Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G283250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q5V2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) ChrUn.fgenesh.mRNA.22 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G431200 - -
2 Sobic.005G051300 - -
3 Sobic.009G121750 - -
4 Sobic.006G261500 amine oxidase, flavin-containing, domain containing protein, expressed K17839: PAO4, PAO3, polyamine oxidase
5 Sobic.007G144400 transferase family protein, putative, expressed K15400: omega-hydroxypalmitate O-feruloyl transferase
6 Sobic.007G144400 transferase family protein, putative, expressed K15400: omega-hydroxypalmitate O-feruloyl transferase
7 Sobic.007G144400 transferase family protein, putative, expressed K15400: omega-hydroxypalmitate O-feruloyl transferase
8 Sobic.008G065400 - -
9 Sobic.001G140200 Homeobox domain containing protein, expressed -
10 Sobic.005G159200 - -
11 Sobic.003G357166 - -
12 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.K010000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.007G044500 alpha-1,6-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, putative, expressed -
15 Sobic.005G166300 Brix domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G083733 - -
17 Sobic.009G220900 - -
18 Sobic.003G366850 - -
19 Sobic.006G057733 - -
20 Sobic.002G171400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G283250 Sobic003G283250 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic003G283250--Sobic002G431200 Sobic005G051300 Sobic005G051300 Sobic003G283250--Sobic005G051300 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic003G283250--Sobic009G121750 Sobic006G261500 Sobic006G261500 Sobic003G283250--Sobic006G261500 Sobic007G144400 Sobic007G144400 Sobic003G283250--Sobic007G144400 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic003G283250--Sobic008G065400 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic003G283250--Sobic001G140200 Sobic002G431200--Sobic008G065400 Sobic002G431200--Sobic009G121750 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic002G431200--Sobic008G106400 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic002G431200--Sobic003G366850 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic002G431200--Sobic003G429500 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic002G431200--Sobic005G079700 SobicK010000 SobicK010000 Sobic002G431200--SobicK010000 Sobic005G166300 Sobic005G166300 Sobic002G431200--Sobic005G166300 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic002G431200--Sobic002G171400 Sobic005G051300--SobicK010000 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic005G051300--Sobic004G200866 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic005G051300--Sobic001G278600 Sobic008G142000 Sobic008G142000 Sobic005G051300--Sobic008G142000 Sobic005G051300--Sobic008G065400 Sobic005G051300--Sobic003G366850 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic005G051300--Sobic004G121000 Sobic009G220900 Sobic009G220900 Sobic005G051300--Sobic009G220900 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic005G051300--Sobic003G374500 Sobic009G121750--Sobic002G431200 Sobic009G121750--Sobic008G065400 Sobic009G121750--Sobic005G079700 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic009G121750--Sobic006G249200 Sobic009G121750--Sobic005G166300 Sobic009G121750--Sobic003G429500 Sobic009G121750--Sobic008G106400 Sobic009G121750--Sobic002G171400 Sobic009G121750--Sobic003G366850 Sobic004G332000 Sobic004G332000 Sobic006G261500--Sobic004G332000 Sobic002G119800 Sobic002G119800 Sobic006G261500--Sobic002G119800 Sobic001G272200 Sobic001G272200 Sobic006G261500--Sobic001G272200 Sobic006G213601 Sobic006G213601 Sobic006G261500--Sobic006G213601 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic006G261500--Sobic004G152601 Sobic006G261500--Sobic003G283250 Sobic003G357166 Sobic003G357166 Sobic006G261500--Sobic003G357166 Sobic006G261500--Sobic008G065400 Sobic010G148750 Sobic010G148750 Sobic006G261500--Sobic010G148750 Sobic007G144400--Sobic007G144400 Sobic007G044500 Sobic007G044500 Sobic007G144400--Sobic007G044500 Sobic005G083733 Sobic005G083733 Sobic007G144400--Sobic005G083733 Sobic003G400266 Sobic003G400266 Sobic007G144400--Sobic003G400266 Sobic003G148700 Sobic003G148700 Sobic007G144400--Sobic003G148700 Sobic002G051300 Sobic002G051300 Sobic007G144400--Sobic002G051300 Sobic001G277000 Sobic001G277000 Sobic007G144400--Sobic001G277000 Sobic001G015300 Sobic001G015300 Sobic007G144400--Sobic001G015300 Sobic008G065400--Sobic001G278600 Sobic008G065400--Sobic002G431200 Sobic008G065400--Sobic003G366850 Sobic008G065400--Sobic003G374500 Sobic008G065400--Sobic005G079700 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic008G065400--Sobic003G266700 Sobic008G065400--Sobic008G106400 Sobic008G065400--Sobic002G171400 Sobic008G065400--Sobic003G429500 Sobic010G054500 Sobic010G054500 Sobic001G140200--Sobic010G054500 Sobic008G052500 Sobic008G052500 Sobic001G140200--Sobic008G052500 Sobic001G509400 Sobic001G509400 Sobic001G140200--Sobic001G509400 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic001G140200--Sobic008G044750 Sobic001G140200--Sobic008G065400 Sobic002G325600 Sobic002G325600 Sobic001G140200--Sobic002G325600 Sobic001G075101 Sobic001G075101 Sobic001G140200--Sobic001G075101 Sobic007G169600 Sobic007G169600 Sobic001G140200--Sobic007G169600 Sobic001G140200--Sobic005G079700
Octagon: transcription factors


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