G357166--Sobic003G283250 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic008G065400--Sobic001G278600 Sobic008G065400--Sobic002G431200 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic008G065400--Sobic003G366850 Sobic008G065400--Sobic003G374500 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic008G065400--Sobic005G079700 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic008G065400--Sobic003G266700 Sobic008G065400--Sobic008G106400 Sobic008G065400--Sobic002G171400 Sobic008G065400--Sobic003G429500 Sobic010G148750--Sobic003G201850 Sobic010G148750--Sobic008G065400 Sobic010G148750--Sobic004G152601 Sobic010G148750--Sobic002G431200 Sobic010G148750--Sobic003G366850 Sobic010G148750--Sobic004G200866 Sobic010G148750--Sobic008G106400 Sobic010G148750--Sobic003G429500 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic010G148750--Sobic009G101600
Octagon: transcription factors


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