Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G028832.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R7U0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G170200 OsFBDUF55 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G203800 expressed protein -
3 Sobic.005G185200 - -
4 Sobic.004G155700 LSM domain containing protein, expressed -
5 Sobic.007G048900 OsFBX381 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G067050 - -
7 Sobic.005G048950 - -
8 Sobic.001G093666 - -
9 Sobic.008G181050 - -
10 Sobic.004G088900 syntaxin-related protein, putative, expressed K08486: syntaxin 1B/2/3
11 Sobic.006G188600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@fringe-related protein, putative, expressed -
12 Sobic.005G212100 powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed -
13 Sobic.001G120200 OsFBDUF16 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
14 Sobic.006G181500 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K03248: translation initiation factor 3 subunit G
15 Sobic.004G329201 - K02260: cytochrome c oxidase assembly protein subunit 17
16 Sobic.006G254200 OsDegp11 - Putative Deg protease homologue, expressed -
17 Sobic.001G034200 60S ribosomal protein L36-2, putative, expressed K02920: RP-L36e, large subunit ribosomal protein L36e
18 Sobic.005G070301 - K03007: RPB10, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
19 Sobic.010G090700 expressed protein -
20 Sobic.002G014032 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G028832 Sobic007G028832 Sobic005G170200 Sobic005G170200 Sobic007G028832--Sobic005G170200 Sobic001G203800 Sobic001G203800 Sobic007G028832--Sobic001G203800 Sobic005G185200 Sobic005G185200 Sobic007G028832--Sobic005G185200 Sobic004G155700 Sobic004G155700 Sobic007G028832--Sobic004G155700 Sobic007G048900 Sobic007G048900 Sobic007G028832--Sobic007G048900 Sobic006G067050 Sobic006G067050 Sobic007G028832--Sobic006G067050 Sobic005G048950 Sobic005G048950 Sobic007G028832--Sobic005G048950 Sobic001G093666 Sobic001G093666 Sobic007G028832--Sobic001G093666 Sobic008G181050 Sobic008G181050 Sobic007G028832--Sobic008G181050 Sobic001G144150 Sobic001G144150 Sobic005G170200--Sobic001G144150 Sobic010G263700 Sobic010G263700 Sobic005G170200--Sobic010G263700 Sobic001G186700 Sobic001G186700 Sobic005G170200--Sobic001G186700 Sobic001G034200 Sobic001G034200 Sobic005G170200--Sobic001G034200 Sobic005G074300 Sobic005G074300 Sobic005G170200--Sobic005G074300 Sobic004G038400 Sobic004G038400 Sobic005G170200--Sobic004G038400 Sobic003G005700 Sobic003G005700 Sobic005G170200--Sobic003G005700 Sobic003G048400 Sobic003G048400 Sobic005G170200--Sobic003G048400 Sobic006G070564 Sobic006G070564 Sobic005G170200--Sobic006G070564 Sobic003G270100 Sobic003G270100 Sobic001G203800--Sobic003G270100 Sobic004G328100 Sobic004G328100 Sobic001G203800--Sobic004G328100 Sobic006G208200 Sobic006G208200 Sobic001G203800--Sobic006G208200 Sobic002G037600 Sobic002G037600 Sobic001G203800--Sobic002G037600 Sobic005G048600 Sobic005G048600 Sobic001G203800--Sobic005G048600 Sobic001G080800 Sobic001G080800 Sobic001G203800--Sobic001G080800 Sobic004G215200 Sobic004G215200 Sobic001G203800--Sobic004G215200 Sobic003G308300 Sobic003G308300 Sobic001G203800--Sobic003G308300 Sobic001G073700 Sobic001G073700 Sobic001G203800--Sobic001G073700 Sobic003G044700 Sobic003G044700 Sobic005G185200--Sobic003G044700 Sobic001G135200 Sobic001G135200 Sobic005G185200--Sobic001G135200 Sobic001G188000 Sobic001G188000 Sobic005G185200--Sobic001G188000 Sobic005G185200--Sobic001G203800 Sobic001G528100 Sobic001G528100 Sobic005G185200--Sobic001G528100 Sobic005G185200--Sobic002G037600 Sobic003G284100 Sobic003G284100 Sobic005G185200--Sobic003G284100 Sobic005G185200--Sobic004G328100 Sobic003G335300 Sobic003G335300 Sobic005G185200--Sobic003G335300 Sobic001G313150 Sobic001G313150 Sobic004G155700--Sobic001G313150 Sobic008G154600 Sobic008G154600 Sobic004G155700--Sobic008G154600 Sobic001G392700 Sobic001G392700 Sobic004G155700--Sobic001G392700 Sobic009G056900 Sobic009G056900 Sobic004G155700--Sobic009G056900 Sobic001G075201 Sobic001G075201 Sobic004G155700--Sobic001G075201 Sobic009G119100 Sobic009G119100 Sobic004G155700--Sobic009G119100 Sobic010G051800 Sobic010G051800 Sobic004G155700--Sobic010G051800 Sobic008G105600 Sobic008G105600 Sobic004G155700--Sobic008G105600 Sobic008G095633 Sobic008G095633 Sobic004G155700--Sobic008G095633 Sobic001G506400 Sobic001G506400 Sobic007G048900--Sobic001G506400 Sobic007G060100 Sobic007G060100 Sobic007G048900--Sobic007G060100 Sobic004G168900 Sobic004G168900 Sobic007G048900--Sobic004G168900 Sobic007G048900--Sobic010G263700 Sobic007G048900--Sobic004G038400 Sobic007G048900--Sobic001G034200 Sobic010G263400 Sobic010G263400 Sobic007G048900--Sobic010G263400 Sobic003G342500 Sobic003G342500 Sobic007G048900--Sobic003G342500 Sobic007G144100 Sobic007G144100 Sobic007G048900--Sobic007G144100 Sobic010G049700 Sobic010G049700 Sobic006G067050--Sobic010G049700 Sobic004G032600 Sobic004G032600 Sobic006G067050--Sobic004G032600 Sobic010G143633 Sobic010G143633 Sobic006G067050--Sobic010G143633 Sobic006G067050--Sobic005G048950 Sobic004G116050 Sobic004G116050 Sobic006G067050--Sobic004G116050 Sobic005G144500 Sobic005G144500 Sobic006G067050--Sobic005G144500 Sobic003G001901 Sobic003G001901 Sobic006G067050--Sobic003G001901 Sobic006G067050--Sobic008G105600 Sobic005G173700 Sobic005G173700 Sobic006G067050--Sobic005G173700 Sobic005G048950--Sobic010G143633 Sobic005G048950--Sobic008G105600 Sobic005G048950--Sobic010G049700 Sobic005G048950--Sobic004G116050 Sobic005G048950--Sobic001G093666 Sobic006G038700 Sobic006G038700 Sobic005G048950--Sobic006G038700 Sobic003G167200 Sobic003G167200 Sobic005G048950--Sobic003G167200 Sobic007G171700 Sobic007G171700 Sobic005G048950--Sobic007G171700 Sobic001G117701 Sobic001G117701 Sobic005G048950--Sobic001G117701 Sobic001G093666--Sobic010G049700 Sobic001G093666--Sobic010G143633 Sobic001G093666--Sobic004G116050 Sobic001G093666--Sobic005G144500 Sobic001G093666--Sobic005G048950 Sobic002G382100 Sobic002G382100 Sobic001G093666--Sobic002G382100 Sobic001G093666--Sobic007G171700 Sobic002G361500 Sobic002G361500 Sobic001G093666--Sobic002G361500 Sobic004G329201 Sobic004G329201 Sobic001G093666--Sobic004G329201 Sobic002G170740 Sobic002G170740 Sobic008G181050--Sobic002G170740 Sobic002G028000 Sobic002G028000 Sobic008G181050--Sobic002G028000 Sobic008G064250 Sobic008G064250 Sobic008G181050--Sobic008G064250 Sobic005G116250 Sobic005G116250 Sobic008G181050--Sobic005G116250 Sobic002G016250 Sobic002G016250 Sobic008G181050--Sobic002G016250 Sobic005G165632 Sobic005G165632 Sobic008G181050--Sobic005G165632 Sobic005G215100 Sobic005G215100 Sobic008G181050--Sobic005G215100 Sobic009G218100 Sobic009G218100 Sobic008G181050--Sobic009G218100 Sobic003G101200 Sobic003G101200 Sobic008G181050--Sobic003G101200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.