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Transcriptome id Sobic.009G048400.3
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Functional annotation -
UniProt A0A1B6P6Q5
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G040700 choline/ethanolamine kinase, putative, expressed K14156: choline/ethanolamine kinase
2 Sobic.010G128350 - -
3 Sobic.010G010201 - -
4 Sobic.007G039200 MYB family transcription factor, putative, expressed -
5 Sobic.007G138000 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G322400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@actin-depolymerizing factor, putative, expressed K05765: cofilin
7 Sobic.010G073900 expressed protein -
8 Sobic.006G267100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
9 Sobic.006G045100 - -
10 Sobic.009G238650 - -
11 Sobic.006G171600 ZOS4-10 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
12 Sobic.001G414650 - K08678: UXS1, UDP-glucuronate decarboxylase
13 Sobic.006G239500 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G088600 glucose-1-phosphate adenylyltransferase large subunit, putative, expressed K00975: glucose-1-phosphate adenylyltransferase
15 Sobic.009G202000 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G135800 pentatricopeptide, putative, expressed -
17 Sobic.001G432200 pleckstrin homology domain-containing protein-related taxo, putative, expressed -
18 Sobic.001G072000 succinate dehydrogenase flavoprotein subunit,mitochondrial precursor, putative, expressed K00234: SDHA, succinate dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein subunit
19 Sobic.002G199800 - -
20 Sobic.004G177900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G048400 Sobic009G048400 Sobic003G040700 Sobic003G040700 Sobic009G048400--Sobic003G040700 Sobic010G128350 Sobic010G128350 Sobic009G048400--Sobic010G128350 Sobic010G010201 Sobic010G010201 Sobic009G048400--Sobic010G010201 Sobic007G039200 Sobic007G039200 Sobic009G048400--Sobic007G039200 Sobic007G138000 Sobic007G138000 Sobic009G048400--Sobic007G138000 Sobic001G322400 Sobic001G322400 Sobic009G048400--Sobic001G322400 Sobic010G073900 Sobic010G073900 Sobic009G048400--Sobic010G073900 Sobic006G267100 Sobic006G267100 Sobic009G048400--Sobic006G267100 Sobic006G045100 Sobic006G045100 Sobic009G048400--Sobic006G045100 Sobic002G362500 Sobic002G362500 Sobic003G040700--Sobic002G362500 Sobic004G074900 Sobic004G074900 Sobic003G040700--Sobic004G074900 Sobic003G040700--Sobic007G138000 Sobic007G101600 Sobic007G101600 Sobic003G040700--Sobic007G101600 Sobic004G062200 Sobic004G062200 Sobic003G040700--Sobic004G062200 Sobic003G040700--Sobic007G039200 Sobic003G040700--Sobic006G267100 Sobic001G073700 Sobic001G073700 Sobic003G040700--Sobic001G073700 Sobic002G389600 Sobic002G389600 Sobic003G040700--Sobic002G389600 Sobic010G128350--Sobic010G010201 Sobic009G238650 Sobic009G238650 Sobic010G128350--Sobic009G238650 Sobic006G239500 Sobic006G239500 Sobic010G128350--Sobic006G239500 Sobic001G165901 Sobic001G165901 Sobic010G128350--Sobic001G165901 Sobic004G349600 Sobic004G349600 Sobic010G128350--Sobic004G349600 Sobic010G128350--Sobic010G073900 Sobic002G199800 Sobic002G199800 Sobic010G128350--Sobic002G199800 Sobic001G432200 Sobic001G432200 Sobic010G128350--Sobic001G432200 Sobic002G088600 Sobic002G088600 Sobic010G128350--Sobic002G088600 Sobic010G010201--Sobic010G128350 Sobic010G010201--Sobic001G432200 Sobic010G253600 Sobic010G253600 Sobic010G010201--Sobic010G253600 Sobic007G142801 Sobic007G142801 Sobic010G010201--Sobic007G142801 Sobic010G010201--Sobic002G088600 Sobic003G093100 Sobic003G093100 Sobic010G010201--Sobic003G093100 Sobic010G010201--Sobic001G165901 Sobic001G135800 Sobic001G135800 Sobic010G010201--Sobic001G135800 Sobic001G172100 Sobic001G172100 Sobic010G010201--Sobic001G172100 Sobic001G340800 Sobic001G340800 Sobic007G039200--Sobic001G340800 Sobic007G039200--Sobic002G389600 Sobic009G061500 Sobic009G061500 Sobic007G039200--Sobic009G061500 Sobic008G136601 Sobic008G136601 Sobic007G039200--Sobic008G136601 Sobic009G230800 Sobic009G230800 Sobic007G039200--Sobic009G230800 Sobic004G290600 Sobic004G290600 Sobic007G039200--Sobic004G290600 Sobic008G166100 Sobic008G166100 Sobic007G039200--Sobic008G166100 Sobic001G384200 Sobic001G384200 Sobic007G039200--Sobic001G384200 Sobic008G159701 Sobic008G159701 Sobic007G039200--Sobic008G159701 Sobic004G042501 Sobic004G042501 Sobic007G138000--Sobic004G042501 Sobic007G070900 Sobic007G070900 Sobic007G138000--Sobic007G070900 Sobic002G106600 Sobic002G106600 Sobic007G138000--Sobic002G106600 Sobic004G180100 Sobic004G180100 Sobic007G138000--Sobic004G180100 Sobic005G003700 Sobic005G003700 Sobic007G138000--Sobic005G003700 Sobic005G135100 Sobic005G135100 Sobic007G138000--Sobic005G135100 Sobic002G340600 Sobic002G340600 Sobic007G138000--Sobic002G340600 Sobic001G357400 Sobic001G357400 Sobic007G138000--Sobic001G357400 Sobic007G138000--Sobic007G101600 Sobic001G072000 Sobic001G072000 Sobic001G322400--Sobic001G072000 Sobic001G322400--Sobic010G073900 Sobic001G322400--Sobic001G432200 Sobic001G322400--Sobic008G166100 Sobic004G279200 Sobic004G279200 Sobic001G322400--Sobic004G279200 Sobic007G048101 Sobic007G048101 Sobic001G322400--Sobic007G048101 Sobic009G202000 Sobic009G202000 Sobic001G322400--Sobic009G202000 Sobic001G322400--Sobic009G238650 Sobic003G407700 Sobic003G407700 Sobic001G322400--Sobic003G407700 Sobic010G073900--Sobic003G407700 Sobic010G073900--Sobic002G199800 Sobic010G073900--Sobic009G238650 Sobic010G073900--Sobic006G239500 Sobic010G073900--Sobic004G349600 Sobic010G073900--Sobic001G322400 Sobic010G073900--Sobic010G128350 Sobic009G098700 Sobic009G098700 Sobic010G073900--Sobic009G098700 Sobic009G121200 Sobic009G121200 Sobic010G073900--Sobic009G121200 Sobic008G071300 Sobic008G071300 Sobic006G267100--Sobic008G071300 Sobic001G414650 Sobic001G414650 Sobic006G267100--Sobic001G414650 Sobic006G267100--Sobic002G340600 Sobic003G114600 Sobic003G114600 Sobic006G267100--Sobic003G114600 Sobic002G283200 Sobic002G283200 Sobic006G267100--Sobic002G283200 Sobic006G105100 Sobic006G105100 Sobic006G267100--Sobic006G105100 Sobic006G267100--Sobic004G042501 Sobic002G380300 Sobic002G380300 Sobic006G267100--Sobic002G380300 Sobic003G290500 Sobic003G290500 Sobic006G267100--Sobic003G290500 Sobic006G045100--Sobic003G040700 Sobic006G045100--Sobic007G039200 Sobic006G045100--Sobic009G048400 Sobic006G045100--Sobic004G074900 Sobic006G045100--Sobic007G138000 Sobic006G045100--Sobic007G101600 Sobic006G045100--Sobic002G362500 Sobic006G045100--Sobic006G267100 Sobic006G045100--Sobic002G389600
Octagon: transcription factors


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