Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G088851.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C6JRP3 , A0A125QUJ3 , A0A1Z5R628
Pfam PF01979
Panther DB PTHR11271 PTHR11271:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016787; hydrolase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g28270.1 : amidohydrolase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a024897
Brachypodium PNT62729 , PNT62728 , PNT62734 , PNT62735 , PNT62736 , PNT62737 , PNT62730 , PNT62731 , PNT62732 , PNT62733 , KQJ86769 , KQJ86768 , KQJ86772 , KQJ86773 , KQJ86770 , KQJ86771
Barley HORVU5Hr1G022640.1 , HORVU5Hr1G022640.3 , HORVU5Hr1G022640.2 , HORVU5Hr1G022640.5 , HORVU5Hr1G022640.4 , HORVU5Hr1G022640.7 , HORVU5Hr1G022640.6 , HORVU5Hr1G022640.8 , HORVU5Hr1G022640.11 , HORVU5Hr1G022640.10 , HORVU5Hr1G022640.12 , HORVU5Hr1G022640.9
Wheat TraesCS5B02G092900 , TraesCS5B02G092900 , TraesCS5B02G092900 , TraesCS5B02G092900 , TraesCS5A02G086900 , TraesCS5D02G099200 , TraesCS5D02G099200
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G088857 - -
2 Sobic.002G009300 expressed protein K01427: urease
3 Sobic.003G164200 cullin, putative, expressed K03347: CUL1, cullin 1
4 Sobic.006G049600 methyltransferase domain containing protein, expressed -
5 Sobic.010G080700 DNA-directed RNA polymerase subunit, putative, expressed K03021: RPC2, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2
6 Sobic.004G127700 alpha-1,2-fucosidase, putative, expressed K15923: AXY8, FUC95A, alpha-L-fucosidase 2
7 Sobic.009G047200 protein kinase domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G404600 expressed protein K18270: Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit
9 Sobic.003G294600 Homeobox domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G308500 peptide-Nasparagine amidase, putative, expressed K01456: E3.5.1.52, NGLY1, peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase
11 Sobic.010G053600 pre-mRNA-processing-splicing factor 8, putative, expressed K12856: PRPF8, pre-mRNA-processing factor 8
12 Sobic.004G158700 copine, putative, expressed -
13 Sobic.002G127400 glycosyl hydrolase family 10 protein, putative, expressed -
14 Sobic.008G004600 ubiquitin-activating enzyme, putative, expressed K03178: UBE1, ubiquitin-activating enzyme E1
15 Sobic.001G287500 heat shock protein DnaJ, putative, expressed K09533: DnaJ homolog subfamily C member 13
16 Sobic.009G139900 rab GDP dissociation inhibitor alpha, putative, expressed K17255: Rab GDP dissociation inhibitor
17 Sobic.006G208500 proteasome/cyclosome repeat containing protein, expressed K03032: PSMD1, 26S proteasome regulatory subunit N2
18 Sobic.001G110600 HEAT repeat family protein, putative, expressed -
19 Sobic.006G036100 expressed protein K11266: MAternally affected uncoordination
20 Sobic.006G247900 phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative, expressed K01952: PFAS, phosphoribosylformylglycinamidine synthase


Gene co-expression network
sample Sobic008G088851 Sobic008G088851 Sobic008G088857 Sobic008G088857 Sobic008G088851--Sobic008G088857 Sobic002G009300 Sobic002G009300 Sobic008G088851--Sobic002G009300 Sobic003G164200 Sobic003G164200 Sobic008G088851--Sobic003G164200 Sobic006G049600 Sobic006G049600 Sobic008G088851--Sobic006G049600 Sobic010G080700 Sobic010G080700 Sobic008G088851--Sobic010G080700 Sobic004G127700 Sobic004G127700 Sobic008G088851--Sobic004G127700 Sobic009G047200 Sobic009G047200 Sobic008G088851--Sobic009G047200 Sobic001G404600 Sobic001G404600 Sobic008G088851--Sobic001G404600 Sobic003G294600 Sobic003G294600 Sobic008G088851--Sobic003G294600 Sobic008G088857--Sobic008G088851 Sobic008G088857--Sobic002G009300 Sobic009G139900 Sobic009G139900 Sobic008G088857--Sobic009G139900 Sobic008G088857--Sobic004G127700 Sobic008G088857--Sobic001G404600 Sobic006G213400 Sobic006G213400 Sobic008G088857--Sobic006G213400 Sobic007G071900 Sobic007G071900 Sobic008G088857--Sobic007G071900 Sobic006G247900 Sobic006G247900 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Octagon: transcription factors


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