Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G095400.1
Synonym Sb07g009460
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YJV8
Pfam -
Panther DB PTHR34774 PTHR34774:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G79660 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g16559.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030858 , Zm00025a054587
Brachypodium KQJ95832
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.007G095400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G263800 peptidase, T1 family, putative, expressed K02736: 20S proteasome subunit beta 7
2 Sobic.009G016201 - K09481: SEC61B, protein transport protein SEC61 subunit beta
3 Sobic.008G161800 proteasome subunit, putative, expressed K03036: PSMD11, 26S proteasome regulatory subunit N6
4 Sobic.010G039800 expressed protein -
5 Sobic.009G180000 OsCam1-3 - Calmodulin, expressed K02183: calmodulin
6 Sobic.004G196300 ras-related protein, putative, expressed K07877: Ras-related protein Rab-2A
7 Sobic.001G483100 peptidase, T1 family, putative, expressed K02730: 20S proteasome subunit alpha 1
8 Sobic.010G173100 elongation factor 1-gamma, putative, expressed K03233: elongation factor 1-gamma
9 Sobic.010G042800 peptidase, T1 family, putative, expressed K02737: 20S proteasome subunit beta 5
10 Sobic.001G048832 - -
11 Sobic.003G344600 BAG domain containing protein, expressed -
12 Sobic.004G066800 peptidase, T1 family, putative, expressed K02735: 20S proteasome subunit beta 3
13 Sobic.003G107600 3-beta-hydroxysteroid-Delta-isomerase, putative, expressed K01824: cholestenol Delta-isomerase
14 Sobic.002G078400 ADP-ribosylation factor, putative, expressed K07937: ADP-ribosylation factor 1/2
K07977: Arf/Sar family, other
15 Sobic.001G132100 expressed protein -
16 Sobic.004G333500 proteasome maturation factor UMP1 family protein, expressed K11599: POMP, proteasome maturation protein
17 Sobic.002G282400 expressed protein -
18 Sobic.004G172700 plant neutral invertase domain containing protein, expressed -
19 Sobic.010G182600 elongation factor Tu, putative, expressed K03231: elongation factor 1-alpha
20 Sobic.001G533500 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim, putative, expressed K17777: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM9


Gene co-expression network
sample Sobic007G095400 Sobic007G095400 Sobic002G263800 Sobic002G263800 Sobic007G095400--Sobic002G263800 Sobic009G016201 Sobic009G016201 Sobic007G095400--Sobic009G016201 Sobic008G161800 Sobic008G161800 Sobic007G095400--Sobic008G161800 Sobic010G039800 Sobic010G039800 Sobic007G095400--Sobic010G039800 Sobic009G180000 Sobic009G180000 Sobic007G095400--Sobic009G180000 Sobic004G196300 Sobic004G196300 Sobic007G095400--Sobic004G196300 Sobic001G483100 Sobic001G483100 Sobic007G095400--Sobic001G483100 Sobic010G173100 Sobic010G173100 Sobic007G095400--Sobic010G173100 Sobic010G042800 Sobic010G042800 Sobic007G095400--Sobic010G042800 Sobic002G263800--Sobic008G161800 Sobic002G263800--Sobic007G095400 Sobic002G263800--Sobic001G483100 Sobic002G263800--Sobic009G180000 Sobic002G263800--Sobic010G173100 Sobic002G263800--Sobic010G039800 Sobic002G263800--Sobic009G016201 Sobic010G204500 Sobic010G204500 Sobic002G263800--Sobic010G204500 Sobic004G310300 Sobic004G310300 Sobic002G263800--Sobic004G310300 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Octagon: transcription factors


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