Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G040175.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P6N0
Pfam PF00560 PF08263 PF13855
Panther DB PTHR27000 PTHR27000:SF82
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G46330 : Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g40240.1 : receptor kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT66390 , KQJ94512
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G076700 cytochrome P450, putative, expressed -
2 Sobic.001G272900 avr9/Cf-9 rapidly elicited protein 74, putative, expressed -
3 Sobic.001G499701 - -
4 Sobic.005G049350 - -
5 Sobic.005G220740 - -
6 Sobic.001G326400 cytochrome P450, putative, expressed -
7 Sobic.007G149000 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@cytochrome P450, putative, expressed -
8 Sobic.005G048400 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
9 Sobic.002G063566 - -
10 Sobic.001G070100 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR1 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
11 Sobic.007G120000 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G277600 TKL_IRAK_DUF26-la.5 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
13 Sobic.005G220800 receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.003G106300 3-beta-hydroxysteroid-Delta-isomerase, putative, expressed K01824: cholestenol Delta-isomerase
15 Sobic.009G098000 expressed protein -
16 Sobic.004G337950 - -
17 Sobic.003G176300 - -
18 Sobic.009G079200 expressed protein -
19 Sobic.004G010050 - -
20 Sobic.001G521600 Leucine-rich repeat family protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@leucine-rich repeat family protein, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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