Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G133500.1,Sobic.010G133500.2
Synonym Sb10g012730
Functional annotation AT hook motif domain containing protein, expressed
UniProt C5Z1R3 , A0A1W0VSW5
Pfam PF03479
Panther DB PTHR31500 PTHR31500:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G33620 : AT hook motif DNA-binding family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g22030.1 : AT hook motif domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a042800
Brachypodium PNT75455 , KQK17177
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G133500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.003G292500 ATP-dependent protease La, putative, expressed K11793: cereblon


Gene co-expression network
sample Sobic010G133500 Sobic010G133500 Sobic007G044201 Sobic007G044201 Sobic010G133500--Sobic007G044201 Sobic001G502300 Sobic001G502300 Sobic010G133500--Sobic001G502300 Sobic001G172050 Sobic001G172050 Sobic010G133500--Sobic001G172050 Sobic002G206600 Sobic002G206600 Sobic010G133500--Sobic002G206600 Sobic003G106900 Sobic003G106900 Sobic010G133500--Sobic003G106900 Sobic003G064600 Sobic003G064600 Sobic010G133500--Sobic003G064600 Sobic001G513000 Sobic001G513000 Sobic010G133500--Sobic001G513000 Sobic010G103000 Sobic010G103000 Sobic010G133500--Sobic010G103000 Sobic005G094001 Sobic005G094001 Sobic010G133500--Sobic005G094001 Sobic007G044201--Sobic002G206600 Sobic001G289000 Sobic001G289000 Sobic007G044201--Sobic001G289000 Sobic007G044201--Sobic001G172050 Sobic007G044201--Sobic001G502300 Sobic007G044201--Sobic010G133500 Sobic007G044201--Sobic003G106900 Sobic003G016700 Sobic003G016700 Sobic007G044201--Sobic003G016700 Sobic006G262001 Sobic006G262001 Sobic007G044201--Sobic006G262001 Sobic002G302400 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Octagon: transcription factors


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