Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G183100.2
Synonym Sb08g022470
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R7F5
Pfam PF04578 PF13968
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF31
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45530 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g24410.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ89499
Barley -
Wheat TraesCS3B02G592700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G220300 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.002G238700 - -
3 Sobic.002G337100 nucleoside transporter, putative, expressed K15014: SLC29A1_2_3, solute carrier family 29 (equilibrative nucleoside transporter), member 1/2/3
4 Sobic.005G219700 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
5 Sobic.001G402400 expressed protein -
6 Sobic.007G020700 ACT domain containing protein, expressed -
7 Sobic.003G255600 expressed protein -
8 Sobic.005G066500 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
9 Sobic.008G133000 expressed protein -
10 Sobic.001G067800 metal cation transporter, putative, expressed K07238: TC.ZIP, zupT, ZRT3, zinc transporter, ZIP family
11 Sobic.001G514300 Glutathione S-transferase("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
12 Sobic.002G376100 STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 6 precursor, putative, expressed -
13 Sobic.006G180300 ethylene-responsive protein related, putative, expressed -
14 Sobic.005G067300 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase, putative, expressed K05933: aminocyclopropanecarboxylate oxidase
15 Sobic.001G314000 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
16 Sobic.005G022500 alpha-N-arabinofuranosidase A, putative, expressed K01209: alpha-L-arabinofuranosidase
17 Sobic.002G221800 similar to Protein HVA22(PubMedID : 29862293)@HVA22, putative, expressed K17279: receptor expression-enhancing protein 5/6
18 Sobic.009G079900 endoglucanase precursor, putative, expressed -
19 Sobic.001G238500 similar to Putative uncharacterized protein(PubMedID : 29862293)@UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed K13691: pathogen-inducible salicylic acid glucosyltransferase
20 Sobic.005G065700 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G183100 Sobic008G183100 Sobic010G220300 Sobic010G220300 Sobic008G183100--Sobic010G220300 Sobic002G238700 Sobic002G238700 Sobic008G183100--Sobic002G238700 Sobic002G337100 Sobic002G337100 Sobic008G183100--Sobic002G337100 Sobic005G219700 Sobic005G219700 Sobic008G183100--Sobic005G219700 Sobic001G402400 Sobic001G402400 Sobic008G183100--Sobic001G402400 Sobic007G020700 Sobic007G020700 Sobic008G183100--Sobic007G020700 Sobic003G255600 Sobic003G255600 Sobic008G183100--Sobic003G255600 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic008G183100--Sobic005G066500 Sobic008G133000 Sobic008G133000 Sobic008G183100--Sobic008G133000 Sobic007G041600 Sobic007G041600 Sobic010G220300--Sobic007G041600 Sobic010G220300--Sobic007G020700 Sobic006G009500 Sobic006G009500 Sobic010G220300--Sobic006G009500 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic010G220300--Sobic004G312500 Sobic009G079900 Sobic009G079900 Sobic010G220300--Sobic009G079900 Sobic010G220300--Sobic001G402400 Sobic010G220300--Sobic005G219700 Sobic005G071900 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Octagon: transcription factors


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