Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G194300.1
Synonym Sb09g025270
Functional annotation BSD, putative, expressed
UniProt A0A1B6P9B7
Pfam PF03909
Panther DB PTHR31923 PTHR31923:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G49800 : BSD domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g43520.1 : BSD, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037918
Brachypodium PNT70935 , KQK09922
Barley -
Wheat TraesCS1A02G331900
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G194300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G056300 PHD finger protein, putative, expressed -
2 Sobic.002G231300 CAMK_CAMK_like.38 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed -
3 Sobic.007G125700 NHL repeat-containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G005900 abscisic acid insensitive 8, putative, expressed -
5 Sobic.005G040900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10601: SYVN1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin
6 Sobic.003G253400 expressed protein -
7 Sobic.003G304800 OsRhmbd4 - Putative Rhomboid homologue, expressed -
8 Sobic.004G145600 expressed protein -
9 Sobic.007G036800 xylosyltransferase, putative, expressed -
10 Sobic.002G430900 PWWP domain containing protein, expressed -
11 Sobic.010G103500 ATMAP70 protein, putative, expressed -
12 Sobic.006G280100 SET domain containing protein, expressed -
13 Sobic.006G091000 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed K13617: protein phosphatase methylesterase 1
14 Sobic.002G014800 expressed protein -
15 Sobic.009G190200 transcription elongation factor SPT5 homolog 1, putative, expressed -
16 Sobic.008G125000 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
17 Sobic.010G269300 hydrolase, acting on carbon-nitrogen, putative, expressed -
18 Sobic.004G129500 expressed protein -
19 Sobic.009G125000 cyclin-dependent kinase C-1, putative, expressed K08819: cyclin-dependent kinase 12/13
20 Sobic.003G397100 lysine ketoglutarate reductase trans-splicing related 1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G194300 Sobic009G194300 Sobic009G056300 Sobic009G056300 Sobic009G194300--Sobic009G056300 Sobic002G231300 Sobic002G231300 Sobic009G194300--Sobic002G231300 Sobic007G125700 Sobic007G125700 Sobic009G194300--Sobic007G125700 Sobic003G005900 Sobic003G005900 Sobic009G194300--Sobic003G005900 Sobic005G040900 Sobic005G040900 Sobic009G194300--Sobic005G040900 Sobic003G253400 Sobic003G253400 Sobic009G194300--Sobic003G253400 Sobic003G304800 Sobic003G304800 Sobic009G194300--Sobic003G304800 Sobic004G145600 Sobic004G145600 Sobic009G194300--Sobic004G145600 Sobic007G036800 Sobic007G036800 Sobic009G194300--Sobic007G036800 Sobic008G125000 Sobic008G125000 Sobic009G056300--Sobic008G125000 Sobic004G206300 Sobic004G206300 Sobic009G056300--Sobic004G206300 Sobic002G224700 Sobic002G224700 Sobic009G056300--Sobic002G224700 Sobic009G056300--Sobic009G194300 Sobic001G041200 Sobic001G041200 Sobic009G056300--Sobic001G041200 Sobic001G080000 Sobic001G080000 Sobic009G056300--Sobic001G080000 Sobic004G027000 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Octagon: transcription factors


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