Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G008700.1
Synonym Sb07g000930
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PF79
Pfam -
Panther DB PTHR33115 PTHR33115:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G14280 : ARM repeat superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g45570.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK14904 , PNT74647
Barley -
Wheat TraesCS2D02G140600
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G406700 expressed protein -
2 Sobic.003G387500 IQ calmodulin-binding motif domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G064600 expressed protein -
4 Sobic.001G402400 expressed protein -
5 Sobic.007G040301 - -
6 Sobic.006G144600 ARPC2B, putative, expressed K05758: actin related protein 2/3 complex, subunit 2
7 Sobic.005G087200 plant-specific domain TIGR01627 family protein, expressed K18801: glucuronoxylan 4-O-methyltransferase
8 Sobic.009G226900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@auxin-responsive protein, putative, expressed -
9 Sobic.010G096100 ras-related protein, putative, expressed K04392: Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1
10 Sobic.009G026101 - -
11 Sobic.010G007000 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
12 Sobic.003G270400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
13 Sobic.003G378800 amino acid transporter, putative, expressed -
14 Sobic.007G091900 ATP binding protein, putative, expressed -
15 Sobic.006G083700 expressed protein -
16 Sobic.004G274800 protein transport protein-related, putative, expressed -
17 Sobic.003G296500 leucine rich repeat family protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G362100 nodulation protein-related, putative, expressed -
19 Sobic.001G037400 expressed protein -
20 Sobic.006G075000 Late embryogenesis abundant hydroxyproline-rich glycoprotein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G008700 Sobic007G008700 Sobic001G406700 Sobic001G406700 Sobic007G008700--Sobic001G406700 Sobic003G387500 Sobic003G387500 Sobic007G008700--Sobic003G387500 Sobic002G064600 Sobic002G064600 Sobic007G008700--Sobic002G064600 Sobic001G402400 Sobic001G402400 Sobic007G008700--Sobic001G402400 Sobic007G040301 Sobic007G040301 Sobic007G008700--Sobic007G040301 Sobic006G144600 Sobic006G144600 Sobic007G008700--Sobic006G144600 Sobic005G087200 Sobic005G087200 Sobic007G008700--Sobic005G087200 Sobic009G226900 Sobic009G226900 Sobic007G008700--Sobic009G226900 Sobic010G096100 Sobic010G096100 Sobic007G008700--Sobic010G096100 Sobic001G406700--Sobic003G387500 Sobic001G406700--Sobic006G144600 Sobic001G399200 Sobic001G399200 Sobic001G406700--Sobic001G399200 Sobic009G170500 Sobic009G170500 Sobic001G406700--Sobic009G170500 Sobic010G232500 Sobic010G232500 Sobic001G406700--Sobic010G232500 Sobic002G167600 Sobic002G167600 Sobic001G406700--Sobic002G167600 Sobic005G229100 Sobic005G229100 Sobic001G406700--Sobic005G229100 Sobic007G119500 Sobic007G119500 Sobic001G406700--Sobic007G119500 Sobic009G246700 Sobic009G246700 Sobic001G406700--Sobic009G246700 Sobic003G387500--Sobic001G406700 Sobic003G387500--Sobic006G144600 Sobic001G224300 Sobic001G224300 Sobic003G387500--Sobic001G224300 Sobic003G387500--Sobic010G232500 Sobic003G387500--Sobic002G167600 Sobic003G387500--Sobic009G170500 Sobic009G162700 Sobic009G162700 Sobic003G387500--Sobic009G162700 Sobic002G205500 Sobic002G205500 Sobic003G387500--Sobic002G205500 Sobic003G387500--Sobic009G226900 Sobic010G007000 Sobic010G007000 Sobic002G064600--Sobic010G007000 Sobic005G110600 Sobic005G110600 Sobic002G064600--Sobic005G110600 Sobic008G170400 Sobic008G170400 Sobic002G064600--Sobic008G170400 Sobic003G296500 Sobic003G296500 Sobic002G064600--Sobic003G296500 Sobic003G419600 Sobic003G419600 Sobic002G064600--Sobic003G419600 Sobic002G062600 Sobic002G062600 Sobic002G064600--Sobic002G062600 Sobic003G006100 Sobic003G006100 Sobic002G064600--Sobic003G006100 Sobic006G062300 Sobic006G062300 Sobic002G064600--Sobic006G062300 Sobic005G130700 Sobic005G130700 Sobic002G064600--Sobic005G130700 Sobic003G270400 Sobic003G270400 Sobic001G402400--Sobic003G270400 Sobic003G052100 Sobic003G052100 Sobic001G402400--Sobic003G052100 Sobic002G275500 Sobic002G275500 Sobic001G402400--Sobic002G275500 Sobic001G402400--Sobic003G296500 Sobic010G220300 Sobic010G220300 Sobic001G402400--Sobic010G220300 Sobic008G014700 Sobic008G014700 Sobic001G402400--Sobic008G014700 Sobic005G057000 Sobic005G057000 Sobic001G402400--Sobic005G057000 Sobic002G376100 Sobic002G376100 Sobic001G402400--Sobic002G376100 Sobic006G009500 Sobic006G009500 Sobic001G402400--Sobic006G009500 Sobic009G206500 Sobic009G206500 Sobic007G040301--Sobic009G206500 Sobic001G437500 Sobic001G437500 Sobic007G040301--Sobic001G437500 Sobic009G026101 Sobic009G026101 Sobic007G040301--Sobic009G026101 Sobic001G144200 Sobic001G144200 Sobic007G040301--Sobic001G144200 Sobic007G040301--Sobic001G406700 Sobic008G141200 Sobic008G141200 Sobic007G040301--Sobic008G141200 Sobic004G274800 Sobic004G274800 Sobic007G040301--Sobic004G274800 Sobic009G151700 Sobic009G151700 Sobic007G040301--Sobic009G151700 Sobic006G267500 Sobic006G267500 Sobic007G040301--Sobic006G267500 Sobic006G144600--Sobic001G406700 Sobic006G144600--Sobic010G232500 Sobic006G144600--Sobic003G387500 Sobic006G144600--Sobic002G167600 Sobic006G144600--Sobic009G170500 Sobic006G144600--Sobic001G399200 Sobic006G144600--Sobic005G229100 Sobic006G144600--Sobic007G119500 Sobic007G223600 Sobic007G223600 Sobic006G144600--Sobic007G223600 Sobic005G087200--Sobic003G387500 Sobic005G087200--Sobic009G226900 Sobic002G164600 Sobic002G164600 Sobic005G087200--Sobic002G164600 Sobic003G236701 Sobic003G236701 Sobic005G087200--Sobic003G236701 Sobic003G112200 Sobic003G112200 Sobic005G087200--Sobic003G112200 Sobic001G336700 Sobic001G336700 Sobic005G087200--Sobic001G336700 Sobic005G087200--Sobic001G406700 Sobic009G241600 Sobic009G241600 Sobic005G087200--Sobic009G241600 Sobic008G112200 Sobic008G112200 Sobic005G087200--Sobic008G112200 Sobic003G062000 Sobic003G062000 Sobic009G226900--Sobic003G062000 Sobic009G226900--Sobic001G224300 Sobic003G296400 Sobic003G296400 Sobic009G226900--Sobic003G296400 Sobic009G226900--Sobic002G205500 Sobic009G226900--Sobic003G387500 Sobic006G036400 Sobic006G036400 Sobic009G226900--Sobic006G036400 Sobic009G226900--Sobic001G406700 Sobic009G226900--Sobic005G087200 Sobic006G075000 Sobic006G075000 Sobic009G226900--Sobic006G075000 Sobic010G096100--Sobic006G075000 Sobic001G208600 Sobic001G208600 Sobic010G096100--Sobic001G208600 Sobic009G063400 Sobic009G063400 Sobic010G096100--Sobic009G063400 Sobic010G096100--Sobic009G026101 Sobic009G125900 Sobic009G125900 Sobic010G096100--Sobic009G125900 Sobic009G017500 Sobic009G017500 Sobic010G096100--Sobic009G017500 Sobic009G251100 Sobic009G251100 Sobic010G096100--Sobic009G251100 Sobic001G484000 Sobic001G484000 Sobic010G096100--Sobic001G484000 Sobic010G114000 Sobic010G114000 Sobic010G096100--Sobic010G114000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.