Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G229075.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VUF0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G112300 expressed protein -
2 Sobic.009G141000 KH domain containing protein, putative, expressed K14945: protein quaking
3 Sobic.007G065900 Cupin domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G203100 tropinone reductase 2, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
5 Sobic.002G310500 chalcone synthase, putative, expressed -
6 Sobic.004G023500 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G253000 - -
8 Sobic.010G006100 expressed protein -
9 Sobic.009G099400 peptidase, T1 family, putative, expressed -
10 Sobic.008G157800 BURP domain containing protein, expressed -
11 Sobic.010G113600 vignain precursor, putative, expressed -
12 Sobic.009G139700 - -
13 Sobic.002G368500 B12D protein, putative, expressed -
14 Sobic.007G148000 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
15 Sobic.001G449600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Oxygen binding /transporter (Zm)(PubMedID : 27208977)@Oxygen binding /transporter (Zm)(PubMedID : 27208977)@non-symbiotic hemoglobin 2, putative, expressed -
16 Sobic.003G319700 NADPH-dependent FMN reductase domain containing protein, expressed K03809: NAD(P)H dehydrogenase (quinone)
17 Sobic.004G061701 - -
18 Sobic.009G217700 - -
19 Sobic.008G170100 phospholipase, putative, expressed -
20 Sobic.005G217300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G229075 Sobic010G229075 Sobic003G112300 Sobic003G112300 Sobic010G229075--Sobic003G112300 Sobic009G141000 Sobic009G141000 Sobic010G229075--Sobic009G141000 Sobic007G065900 Sobic007G065900 Sobic010G229075--Sobic007G065900 Sobic005G203100 Sobic005G203100 Sobic010G229075--Sobic005G203100 Sobic002G310500 Sobic002G310500 Sobic010G229075--Sobic002G310500 Sobic004G023500 Sobic004G023500 Sobic010G229075--Sobic004G023500 Sobic001G253000 Sobic001G253000 Sobic010G229075--Sobic001G253000 Sobic010G006100 Sobic010G006100 Sobic010G229075--Sobic010G006100 Sobic009G099400 Sobic009G099400 Sobic010G229075--Sobic009G099400 Sobic003G112300--Sobic007G065900 Sobic008G170100 Sobic008G170100 Sobic003G112300--Sobic008G170100 Sobic008G157800 Sobic008G157800 Sobic003G112300--Sobic008G157800 Sobic003G112300--Sobic010G229075 Sobic003G112300--Sobic009G141000 Sobic009G139700 Sobic009G139700 Sobic003G112300--Sobic009G139700 Sobic003G112300--Sobic004G023500 Sobic004G292001 Sobic004G292001 Sobic003G112300--Sobic004G292001 Sobic010G085500 Sobic010G085500 Sobic003G112300--Sobic010G085500 Sobic010G088700 Sobic010G088700 Sobic009G141000--Sobic010G088700 Sobic003G301600 Sobic003G301600 Sobic009G141000--Sobic003G301600 Sobic005G051500 Sobic005G051500 Sobic009G141000--Sobic005G051500 Sobic003G156200 Sobic003G156200 Sobic009G141000--Sobic003G156200 Sobic009G141000--Sobic003G112300 Sobic003G364000 Sobic003G364000 Sobic009G141000--Sobic003G364000 Sobic005G033900 Sobic005G033900 Sobic009G141000--Sobic005G033900 Sobic010G259500 Sobic010G259500 Sobic009G141000--Sobic010G259500 Sobic005G071100 Sobic005G071100 Sobic009G141000--Sobic005G071100 Sobic007G065900--Sobic008G157800 Sobic007G065900--Sobic004G023500 Sobic010G113600 Sobic010G113600 Sobic007G065900--Sobic010G113600 Sobic004G061701 Sobic004G061701 Sobic007G065900--Sobic004G061701 Sobic007G065900--Sobic004G292001 Sobic007G065900--Sobic008G170100 Sobic007G065900--Sobic003G112300 Sobic008G039501 Sobic008G039501 Sobic007G065900--Sobic008G039501 Sobic007G065800 Sobic007G065800 Sobic007G065900--Sobic007G065800 Sobic005G203100--Sobic009G139700 Sobic007G148000 Sobic007G148000 Sobic005G203100--Sobic007G148000 Sobic004G333150 Sobic004G333150 Sobic005G203100--Sobic004G333150 Sobic003G088500 Sobic003G088500 Sobic005G203100--Sobic003G088500 Sobic003G087300 Sobic003G087300 Sobic005G203100--Sobic003G087300 Sobic001G503100 Sobic001G503100 Sobic005G203100--Sobic001G503100 Sobic010G052700 Sobic010G052700 Sobic005G203100--Sobic010G052700 Sobic007G005700 Sobic007G005700 Sobic005G203100--Sobic007G005700 Sobic002G125700 Sobic002G125700 Sobic005G203100--Sobic002G125700 Sobic002G310500--Sobic007G148000 Sobic009G108300 Sobic009G108300 Sobic002G310500--Sobic009G108300 Sobic003G426100 Sobic003G426100 Sobic002G310500--Sobic003G426100 Sobic004G180301 Sobic004G180301 Sobic002G310500--Sobic004G180301 Sobic002G310500--Sobic010G113600 Sobic001G478200 Sobic001G478200 Sobic002G310500--Sobic001G478200 Sobic008G082200 Sobic008G082200 Sobic002G310500--Sobic008G082200 Sobic004G304300 Sobic004G304300 Sobic002G310500--Sobic004G304300 Sobic002G310500--Sobic005G203100 Sobic004G023500--Sobic004G061701 Sobic004G023500--Sobic008G157800 Sobic004G023500--Sobic009G099400 Sobic004G023500--Sobic007G065900 Sobic003G344050 Sobic003G344050 Sobic004G023500--Sobic003G344050 Sobic002G150100 Sobic002G150100 Sobic004G023500--Sobic002G150100 Sobic002G220800 Sobic002G220800 Sobic004G023500--Sobic002G220800 Sobic001G253000--Sobic009G099400 Sobic002G195500 Sobic002G195500 Sobic001G253000--Sobic002G195500 Sobic001G253000--Sobic004G061701 Sobic007G108200 Sobic007G108200 Sobic001G253000--Sobic007G108200 Sobic001G253000--Sobic004G023500 Sobic001G253000--Sobic003G344050 Sobic001G253000--Sobic002G150100 Sobic010G006100--Sobic007G148000 Sobic010G006100--Sobic005G203100 Sobic003G176350 Sobic003G176350 Sobic010G006100--Sobic003G176350 Sobic010G006100--Sobic002G310500 Sobic010G006100--Sobic003G426100 Sobic009G016300 Sobic009G016300 Sobic010G006100--Sobic009G016300 Sobic007G135201 Sobic007G135201 Sobic010G006100--Sobic007G135201 Sobic007G066932 Sobic007G066932 Sobic010G006100--Sobic007G066932 Sobic003G255500 Sobic003G255500 Sobic010G006100--Sobic003G255500 Sobic009G099400--Sobic004G023500 Sobic009G099400--Sobic002G150100 Sobic009G099400--Sobic003G344050 Sobic009G099400--Sobic007G108200 Sobic009G099400--Sobic002G220800 Sobic009G099400--Sobic004G061701 Sobic003G249050 Sobic003G249050 Sobic009G099400--Sobic003G249050
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.