Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G057600.1
Synonym Sb10g004990
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VRM8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g48140.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G048400 - -
2 Sobic.009G180600 CAMK_CAMK_like.4 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
3 Sobic.001G207900 - -
4 Sobic.003G379000 OsMADS2 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
5 Sobic.004G355750 - -
6 Sobic.001G442400 - -
7 Sobic.004G336800 chloroplast unusual positioning protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G014500 THION20 - Plant thionin family protein precursor, putative, expressed -
9 Sobic.005G181500 expressed protein -
10 Sobic.006G096700 extracellular ligand-gated ion channel, putative, expressed -
11 Sobic.001G135700 - -
12 Sobic.007G060100 expressed protein -
13 Sobic.004G168900 elongation factor Tu family protein, putative, expressed K14536: ribosome assembly protein 1
14 Sobic.009G002100 expressed protein -
15 Sobic.007G144100 eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, putative, expressed K03252: translation initiation factor 3 subunit C
16 Sobic.005G185750 - -
17 Sobic.010G263400 expressed protein -
18 Sobic.006G171600 ZOS4-10 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
19 Sobic.005G209600 kinesin-4, putative, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
20 Sobic.002G061732 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G057600 Sobic010G057600 Sobic003G048400 Sobic003G048400 Sobic010G057600--Sobic003G048400 Sobic009G180600 Sobic009G180600 Sobic010G057600--Sobic009G180600 Sobic001G207900 Sobic001G207900 Sobic010G057600--Sobic001G207900 Sobic003G379000 Sobic003G379000 Sobic010G057600--Sobic003G379000 Sobic004G355750 Sobic004G355750 Sobic010G057600--Sobic004G355750 Sobic001G442400 Sobic001G442400 Sobic010G057600--Sobic001G442400 Sobic004G336800 Sobic004G336800 Sobic010G057600--Sobic004G336800 Sobic004G014500 Sobic004G014500 Sobic010G057600--Sobic004G014500 Sobic005G181500 Sobic005G181500 Sobic010G057600--Sobic005G181500 Sobic003G191300 Sobic003G191300 Sobic003G048400--Sobic003G191300 Sobic010G026200 Sobic010G026200 Sobic003G048400--Sobic010G026200 Sobic002G429000 Sobic002G429000 Sobic003G048400--Sobic002G429000 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic003G048400--Sobic002G402900 Sobic008G121600 Sobic008G121600 Sobic003G048400--Sobic008G121600 Sobic002G223650 Sobic002G223650 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Octagon: transcription factors


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