Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G150000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5WQH2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.001G150000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G336800 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G172700 PPR repeat containing protein, expressed K17964: leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial
3 Sobic.009G005100 - -
4 Sobic.001G081000 nucleotide-binding protein-like, putative, expressed K03593: mrp, ATP-binding protein involved in chromosome partitioning
5 Sobic.009G007800 TruB family pseudouridylate synthase, putative, expressed K03177: truB, PUS4, tRNA pseudouridine55 synthase
6 Sobic.003G153000 galactosyltransferase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.009G050900 heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase, putative, expressed K10532: heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase
8 Sobic.001G022500 tRNA synthetases class II domain containing protein, expressed K04567: KARS, lysyl-tRNA synthetase, class II
9 Sobic.009G103600 MEE12, putative, expressed -
10 Sobic.010G051700 DNA topoisomerase I family protein, expressed -
11 Sobic.004G171200 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K13124: mitogen-activated protein kinase organizer 1
12 Sobic.007G171100 peptidylprolyl isomerase domain and WD repeat-containing protein 1, putative, expressed K12736: peptidylprolyl isomerase domain and WD repeat-containing protein 1
13 Sobic.009G178300 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing protein, expressed -
14 Sobic.006G049600 methyltransferase domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G149901 - -
16 Sobic.009G132700 - -
17 Sobic.008G166300 RING finger protein 13, putative, expressed K15692: RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13
18 Sobic.002G164800 SET domain containing protein, expressed K11423: [histone H3]-dimethyl-L-lysine36 N-methyltransferase
19 Sobic.003G141500 CGMC_GSK.3 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed K03083: glycogen synthase kinase 3 beta
20 Sobic.004G157600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G150000 Sobic001G150000 Sobic002G336800 Sobic002G336800 Sobic001G150000--Sobic002G336800 Sobic001G172700 Sobic001G172700 Sobic001G150000--Sobic001G172700 Sobic009G005100 Sobic009G005100 Sobic001G150000--Sobic009G005100 Sobic001G081000 Sobic001G081000 Sobic001G150000--Sobic001G081000 Sobic009G007800 Sobic009G007800 Sobic001G150000--Sobic009G007800 Sobic003G153000 Sobic003G153000 Sobic001G150000--Sobic003G153000 Sobic009G050900 Sobic009G050900 Sobic001G150000--Sobic009G050900 Sobic001G022500 Sobic001G022500 Sobic001G150000--Sobic001G022500 Sobic009G103600 Sobic009G103600 Sobic001G150000--Sobic009G103600 Sobic005G079025 Sobic005G079025 Sobic002G336800--Sobic005G079025 Sobic008G011100 Sobic008G011100 Sobic002G336800--Sobic008G011100 Sobic004G087600 Sobic004G087600 Sobic002G336800--Sobic004G087600 Sobic003G144950 Sobic003G144950 Sobic002G336800--Sobic003G144950 Sobic006G078600 Sobic006G078600 Sobic002G336800--Sobic006G078600 Sobic002G336800--Sobic009G005100 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Octagon: transcription factors


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