Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G056500.1
Synonym Sb09g004760
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt C5Z0Q2
Pfam PF13639
Panther DB PTHR22937 PTHR22937:SF45
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G15530 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g07070.7 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a042927
Brachypodium KQK07336 , KQK07337 , KQK07338 , KQK07339 , KQK07340 , PNT71731 , PNT71732
Barley HORVU1Hr1G024190.9 , HORVU1Hr1G024190.8 , HORVU1Hr1G024190.3 , HORVU1Hr1G024190.2 , HORVU1Hr1G024190.1 , HORVU1Hr1G024190.7 , HORVU1Hr1G024190.6 , HORVU1Hr1G024190.5 , HORVU1Hr1G024190.4
Wheat TraesCS1A02G107600 , TraesCS1D02G111500 , TraesCS1D02G111500 , TraesCS1D02G111500 , TraesCS1B02G129600 , TraesCS1B02G129600 , TraesCS1B02G129600 , TraesCS1B02G129600 , TraesCS1A02G107600
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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic009G056500 Sobic009G056500 Sobic007G167500 Sobic007G167500 Sobic009G056500--Sobic007G167500 Sobic005G118600 Sobic005G118600 Sobic009G056500--Sobic005G118600 Sobic003G059750 Sobic003G059750 Sobic009G056500--Sobic003G059750 Sobic007G103600 Sobic007G103600 Sobic009G056500--Sobic007G103600 Sobic002G404700 Sobic002G404700 Sobic009G056500--Sobic002G404700 Sobic005G207500 Sobic005G207500 Sobic009G056500--Sobic005G207500 Sobic001G384300 Sobic001G384300 Sobic009G056500--Sobic001G384300 Sobic002G112700 Sobic002G112700 Sobic009G056500--Sobic002G112700 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic009G056500--Sobic006G216800 Sobic003G119000 Sobic003G119000 Sobic007G167500--Sobic003G119000 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic007G167500--Sobic002G006900 Sobic003G397800 Sobic003G397800 Sobic007G167500--Sobic003G397800 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic007G167500--Sobic007G096600 Sobic010G101800 Sobic010G101800 Sobic007G167500--Sobic010G101800 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic007G167500--Sobic007G065400 Sobic009G210500 Sobic009G210500 Sobic007G167500--Sobic009G210500 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic007G167500--Sobic003G332800 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic007G167500--Sobic003G372700 Sobic005G118600--Sobic003G059750 Sobic008G084700 Sobic008G084700 Sobic005G118600--Sobic008G084700 Sobic003G225700 Sobic003G225700 Sobic005G118600--Sobic003G225700 Sobic001G065000 Sobic001G065000 Sobic005G118600--Sobic001G065000 Sobic009G166300 Sobic009G166300 Sobic005G118600--Sobic009G166300 Sobic008G153000 Sobic008G153000 Sobic005G118600--Sobic008G153000 Sobic001G114000 Sobic001G114000 Sobic005G118600--Sobic001G114000 Sobic002G071500 Sobic002G071500 Sobic005G118600--Sobic002G071500 Sobic005G118600--Sobic007G103600 Sobic003G059750--Sobic007G103600 Sobic003G059750--Sobic005G207500 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic003G059750--Sobic005G112300 Sobic010G279450 Sobic010G279450 Sobic003G059750--Sobic010G279450 Sobic003G059750--Sobic002G404700 Sobic003G444800 Sobic003G444800 Sobic003G059750--Sobic003G444800 Sobic001G311500 Sobic001G311500 Sobic003G059750--Sobic001G311500 Sobic002G405800 Sobic002G405800 Sobic003G059750--Sobic002G405800 Sobic003G059750--Sobic002G071500 Sobic007G103600--Sobic003G059750 Sobic007G103600--Sobic005G207500 Sobic007G103600--Sobic005G118600 Sobic007G103600--Sobic003G444800 Sobic007G103600--Sobic002G071500 Sobic007G103600--Sobic008G153000 Sobic007G103600--Sobic003G119000 Sobic002G264200 Sobic002G264200 Sobic007G103600--Sobic002G264200 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic007G103600--Sobic006G032500 Sobic002G404700--Sobic002G405800 Sobic002G404700--Sobic003G059750 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic002G404700--Sobic002G309600 Sobic007G126600 Sobic007G126600 Sobic002G404700--Sobic007G126600 Sobic004G314000 Sobic004G314000 Sobic002G404700--Sobic004G314000 Sobic002G404700--Sobic005G112300 Sobic002G404700--Sobic010G279450 Sobic002G404700--Sobic003G119000 Sobic001G241200 Sobic001G241200 Sobic002G404700--Sobic001G241200 Sobic005G207500--Sobic003G059750 Sobic002G153700 Sobic002G153700 Sobic005G207500--Sobic002G153700 Sobic005G207500--Sobic007G103600 Sobic005G207500--Sobic003G119000 Sobic008G009700 Sobic008G009700 Sobic005G207500--Sobic008G009700 Sobic002G353600 Sobic002G353600 Sobic005G207500--Sobic002G353600 Sobic010G069100 Sobic010G069100 Sobic005G207500--Sobic010G069100 Sobic005G207500--Sobic002G071500 Sobic001G026200 Sobic001G026200 Sobic005G207500--Sobic001G026200 Sobic007G090430 Sobic007G090430 Sobic001G384300--Sobic007G090430 Sobic006G096900 Sobic006G096900 Sobic001G384300--Sobic006G096900 Sobic002G083500 Sobic002G083500 Sobic001G384300--Sobic002G083500 Sobic001G227200 Sobic001G227200 Sobic001G384300--Sobic001G227200 Sobic002G343901 Sobic002G343901 Sobic001G384300--Sobic002G343901 Sobic001G433800 Sobic001G433800 Sobic001G384300--Sobic001G433800 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic001G384300--Sobic001G456900 Sobic008G113100 Sobic008G113100 Sobic001G384300--Sobic008G113100 Sobic008G162900 Sobic008G162900 Sobic001G384300--Sobic008G162900 Sobic002G112700--Sobic001G114000 Sobic007G218000 Sobic007G218000 Sobic002G112700--Sobic007G218000 Sobic007G008900 Sobic007G008900 Sobic002G112700--Sobic007G008900 Sobic002G112700--Sobic003G059750 Sobic002G112700--Sobic002G405800 Sobic002G112700--Sobic003G444800 Sobic004G072100 Sobic004G072100 Sobic002G112700--Sobic004G072100 Sobic007G011300 Sobic007G011300 Sobic002G112700--Sobic007G011300 Sobic002G112700--Sobic009G166300 Sobic002G133400 Sobic002G133400 Sobic006G216800--Sobic002G133400 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic006G216800--Sobic007G116200 Sobic006G216800--Sobic002G309600 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic006G216800--Sobic002G134200 Sobic006G216800--Sobic003G332800 Sobic006G216800--Sobic005G112300 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic006G216800--Sobic003G280800 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic006G216800--Sobic010G139000 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic006G216800--Sobic010G277500
Octagon: transcription factors


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