Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G236800.1
Synonym Sb10g027840
Functional annotation protein kinase family protein, putative, expressed
UniProt C5Z8B1
Pfam PF00069
Panther DB PTHR24056 PTHR24056:SF221
NCBI CDD KOG0659; Cdk activating kinase (CAK)/RNA polymerase II transcription initiation/nucleotide excision repair factor TFIIH/TFIIK, kinase subunit CDK7
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G53050 : Protein kinase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g47180.1 : transposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018187 , Zm00025a005127
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G046160.15 , HORVU6Hr1G046160.14 , HORVU6Hr1G046160.17 , HORVU6Hr1G046160.16 , HORVU6Hr1G046160.11 , HORVU6Hr1G046160.10 , HORVU6Hr1G046160.13 , HORVU6Hr1G046160.12 , HORVU6Hr1G046160.19 , HORVU6Hr1G046160.18 , HORVU6Hr1G046160.1 , HORVU6Hr1G046160.3 , HORVU6Hr1G046160.2 , HORVU6Hr1G046160.5 , HORVU6Hr1G046160.4 , HORVU6Hr1G046160.7 , HORVU6Hr1G046160.6 , HORVU6Hr1G046160.9 , HORVU6Hr1G046160.8 , HORVU6Hr1G046160.20 , HORVU6Hr1G046160.21
Wheat TraesCS6D02G184000 , TraesCS6D02G184000 , TraesCS6B02G231200 , TraesCS6B02G231200 , TraesCS6B02G231200 , TraesCS7D02G435700 , TraesCS7B02G345800 , TraesCS6A02G192900 , TraesCS6A02G192900
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FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic010G236800 Sobic010G236800 Sobic009G188750 Sobic009G188750 Sobic010G236800--Sobic009G188750 Sobic010G011001 Sobic010G011001 Sobic010G236800--Sobic010G011001 Sobic009G011000 Sobic009G011000 Sobic010G236800--Sobic009G011000 Sobic001G506066 Sobic001G506066 Sobic010G236800--Sobic001G506066 Sobic009G011100 Sobic009G011100 Sobic010G236800--Sobic009G011100 Sobic009G011200 Sobic009G011200 Sobic010G236800--Sobic009G011200 Sobic001G452600 Sobic001G452600 Sobic010G236800--Sobic001G452600 Sobic003G053750 Sobic003G053750 Sobic010G236800--Sobic003G053750 Sobic006G185700 Sobic006G185700 Sobic010G236800--Sobic006G185700 Sobic009G024133 Sobic009G024133 Sobic009G188750--Sobic009G024133 Sobic009G188750--Sobic010G011001 Sobic009G188750--Sobic006G185700 Sobic009G020800 Sobic009G020800 Sobic009G188750--Sobic009G020800 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic009G188750--Sobic008G096300 Sobic007G136400 Sobic007G136400 Sobic009G188750--Sobic007G136400 Sobic009G144050 Sobic009G144050 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Octagon: transcription factors


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