Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G073000.2
Synonym Sb10g006390
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VRW6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g09600.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G073000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G192700 polyphenol oxidase, putative, expressed K00422: polyphenol oxidase
2 Sobic.003G008200 thioesterase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G108500 dynein light chain type 1 domain containing protein, expressed -
4 Sobic.009G195500 expressed protein -
5 Sobic.003G348900 disease resistance-responsive family protein, putative, expressed -
6 Sobic.004G353650 - -
7 Sobic.004G208800 expressed protein -
8 Sobic.005G053001 - -
9 Sobic.003G186066 - -
10 Sobic.008G033800 ABCG protein(PubMedID : 21265893)@pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
11 Sobic.001G465600 AMP-binding domain containing protein, expressed -
12 Sobic.006G112000 expressed protein -
13 Sobic.004G243200 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
14 Sobic.001G395600 proteins of unknown function domain containing protein, expressed -
15 Sobic.005G021400 - -
16 Sobic.010G229300 expressed protein -
17 Sobic.010G224100 expressed protein -
18 Sobic.003G139600 expressed protein -
19 Sobic.003G249500 expressed protein -
20 Sobic.004G282966 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G073000 Sobic010G073000 Sobic010G192700 Sobic010G192700 Sobic010G073000--Sobic010G192700 Sobic003G008200 Sobic003G008200 Sobic010G073000--Sobic003G008200 Sobic006G108500 Sobic006G108500 Sobic010G073000--Sobic006G108500 Sobic009G195500 Sobic009G195500 Sobic010G073000--Sobic009G195500 Sobic003G348900 Sobic003G348900 Sobic010G073000--Sobic003G348900 Sobic004G353650 Sobic004G353650 Sobic010G073000--Sobic004G353650 Sobic004G208800 Sobic004G208800 Sobic010G073000--Sobic004G208800 Sobic005G053001 Sobic005G053001 Sobic010G073000--Sobic005G053001 Sobic003G186066 Sobic003G186066 Sobic010G073000--Sobic003G186066 Sobic010G229300 Sobic010G229300 Sobic010G192700--Sobic010G229300 Sobic010G192700--Sobic003G186066 Sobic003G120900 Sobic003G120900 Sobic010G192700--Sobic003G120900 Sobic002G153600 Sobic002G153600 Sobic010G192700--Sobic002G153600 Sobic010G192700--Sobic003G348900 Sobic006G232100 Sobic006G232100 Sobic010G192700--Sobic006G232100 Sobic006G112000 Sobic006G112000 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Octagon: transcription factors


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